ankrd52b (ankrd52,LOC103359366)


Basic Information

Item Value
gene id ankrd52b
gene name ankrd52,LOC103359366
gene type coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053115.1
NCBI id CM020912.1
chromosome length 44863486
location 14416436 ~ 14435022 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>XM_039798650.1
GGTGTAACCTGGGTGTAACACATCACATATCAGCTAACTAAGCTAAAGCTAGGCTAACTAGCTGCTACAGAGTGACATGTAGTCAACTTTACACTCAGTCTCAATAAAGGAGCTTCCTGAGTGATTGGGACATGGAGTTAAGAAATATCAAGGACCAGtctcCATTGGTCCAGGCTATATTCAGCCGGAACGCAGAAGAagtgacatttttgttgaaCCATAATGAAGATGTCAATTCACTGgACCAAGTACAAAGCACACCCCTTCATGCTGCTGCTTATTTGGGTGATGTCCACACTATGGACCTACTTATTACTTCAgGTGCAAATGTCAACGCTAAGGACCAGTGTTTGCTGACTCCTTTACATCGAGCAGCTGCCTCTCGAAATGAAAAAGCTGTGGGGTTACTACTAAAGCACAGAGCGGAGGTCAACACACAGGACAAGTACTTGCATACACCTTTACACATGGCAGCTGCGAAGTGGGCCATAGGCTGCGCTCAAGCTCTGATACCACATGTGTGCGGCCTGGATGTTGCCGACAGGTCAGGAAGGACACCACTGCATCATGCAGCGCACAGCGGCCATGAAGAGTTGGTGAACTTGCTCCTGAGCAAAGGTGCCAATGTGAGTGCCAAAGATAAGAAGGAAAGGCAGGCAATCCACTGGGCTGCATACATTGGCCATGTGGAGGTTGTGAAGCTGCTGGTGTCTCACGGTGCTGATGTGATGTGCAAGGACAAATGTGGTTACACTCCGCTCCACGCTGCAGCTGCCAGTGGACAGTTAGACGTGGTCAAATATCTATTGAGACTGGTGGTGGAGACTGATGAACCTAACGTTTTTGGGAACACAGCGCTCCACATGGCCTGTCACACGGGGCAGGACGCTGTGGCCACTGAACTGGTGAACTGTGGTGCCAACATCAATCAGCCCAACCACAACGGCAGCACGCCGCTGCATCTGTCTGCCGCCTCCTCCAGCGGGGTGCTGTGTCTCGAGCTGCTAATCAACAATGGTGCTGATGTCAACGTGCAGAATAAAGAAGGAAAGAGCCCTCTGCATATGGCTTCTATGCACGGGCGGTTCACGGGCTCCCAGATTCTGATCCAAAATGGCGGGGAGATTGACTGTGCTGATATGTTTGGAAACACGCCTCTTCATGTTGCTGCCAGATATGGTCAGGAGTTGCTGGTCAGCACTCTTCTGACAAACGGTGCTGATAAGACCAGACAGGGGATTCATGGGATGCTTCCACTGCATTTGGCGGTGCTCTACGGATTTCCAGACTGTTGTCGAAAGTTACTGTCCAATGGCCATTTTTACATCATGCCGTCTCAAGTGCCGTCAACTGGGGATGATATAAACTTCTTAGACGACCACGGAAGGACTTGCCTGCATGCAGCTGCTTCTGGAggAAATGTTGACTGTCTGAACTTGCTGTTAAATAGTGCTGCTGCTGAACTGGATGTAAAAGATCATTTGGGAAGATCTCCTTTGCACTATGCTGCAGCTAACGGTAACAGCCAATGCACCATCTCCCTGGTGAGAGCCGGCGCGGAGGTCAATGAGCTGGATCTGACGGGTTGCAGCCCTCTGCACTAcgctgctgcttcacacaccTTTTGTGGAGAGGAAACGAACTCTGAGCCTGACCACAGTGAGGGAAAGGAACAAGAAGCCTCTCTgtgtttaGACTTCTTGCTTGACAGTGGGGCGAACCCAACTCTGAAGAACAGTAACGGTTACAGTGCCGTCCACTATGCAGCAGCTTACGGCAACAAACAGCATCTGGAACTGCTCCTGGAGATTTCGTTCAACTGTCTAGAAGAGGTTGAAAGTAATATTCCAGTCAGTCCTTTGCACTTAGCTGCGTATTATGGTCACCGTGAGGCACTGCGGTTGCTTTGTGAGACATTGGTGAGTCTGGATGTGCGGGACATTGAAGGCAGAACTGCCCTCCACCTGGCTGCTCGGAGAGGTTTTGCCCCATGTGTGGAGGTGCTGCTGAAGCATCAAGCCTCTTACACACTGAAGGAGCACAAGCGCAAGTGGACGGCTCTCCatgctgcagCTGCTGAGGGCCAAATGGACTGTCTGCTTTTATTGGTCAACGGGGAACAAAGTGCTGACATCATCGACAGTCCAGATACACAGGGACAGACGGCTCTCATGCTGGCAGCTTTGGGACGGCACACCGATTGCGTCCACATCCTGTTGGAGAAAGGAGCAAAGGCTGATGCTGCAGACAAAAAGGGCTTTACTGCATTACACAGAGCTGCCATGTTGGGCAGTGAGGACTGTGTATCTGCTCTGTTGGAACATGGGGCCTCTGCTCTGTGTAGAGACTCTCAGGGAAGGACCCCGCTGCACCTTGTAGCGTCCCGCGGCCACACGGAGCTACTTCGAACTTTGCTAAAAGCTGCTACGAAAGCTGACCCTCTGGACTCCATATTGGACTACAGAGGCTACACTCCCGCCCACTGGGCTGCCCACCACGGGCGTGAAGGATGTTTACACATTTTACTTGAAAACAATCTTTTTAGCAACCAGGAGGGAAATCTCTTCACCGCATTGCACTGTGCTCTAGTTAATGGACATGATGTTGCTGCTGGACTTCTAGTGAAGACTGTTGGCCCTCAAATTGTTAACGTTAGCGATGCCAAAGGAAGgaccCCGCTGCATGCTGCTGCTTATTCAGGAAATGTTGCTGGGCTCCAGCTGGTCCTGGCCCAGGGAGCTGAAGTCAATGCTGTGGATCATTGTGGATGCTCTGCTGTGATGGTTGCTGCTGCCTGCGGGCAGACTATGGCTGTTGaattcTTGCTGCACAAAGCGAAGCCAGACCTGACCCTGGTGGATGTCAATAATAACACTGCCCTTCACTTAGCCTGCATTAAgGGTCATGAGATGTGTGCCCTGTTGATCCTTGGAGAGATCAGCGACTCCTCCCTCATAAATGCAACAAACAGCGCTCTCCAAATGCCCCTTCACATTGCAGCAAGGAAAGGCCTGGCGACTGTAGTGCAGGTGTTATTGAGCAGAGGAGCAGCAGTCATGGCTGTAGATGAGGAAGGCCACACGCCGGCTCTGGCCTGTGCCCCAAACAAGAACGTGGCAGACTGTCTGGCCCTGATCCTCTCCACCATGAAGCCTTTCTCACCGAGAGAGGCCGGCGCCGGTACAGCCTCTCACTTCAACCCCATCCTGAAGAACTGCGGCATTGCTGCCACCTGTGGGTCCAGCAGTAACTTGTGCCACGCCTAAGTCAAGGTGCCACACAGGTGTTTGATGGAGTGAAATGTCATCACAGTGTTGCCACGATACTGGAATTTTTGACTTTGATACAATACTTGAGATTCAATACCATTTTCGAAACCACAGGGAAAAATTGACACAACATTGAAGGCATAAAATCTTAGATTTTTATTAAACCGTCATGTGCTTTTGCTAAATTTGTAGTGTTGGCACCTTTTCGTTAGCACTGCTCTGTAGCATGGCTTACATATTGGCTTGCATATGGGCTTGCTTGTATCCTTTGCCTCAAACGCAAAGTATTTCGAAACAGCACTCCTTCTGTTTTCTATGTCAACTAAAACCAGTTGCAGAAGCTCTGCACTTGCCATCTTTAATGAGccaacacaataacaaaaccTGCAAGTTATTCTATTCAACCGGAGCGAATGaggcgtgtgcgtgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagaacttGCTgttggagagaagagagagtatCGGTAGTGTGGAAAATGAGTGTTGAAACCGTTTCAAATATTCTGAATCAATTATGTATCAAAAAATCCATCTATCCCGGTCTAGTCCAAAGTCTCCATGCATAACCACGTGCACACATAAGTTTCCAGAAACATGTATGGTCATGACATTTATACTTGTGTCATATGCAGCTGAATGCACACTATGCTCATGCACCAGTAGCATCGATTGCTTCTCTAAAGTCTAGTCTTACACATTAGTAATATTAGCAGACCTCTTAGATGATCTTCTCTGTCACACAAGTGGAGTTCAGCACAAGTAGAGTTATTTTAATGAAGTACTAACCATTAGAAATGAGAAGAAGTTTTAACATGCGCACGCTACACAAGGCTCTTCACTTGAACCCCATCAGCTGTCAGTATTGGCTTATTTTCTCGTTAACTACCAAAGCCTGAAATCTCCATGTTTGTCTTCAGCTGATACAAGTGCAAGAAGACTCGGATGaatatgtgtttgttttgtgtctgcAAGCGCTGTTTTGCATATTAGACATTGCTTCTTAATATACttgtttaaaaatatctaaCAGGTGCTTTAAACCTTTTATGCAATTAATAAGACTCTATTTTTCTATCCTGTCCAGAGTGTAGCAGACTGTACACTGATATAAATAACCTTATTATTCTAATATTATCATGATTTACATAAATTACATTTCAGTTTAGTAAGGTCACAAGCATGTGTATAGTAGTAATATAGTTTACCAAGTCTAGTGTATATATAGttcttaaaatgaagttaacCTTATACTTGTATTATCTTGAATATCCCAAATTATTGAGAATTAACCTCAGGTCACTACGTACTGTACTGTGGGTGCAATAAAAAGCACATTTTGAGCTTGATGTTGTGTTACAAATGTATGACAGAAGTTACAGATTTCAGTTAAATAAGCCAgagaataaaacaaacaaatgaaaggtcaaagaaagaaataaatgtGCGTTAATATGAACCGTTTTAAAGCACAGGGAAAAAATAATCTGTCTCTGAGCGTTAAGCGTAAAAGTATTTTGCAAATTTGTAATAAACTATGTCAGCAATTTAAGATGCATTTAATTTTTGATTGATAggttgattctttttttttttttttttaacataaatgaATAAGTGCACATTGCAAGTTCCAAGAGCCGAAGGTGacgtttttaaattgttgtttTCCAGCAGCGtcaaacccaaagatatttaattgAAACTgtcagac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>XM_039798651.1
ATATCCATGCTCTAACCATCTCAATCAacgttattatattattgatgcattaatgctctcCATTGGTCCAGGCTATATTCAGCCGGAACGCAGAAGAagtgacatttttgttgaaCCATAATGAAGATGTCAATTCACTGgACCAAGTACAAAGCACACCCCTTCATGCTGCTGCTTATTTGGGTGATGTCCACACTATGGACCTACTTATTACTTCAgGTGCAAATGTCAACGCTAAGGACCAGTGTTTGCTGACTCCTTTACATCGAGCAGCTGCCTCTCGAAATGAAAAAGCTGTGGGGTTACTACTAAAGCACAGAGCGGAGGTCAACACACAGGACAAGTACTTGCATACACCTTTACACATGGCAGCTGCGAAGTGGGCCATAGGCTGCGCTCAAGCTCTGATACCACATGTGTGCGGCCTGGATGTTGCCGACAGGTCAGGAAGGACACCACTGCATCATGCAGCGCACAGCGGCCATGAAGAGTTGGTGAACTTGCTCCTGAGCAAAGGTGCCAATGTGAGTGCCAAAGATAAGAAGGAAAGGCAGGCAATCCACTGGGCTGCATACATTGGCCATGTGGAGGTTGTGAAGCTGCTGGTGTCTCACGGTGCTGATGTGATGTGCAAGGACAAATGTGGTTACACTCCGCTCCACGCTGCAGCTGCCAGTGGACAGTTAGACGTGGTCAAATATCTATTGAGACTGGTGGTGGAGACTGATGAACCTAACGTTTTTGGGAACACAGCGCTCCACATGGCCTGTCACACGGGGCAGGACGCTGTGGCCACTGAACTGGTGAACTGTGGTGCCAACATCAATCAGCCCAACCACAACGGCAGCACGCCGCTGCATCTGTCTGCCGCCTCCTCCAGCGGGGTGCTGTGTCTCGAGCTGCTAATCAACAATGGTGCTGATGTCAACGTGCAGAATAAAGAAGGAAAGAGCCCTCTGCATATGGCTTCTATGCACGGGCGGTTCACGGGCTCCCAGATTCTGATCCAAAATGGCGGGGAGATTGACTGTGCTGATATGTTTGGAAACACGCCTCTTCATGTTGCTGCCAGATATGGTCAGGAGTTGCTGGTCAGCACTCTTCTGACAAACGGTGCTGATAAGACCAGACAGGGGATTCATGGGATGCTTCCACTGCATTTGGCGGTGCTCTACGGATTTCCAGACTGTTGTCGAAAGTTACTGTCCAATGGCCATTTTTACATCATGCCGTCTCAAGTGCCGTCAACTGGGGATGATATAAACTTCTTAGACGACCACGGAAGGACTTGCCTGCATGCAGCTGCTTCTGGAggAAATGTTGACTGTCTGAACTTGCTGTTAAATAGTGCTGCTGCTGAACTGGATGTAAAAGATCATTTGGGAAGATCTCCTTTGCACTATGCTGCAGCTAACGGTAACAGCCAATGCACCATCTCCCTGGTGAGAGCCGGCGCGGAGGTCAATGAGCTGGATCTGACGGGTTGCAGCCCTCTGCACTAcgctgctgcttcacacaccTTTTGTGGAGAGGAAACGAACTCTGAGCCTGACCACAGTGAGGGAAAGGAACAAGAAGCCTCTCTgtgtttaGACTTCTTGCTTGACAGTGGGGCGAACCCAACTCTGAAGAACAGTAACGGTTACAGTGCCGTCCACTATGCAGCAGCTTACGGCAACAAACAGCATCTGGAACTGCTCCTGGAGATTTCGTTCAACTGTCTAGAAGAGGTTGAAAGTAATATTCCAGTCAGTCCTTTGCACTTAGCTGCGTATTATGGTCACCGTGAGGCACTGCGGTTGCTTTGTGAGACATTGGTGAGTCTGGATGTGCGGGACATTGAAGGCAGAACTGCCCTCCACCTGGCTGCTCGGAGAGGTTTTGCCCCATGTGTGGAGGTGCTGCTGAAGCATCAAGCCTCTTACACACTGAAGGAGCACAAGCGCAAGTGGACGGCTCTCCatgctgcagCTGCTGAGGGCCAAATGGACTGTCTGCTTTTATTGGTCAACGGGGAACAAAGTGCTGACATCATCGACAGTCCAGATACACAGGGACAGACGGCTCTCATGCTGGCAGCTTTGGGACGGCACACCGATTGCGTCCACATCCTGTTGGAGAAAGGAGCAAAGGCTGATGCTGCAGACAAAAAGGGCTTTACTGCATTACACAGAGCTGCCATGTTGGGCAGTGAGGACTGTGTATCTGCTCTGTTGGAACATGGGGCCTCTGCTCTGTGTAGAGACTCTCAGGGAAGGACCCCGCTGCACCTTGTAGCGTCCCGCGGCCACACGGAGCTACTTCGAACTTTGCTAAAAGCTGCTACGAAAGCTGACCCTCTGGACTCCATATTGGACTACAGAGGCTACACTCCCGCCCACTGGGCTGCCCACCACGGGCGTGAAGGATGTTTACACATTTTACTTGAAAACAATCTTTTTAGCAACCAGGAGGGAAATCTCTTCACCGCATTGCACTGTGCTCTAGTTAATGGACATGATGTTGCTGCTGGACTTCTAGTGAAGACTGTTGGCCCTCAAATTGTTAACGTTAGCGATGCCAAAGGAAGgaccCCGCTGCATGCTGCTGCTTATTCAGGAAATGTTGCTGGGCTCCAGCTGGTCCTGGCCCAGGGAGCTGAAGTCAATGCTGTGGATCATTGTGGATGCTCTGCTGTGATGGTTGCTGCTGCCTGCGGGCAGACTATGGCTGTTGaattcTTGCTGCACAAAGCGAAGCCAGACCTGACCCTGGTGGATGTCAATAATAACACTGCCCTTCACTTAGCCTGCATTAAgGGTCATGAGATGTGTGCCCTGTTGATCCTTGGAGAGATCAGCGACTCCTCCCTCATAAATGCAACAAACAGCGCTCTCCAAATGCCCCTTCACATTGCAGCAAGGAAAGGCCTGGCGACTGTAGTGCAGGTGTTATTGAGCAGAGGAGCAGCAGTCATGGCTGTAGATGAGGAAGGCCACACGCCGGCTCTGGCCTGTGCCCCAAACAAGAACGTGGCAGACTGTCTGGCCCTGATCCTCTCCACCATGAAGCCTTTCTCACCGAGAGAGGCCGGCGCCGGTACAGCCTCTCACTTCAACCCCATCCTGAAGAACTGCGGCATTGCTGCCACCTGTGGGTCCAGCAGTAACTTGTGCCACGCCTAAGTCAAGGTGCCACACAGGTGTTTGATGGAGTGAAATGTCATCACAGTGTTGCCACGATACTGGAATTTTTGACTTTGATACAATACTTGAGATTCAATACCATTTTCGAAACCACAGGGAAAAATTGACACAACATTGAAGGCATAAAATCTTAGATTTTTATTAAACCGTCATGTGCTTTTGCTAAATTTGTAGTGTTGGCACCTTTTCGTTAGCACTGCTCTGTAGCATGGCTTACATATTGGCTTGCATATGGGCTTGCTTGTATCCTTTGCCTCAAACGCAAAGTATTTCGAAACAGCACTCCTTCTGTTTTCTATGTCAACTAAAACCAGTTGCAGAAGCTCTGCACTTGCCATCTTTAATGAGccaacacaataacaaaaccTGCAAGTTATTCTATTCAACCGGAGCGAATGaggcgtgtgcgtgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagaacttGCTgttggagagaagagagagtatCGGTAGTGTGGAAAATGAGTGTTGAAACCGTTTCAAATATTCTGAATCAATTATGTATCAAAAAATCCATCTATCCCGGTCTAGTCCAAAGTCTCCATGCATAACCACGTGCACACATAAGTTTCCAGAAACATGTATGGTCATGACATTTATACTTGTGTCATATGCAGCTGAATGCACACTATGCTCATGCACCAGTAGCATCGATTGCTTCTCTAAAGTCTAGTCTTACACATTAGTAATATTAGCAGACCTCTTAGATGATCTTCTCTGTCACACAAGTGGAGTTCAGCACAAGTAGAGTTATTTTAATGAAGTACTAACCATTAGAAATGAGAAGAAGTTTTAACATGCGCACGCTACACAAGGCTCTTCACTTGAACCCCATCAGCTGTCAGTATTGGCTTATTTTCTCGTTAACTACCAAAGCCTGAAATCTCCATGTTTGTCTTCAGCTGATACAAGTGCAAGAAGACTCGGATGaatatgtgtttgttttgtgtctgcAAGCGCTGTTTTGCATATTAGACATTGCTTCTTAATATACttgtttaaaaatatctaaCAGGTGCTTTAAACCTTTTATGCAATTAATAAGACTCTATTTTTCTATCCTGTCCAGAGTGTAGCAGACTGTACACTGATATAAATAACCTTATTATTCTAATATTATCATGATTTACATAAATTACATTTCAGTTTAGTAAGGTCACAAGCATGTGTATAGTAGTAATATAGTTTACCAAGTCTAGTGTATATATAGttcttaaaatgaagttaacCTTATACTTGTATTATCTTGAATATCCCAAATTATTGAGAATTAACCTCAGGTCACTACGTACTGTACTGTGGGTGCAATAAAAAGCACATTTTGAGCTTGATGTTGTGTTACAAATGTATGACAGAAGTTACAGATTTCAGTTAAATAAGCCAgagaataaaacaaacaaatgaaaggtcaaagaaagaaataaatgtGCGTTAATATGAACCGTTTTAAAGCACAGGGAAAAAATAATCTGTCTCTGAGCGTTAAGCGTAAAAGTATTTTGCAAATTTGTAATAAACTATGTCAGCAATTTAAGATGCATTTAATTTTTGATTGATAggttgattctttttttttttttttttaacataaatgaATAAGTGCACATTGCAAGTTCCAAGAGCCGAAGGTGacgtttttaaattgttgtttTCCAGCAGCGtcaaacccaaagatatttaattgAAACTgtcagacaaagaaaagcagaaaatcccTCACGTTTAAGAAGCTGGCACCAGAAAATGtctggcatttttgcttgacgAATTAGTAAAATGTTAATTATCAAATGGTCAA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Function

symbol description
ankrd52 Orthologous to human ANKRD52 (ankyrin repeat domain 52).

