tead3b (tead3,LOC103355928,LOC108231638,LOC102786312)


Basic Information

Item Value
gene id tead3b
gene name tead3,LOC103355928,LOC108231638,LOC102786312
gene type coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053115.1
NCBI id CM020912.1
chromosome length 44863486
location 25938311 ~ 25972929 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

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Function

symbol description
tead3 Enables DNA-binding transcription factor activity and RNA polymerase II-specific DNA-binding transcription factor binding activity. Involved in asymmetric neuroblast division and hippo signaling. Predicted to be located in nucleoplasm. Predicted to be part of chromatin and transcription regulator complex.

NR:

description
PREDICTED: transcriptional enhancer factor TEF-5-like isoform X3

GO: NA

KEGG:

id description
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RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_039797533.1 False 3882 mRNA 0.43 15 25938312 25972929
XM_039797534.1 False 3838 mRNA 0.43 15 25938311 25972929
XM_039797535.1 False 3831 mRNA 0.43 15 25938312 25972929
XM_039797536.1 False 3831 mRNA 0.43 15 25938312 25972929
XM_039797537.1 False 3819 mRNA 0.43 14 25938312 25972929
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XM_039797539.1 False 3762 mRNA 0.43 13 25938312 25972929

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC120558086 LOC104941373 coding upstream 55230 25878956 ~ 25883081 (+)
LOC120558084 kcna2,LOC104918376,LOC107385044,LOC101171484 coding upstream 86151 25844464 ~ 25852160 (+)
LOC120558083 LOC103356159,LOC100696388,LOC101468283 coding upstream 106401 25830111 ~ 25831910 (+)
slc25a55a LOC104918372,LOC102313117,LOC102207676,LOC102783067,LOC100695863 coding upstream 209929 25722791 ~ 25728382 (+)
smpd2b smpd2,LOC102787414 coding downstream 1096 25974025 ~ 25984043 (+)
pkp1b NA coding downstream 12221 25985150 ~ 25997555 (+)
nav1b nav1,LOC103355819 coding downstream 60822 26033751 ~ 26114173 (+)
mybphb LOC103464713,LOC107089157 coding downstream 141925 26114854 ~ 26124738 (+)
LOC120557651 LOC107089162,LOC104944127,LOC103355802 coding downstream 156665 26129594 ~ 26170085 (+)
LOC120557323 NA non-coding upstream 15248 25921754 ~ 25923063 (+)
G41694 rplp2,LOC104941383,LOC104918380 non-coding upstream 50578 25885222 ~ 25887733 (+)
G41630 NA non-coding upstream 391471 25546509 ~ 25546840 (+)
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LOC120558141 NA non-coding upstream 437340 25499083 ~ 25500971 (+)
G41746 LOC103355883,LOC106954216,LOC104941313 non-coding downstream 28552 26001481 ~ 26002751 (+)
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LOC120557409 NA non-coding downstream 249148 26222077 ~ 26252094 (+)
G41827 LOC106518302,LOC101482215,LOC102196619,LOC102290668 non-coding downstream 302193 26275122 ~ 26275929 (+)
G41834 LOC104955002 non-coding downstream 351876 26324805 ~ 26338204 (+)
LOC120558088 LOC104941431 other upstream 30573 25904769 ~ 25907738 (+)
LOC120558082 kcna10,LOC104941363 other upstream 65392 25767092 ~ 25872919 (+)
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slc12a5a LOC103355988 other upstream 627758 25208156 ~ 25310553 (+)
bloc1s1 bloc1s1,LOC102796612 other upstream 1377993 24555525 ~ 24560318 (+)
G41825 NA other downstream 295673 26268602 ~ 26273315 (+)
G41850 rps10,LOC102793608 other downstream 569578 26542507 ~ 26548799 (+)
anks1ab tcp11,LOC103355682,LOC103134623,LOC101477444,LOC102192099,LOC103464730,LOC107089148,LOC106918244 other downstream 679922 26652851 ~ 26764737 (+)
ephb2b LOC104917933,LOC103376520 other downstream 1698034 27670963 ~ 27823260 (+)
G42449 NA other downstream 3267484 29240413 ~ 29242253 (+)

Expression


Co-expression Network