G52288


Basic Information

Item Value
gene id G52288
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053116.1
NCBI id CM020913.1
chromosome length 44101041
location 22726597 ~ 22729555 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU69812
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>TU69814
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>TU69815
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>TU69816
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko04010 MAPK signaling pathway

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU69812 False 2915 lncRNA 0.36 1 22726597 22729511
TU69814 False 2878 lncRNA 0.36 1 22726678 22729555
TU69815 True 2959 lncRNA 0.35 1 22726597 22729555
TU69816 False 2834 lncRNA 0.36 1 22726678 22729511

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
cpne5a NA coding upstream 1005 22653501 ~ 22725592 (+)
srpk1a srpk1 coding upstream 99438 22611970 ~ 22627159 (+)
mapk14a LOC103368176,LOC104964410,LOC104939458 coding upstream 115801 22597224 ~ 22610796 (+)
elapor1 kiaa1324 coding upstream 130395 22585431 ~ 22596202 (+)
smc5 smc5 coding upstream 145012 22565944 ~ 22581585 (+)
adora1b adora1,LOC103368126,LOC101166301,LOC102200284,LOC101484151 coding downstream 62110 22791665 ~ 22795982 (+)
mmp9 mmp9 coding downstream 77368 22806923 ~ 22811471 (+)
LOC120559125 NA coding downstream 82315 22811870 ~ 22823643 (+)
LOC120559530 LOC104964419,LOC104927136 coding downstream 97076 22826631 ~ 22828548 (+)
slc16a4 slc16a4,LOC102787232 coding downstream 118430 22847985 ~ 22877262 (+)
G52287 NA non-coding upstream 466 22725873 ~ 22726131 (+)
G52272 lhfpl5,LOC102777996 non-coding upstream 95453 22630594 ~ 22631144 (+)
G52185 NA non-coding upstream 242496 22480543 ~ 22484101 (+)
G52179 NA non-coding upstream 250283 22474230 ~ 22476314 (+)
G52054 NA non-coding upstream 379951 22340383 ~ 22346646 (+)
G52294 NA non-coding downstream 20508 22750063 ~ 22762554 (+)
G52333 NA non-coding downstream 105243 22834798 ~ 22847296 (+)
G52342 rbm15 non-coding downstream 154494 22884049 ~ 22888687 (+)
G52379 ahcyl1,LOC104942237 non-coding downstream 279622 23009177 ~ 23020008 (+)
G52364 nfya non-coding downstream 291251 23020806 ~ 23023328 (+)
LOC120559933 NA other upstream 164076 22562154 ~ 22562521 (+)
G52210 LOC104964406,LOC106525460,LOC105931770 other upstream 166269 22556329 ~ 22560328 (+)
LOC120558641 LOC103363734,LOC104967523 other upstream 631707 22090197 ~ 22094890 (+)
avpr2aa avpr2,LOC105897269 other upstream 665952 22046763 ~ 22060645 (+)
G51926 NA other upstream 822520 21903542 ~ 21904077 (+)
lamtor5 lamtor5,LOC102787529 other downstream 112489 22842044 ~ 22846938 (+)
atxn7l2b kcnc4 other downstream 261697 22991252 ~ 23068479 (+)
tmem201 tmem201,LOC102777799 other downstream 1016810 23746365 ~ 23765165 (+)
ctnnbip1 ctnnbip1 other downstream 1061892 23791447 ~ 23814406 (+)
LOC120559118 LOC102791662 other downstream 2211240 24940795 ~ 24945320 (+)

Expression


Co-expression Network