NR:

description
PREDICTED: serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit C isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_039798650.1 True 6208 mRNA 0.44 28 14417089 14435022
XM_039798651.1 False 6106 mRNA 0.44 28 14416436 14435022

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
si:ch211-159e12.5 NA coding upstream 70831 14339648 ~ 14345605 (+)
stx16 stx16,LOC102781320 coding upstream 82741 14324934 ~ 14333695 (+)
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LOC120557947 LOC104954762 coding upstream 167989 14242426 ~ 14248447 (+)
npepl1 npepl1 coding downstream 619 14435641 ~ 14443805 (+)
ctsz ctsz coding downstream 17172 14452194 ~ 14455976 (+)
si:ch1073-456m8.1 LOC102799563 coding downstream 139111 14574133 ~ 14583735 (+)
olfml3b olfml3 coding downstream 164001 14599023 ~ 14602910 (+)
pmela pmel,LOC103359383,LOC103375503 coding downstream 184495 14619517 ~ 14626326 (+)
G38276 NA non-coding upstream 107995 14305760 ~ 14308441 (+)
G38274 NA non-coding upstream 122279 14293933 ~ 14294157 (+)
G38247 NA non-coding upstream 221019 14193103 ~ 14195417 (+)
G38206 NA non-coding upstream 370877 14045357 ~ 14045559 (+)
G38164 NA non-coding upstream 413249 14002962 ~ 14003187 (+)
G38317 kdm5b,LOC108235655 non-coding downstream 29952 14464974 ~ 14466684 (+)
G38331 NA non-coding downstream 57881 14492903 ~ 14494740 (+)
G38441 cdk2 non-coding downstream 172817 14607839 ~ 14610422 (+)
G38449 NA non-coding downstream 207910 14642932 ~ 14690625 (+)
G38496 NA non-coding downstream 275704 14710726 ~ 14712134 (+)
LOC120557952 mettl21b other upstream 78676 14335160 ~ 14337760 (+)
LOC120557956 nrn1,LOC104931831,LOC102785075,LOC100692329,LOC102195708,LOC102307414 other upstream 182899 14227097 ~ 14233537 (+)
tfeb tfeb other upstream 888117 13456929 ~ 13528319 (+)
mdm4 mdm4 other upstream 1044064 13319684 ~ 13372372 (+)
per3 per3 other upstream 1087104 13305415 ~ 13329332 (+)
cdk4 LOC107684003,LOC107701179 other downstream 305587 14740609 ~ 14757359 (+)
znf740a LOC107385642,LOC101469799,LOC102214350,LOC102304359,LOC103376569,LOC107082105,LOC100709046 other downstream 330275 14765297 ~ 14857069 (+)
G38517 NA other downstream 373330 14808352 ~ 14816436 (+)
calcoco1b LOC104959845,LOC103376572 other downstream 430037 14865059 ~ 14874459 (+)
G38834 NA other downstream 1210489 15645511 ~ 15647851 (+)

Expression


Co-expression Network