patz1 (patz1)



Basic Information


Item Value
gene id patz1
gene name patz1
gene type coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_053115.1
NCBI id CM020912.1
chromosome length 44863486
location 18565901 ~ 18579863 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence


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TCATATACACAgtctataaatatatatataaatatatatgagcCAACCAATATGATCAGTGATTGTCAATGGTGGTCCTGTACatatatttgcttgtttttttcctcGTCCATCATAGTGGAGAGATCTTAAGTTATGGCCATTTGATTGAAAGTGTAAACTGCATGTTCTGGCATGCGAGCTGGGGACTGAATGTCGATCACTGGTCGGGGGCAGTAACAGTTTAACTGTTCACCGTAATGTCACTCTGCTCTGGTAGCGCTCACACTGCCAGCTGCAAGACTCGCATCTTTGACcaagttatgttttatttttttctccttttttttttttttttgatccaCTCTGCACTAGTATTTACTCCTTAAAAGGTGACAAGGGTTGTTTTTGAAATTGCTTATTTGAAAACAAGTGGAAGATGCTGTAAGGAAATGATGTTcctttgtttgtgttcttcactgggaagtatttttttttttttttcactcgtGTTGGTACTCAAGTGTGCAAGGTGTTTTCGTTAAGTATTTTAGGCCTAAATGTTTTTGCTTTCTGCTTTTGGTCTGTTGCAAAGTGCCTTCAAAAAATACTGATTGTGCACAGcagtggattaaaaaaaaaaaaaagtcctcttTTC

Function


symbol description
patz1 Predicted to enable DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific and RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding activity. Predicted to be involved in regulation of transcription by RNA polymerase II. Predicted to be active in nucleoplasm. Orthologous to human PATZ1 (POZ/BTB and AT hook containing zinc finger 1).

NR:

description
TC1-like transposase

GO:

id name namespace
GO:0046872 metal ion binding molecular_function
GO:0003677 DNA binding molecular_function

KEGG:

id description
K24383 PATZ1; POZ-AT hook zinc finger protein 1

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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Expression



Co-expression Network