tmem201 (tmem201,LOC102777799)


Basic Information

Item Value
gene id tmem201
gene name tmem201,LOC102777799
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053116.1
NCBI id CM020913.1
chromosome length 44101041
location 23746365 ~ 23765165 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU70197
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>XM_039800770.1
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>XM_039800771.1
ATGGGCGTGAACAAAAGGGCATCGCTTGCCGCGTGCGCTCTCGCGCCGTGTTTTGCGTTACCATTATAACGATAGTACACCAAATTCCtcatttcatgttttgttagCTTACATACTGGTAATATAGCTAAGTGGGAATGGAGGCGTTTAACCAGCTTTTGTTGAAATATCCTGAATTAATGTACAGTGGAGTCGGAGCTACGGCGTTTGTCGCCGGTGGAGCGCTGATATATAAAATCGCcaccagGAAGAAGCCAACCCATGCAAATGTGAACTGCTGGTTCTGTGACCGGAACACAGTGGTGCCCTATGGGAACAGGAACTGCTGGGACTGTCCCAACTGTGACCAGTACAATGGCTTCCAGGAGaatgGGGATTACAACAAACCTATCCCAGCTCAGTACATGGAGAATCTGAACCATGGAGTATCTGGTAGCCTTCCCTCATCTGAGACACCCAAGACACTGCAGTGGGTCAACTGTCAGATGCTGCTATGCAGGAAGTGCAATAACAACCAGACTATAAAGATCAAGCAGTTGGCCTCATTTATCCCAAGGGATGATGATAATTACGACGAGGAAATTGAAGCCTACAAGCACCACCTGGAGCAGACCTATAAGTTATGTAGGCCGTGTCAGACAGCAGTGGAGTACTACATAAAATATCAAAACCGTCAACTTCGAACAGTGCTCCTCAACCAACAGCTTCGGCGCAGCGGAGAATCAGACAAGGGCTTTGTAAAGAGCTCCTATTTTGCATCTTCTCCTACGGGGGTCATACTTTTACGGGCCCTCGCCTTCCTGATATGTGCTTTCCTAGTTGCTACATCTTTGTGTGACTTGCCATACCAGCCTACTTCGCTTAGTGGCCCACAGACATTAAGTGGTGGGGTCATTCCTCCAAAGCCTAAGCCCCACAATGAATCCACCCCTAACAACGAAAGCAGTGGAGGCATACCTGTATGGCAGGGTCTGCTGGAGCTGGTCCCAGACAAGGCCATAGAAAATGCCAGGCTGGTGTGGCAGCATGGAAAGGAGAACCAGCTGGCTGTAGTTTCCATTGGCCTGTTGACTTATCTCACTGCTATCTTCTTAGCAGGACCTGTGAGATTGAGGAGAATTGATGCCGTGGCCTCTGTCCTTTGGTTCATCATTCTGTGCCTCCACCTGGCTGAGAGCTACTTGACCGATGCCTCGGGCTGGATGGGCAGCTACTTGACCGATGCCTCGGGCTGGATGTACACAGCCAAGCTCAGTACTGTCTCCCTCTGTTGCCTTGTCAGCCTTGCCGCTGCTGTGGCAACTCGCAAACCACTGGGTCCAAGAAGAGCCAGATATCGAAGCTCATTGCATGTGAAGACACTGCAGGCCATACTCAAGATGCGGTTTTTGAATAATCACATCCCTCCTGTATTGCGCCACATCATCTAAAATTTCTGATCAAAGGATGACCTTggatatgtcaaaaaaagtgttcaTCGTGAGTTCTTTCAAGCCTCTATTTATAACTGATGTCCGTAAGGAGTCTCTTAGGAACACAACATCCGTTGAAGCAACTGATCAGTCCTCATGACAGAGCTGACTGAAGTACTTCCATGTGTGATATCTTTGTAGTGGCTGCCATTGCATTTTTATCACGACAACCACTGCATACAAATTCTGTGAATCTCGATCAATAGTTTTTAACTGTAGcctttttccccttttctttaCGATGGAAATGTTAAATCATAGTAGTGTAAGGTTCATGTGCTTATTGCCATTTGAAAATATAAACAGCTGCCTAGGAAAAGCAGTCACTAGTTTATCAATGTTTTCCACCAAATTGTTAATTAAAAGGTCTTGCTATTTGCTACTTGCTGCTCTTCTCCGTCCCCATTGCTGTGATCTTGTACCCCTGTGATTATTATTTGGATTATGCttcattttttcaaattaagcATGACCTTCACTGTAAACCAATGACTCCTTTTCTGCTTTGTATTCTgtatttgaattatgtttttgaaAGTAGTGCCTACCTGGCAGGTACTTGTCTTGTCTTGGCATTCGCTCTGATCGTGTTTAAGAAGTAGTCTGGCGTCCTTGGGTCAGTGCTTGAACATGCAAACATTATTAAGGCCTCAATTCTgcaactgaatatatttggcgGGAAATGCTTCAATTGTAATGTAAACTCCAAGCAGCAAGCAATGCAGTAGAAGTACTTGATGTGCAGGGTTTACCCTTGTCCAGGCAGGTTATCTTTCATCCTaagattttaatatttttaaccaAGTCAAGTCAGTAATGATAtgctggactgtaatatttttagTTATAGTAAATCTGAAATTGCTGCATTACCATTTGCAACTAAAATTATTAGACTTATATTGCACTTATCTATTGCTACCCTTAATCCCTTTGCATGTTAATGTATTAAAAACACTGATGGACTTACTAGTTGCATGCGCTAACATTTCATCTCTCGCCAAATTATTTCCATTAACCGgttttgttttactttgatGGAATGTATTGTAGTGAAGGGGTATATTTTCTTGACAGTAATATGAAAATGTGTTACAAACTAATAGCTGTAGTAAGTGTTTATAGATTGTATTTGGTGGTTTAAATTGCATGTCTTGTTGTCCTGTAGTTGGAGTTATGTTCTCAAACCAGCGCCTTCAGTGTAGTAGTCTCAAAGTTTTgggatttgtgttttttttgttgttgttttttgcttgCAACGAAAGTACTGCCTAATGTAAGACTTTACATATGTTTGTAGGTTATGAGGAAAGTATTGACTCTGTGTATAATCTCTACAACTCCATGTTTCATGATTTGACTTTCTCTCTgaaaaatcaaatgcaaatATTGCAGTGCTATATAGTGTTCTAGCACGATGAATGATACTTTGATTTATCATAGCATCTATCAGTAAGCGTTATCACTTACTTTTCTACCTTTCATAAACCGCATCATGTGACAAACTGCATCTTAAACACTtgacaaaaataatattttatcaAAATGAAATGTCACAACTCTTCTCAAACACCCTTGTAAAAGAGATAATTGATCTCAATGGGTGTTACCTGGTTAAATTTGGGttcaataaaaatttaaaaaaataaaaccatataCCATGCTTTATTCCATCTTGCCTTCATCCACCCTGATGAAGTCAAGATAACTGAAAACGTCTGGTGAATAAAGTGTGGTGTACTGGAGAAGCATTGTGCGACATGTTTTAATTTGGGTGGACTTTCATTTAAGCTTACCCAGGTCTGCACCTCGCTGTGTGCATTCTCAAAGTAAGAaaaatattgtatatttttaccttttttttttgtgcgttTGCATAAGGTACATCTAAAATGTATTATCTTTGCCAAAGTTTTAGATGCCGTGCTAGAAAGTTTGTGTTCACTATGAACTTCCAGGTTGTGTTTATCTAATTGTGTGTGGTTTTTAGAGAATTCCTGTAGCTACCTGTTAAGCTGTATGACTGTAAACCGTCATTTATGTCAAGTATTTAGCTCTAGAAGCACTACATTCAAACTTTTATGTTAATCACAACTTGccaaatgcaactgtagcattATATTGTTACTACAAACATTTTGTGGTGCTTAACAGTGATAGCTGTAGAACTACCTTTTTTCTCTCTAATGGAGCTGTGAATATCCATGTTTTTACTGCACTGTTTTACTATGGATATCCAGTATGTAGCTAACAAGGTTGTCATTTCTAAATGTTTTAGcaatgtgtgtgaatatgttgcAGAAACACTAAAAGACTCTGTACTTAAAAATGTAGTTTGTGTTGAGGTTATTATGCCAAATATTGATACTTTATACACAATGAAGCAATACTTTGCAATTCCAAACTATAACCTAAATAAGCTAATTAACTATATCTCAATCTGATCCGTTACTATGCATTTATATATTGTGTAGTAGCCTCAAATGGAGCTCCGTCCATGCTGATAGGGTTCCATACAGCATGCATACTGTACCCAATGAAACATACTGCGTTATGAATGCTCGGATGCTGAAATTGGGTGTCTGTCTTTTAATGCCAGGCTCCAATTTGAAGACTTAGTAGGAATCCTTGCTGTAAATGGAATGTAATAAACAACTGCTGAAAGGA

Function

symbol description
tmem201 Predicted to enable actin filament binding activity and lamin binding activity. Predicted to be involved in nuclear migration along microtubule. Predicted to be located in membrane and nucleus. Predicted to be integral component of nuclear inner membrane. Predicted to be active in nuclear membrane. Orthologous to human TMEM201 (transmembrane protein 201).

NR:

description
PREDICTED: transmembrane protein 201-like isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU70197 False 2715 TUCP 0.38 4 23759234 23765153
XM_039800770.1 True 4188 mRNA 0.43 11 23746365 23765165
XM_039800771.1 False 4139 mRNA 0.40 7 23746365 23757168

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
foxl2l NA coding upstream 899 23744072 ~ 23745466 (+)
plekhn1 plekhn1 coding upstream 117445 23613688 ~ 23628920 (+)
klhl17 klhl17,LOC106572137 coding upstream 144717 23588381 ~ 23601648 (+)
samd11 samd11 coding upstream 188478 23502322 ~ 23557887 (+)
rerea rere coding upstream 300600 23353958 ~ 23445765 (+)
pik3cd pik3cd,LOC104956376 coding downstream 5466 23770631 ~ 23789093 (+)
clstn1 clstn1 coding downstream 84449 23849614 ~ 23890973 (+)
nmnat1 nmnat1 coding downstream 129048 23894213 ~ 23904039 (+)
rbp7a rbp7 coding downstream 138800 23903965 ~ 23905818 (+)
ube4b ube4b coding downstream 141735 23906900 ~ 23927466 (+)
G52569 NA non-coding upstream 59004 23686352 ~ 23687361 (+)
G52509 NA non-coding upstream 298808 23447353 ~ 23447557 (+)
LOC120558323 NA non-coding upstream 471170 23265231 ~ 23275195 (+)
G52461 NA non-coding upstream 499861 23221926 ~ 23246504 (+)
G52403 atp5f1 non-coding upstream 553377 23140910 ~ 23192988 (+)
G52604 NA non-coding downstream 24283 23789448 ~ 23790522 (+)
G52611 NA non-coding downstream 72527 23837692 ~ 23837962 (+)
G52628 tardbp,LOC106566965 non-coding downstream 244631 24009796 ~ 24011101 (+)
G52629 NA non-coding downstream 247798 24012963 ~ 24013301 (+)
LOC120558580 NA non-coding downstream 295898 24061063 ~ 24074008 (+)
atxn7l2b kcnc4 other upstream 677886 22991252 ~ 23068479 (+)
lamtor5 lamtor5,LOC102787529 other upstream 899427 22842044 ~ 22846938 (+)
LOC120559933 NA other upstream 1183844 22562154 ~ 22562521 (+)
G52210 LOC104964406,LOC106525460,LOC105931770 other upstream 1186037 22556329 ~ 22560328 (+)
LOC120558641 LOC103363734,LOC104967523 other upstream 1651475 22090197 ~ 22094890 (+)
ctnnbip1 ctnnbip1 other downstream 26282 23791447 ~ 23814406 (+)
LOC120559118 LOC102791662 other downstream 1175630 24940795 ~ 24945320 (+)
G52871 LOC104956590 other downstream 1188277 24953442 ~ 24957330 (+)
tprg1l tprg1l,LOC102784883,LOC106513028 other downstream 1978424 25743589 ~ 25748321 (+)
G53096 ybx1 other downstream 2306420 26071585 ~ 26076664 (+)

Expression


Co-expression Network