G55124 (fam110a,LOC104960682)


Basic Information

Item Value
gene id G55124
gene name fam110a,LOC104960682
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053116.1
NCBI id CM020913.1
chromosome length 44101041
location 34024018 ~ 34127495 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU73607
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>TU73609
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>TU73610
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>TU73611
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Function

symbol description
fam110a Is expressed in margin; pronephric duct; and yolk syncytial layer. Orthologous to human FAM110A (family with sequence similarity 110 member A).

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU73607 False 1051 TUCP 0.51 2 34024018 34127495
TU73609 True 4561 lncRNA 0.43 2 34117904 34122520
TU73610 False 4039 TUCP 0.42 2 34117904 34127495
TU73611 False 4035 lncRNA 0.42 2 34117904 34127495

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120559811 NA coding downstream 60078 33955326 ~ 33963940 (-)
taf13 taf13 coding downstream 259414 33763783 ~ 33764604 (-)
LOC120559034 NA coding downstream 292546 33730330 ~ 33731472 (-)
si:rp71-17i16.5 LOC103384699,LOC104952370 coding downstream 313251 33696847 ~ 33710767 (-)
lamb2l LOC103362005 coding downstream 339744 33618623 ~ 33684274 (-)
snphb snph,LOC102777778,LOC102297639 coding upstream 6764 34134259 ~ 34165964 (-)
slco4a1 slco4a1,LOC101478628,LOC102208188,LOC102077347,LOC102776629 coding upstream 206103 34333598 ~ 34375503 (-)
plagl2 plagl2 coding upstream 663118 34790613 ~ 34842286 (-)
LOC120559153 LOC102294427,LOC103371493,LOC108250036,LOC102794968,LOC101487634 coding upstream 760290 34887785 ~ 34899218 (-)
myt1b NA coding upstream 778942 34906437 ~ 35034952 (-)
G55119 NA non-coding downstream 71360 33952265 ~ 33952658 (-)
G55093 NA non-coding downstream 72336 33865954 ~ 33951682 (-)
G55092 LOC104946618 non-coding downstream 74009 33916095 ~ 33950009 (-)
LOC120558540 NA non-coding downstream 148598 33857451 ~ 33875420 (-)
G55050 NA non-coding downstream 192459 33831049 ~ 33831559 (-)
G55137 NA non-coding upstream 743 34128238 ~ 34128796 (-)
G55166 NA non-coding upstream 139300 34266795 ~ 34267033 (-)
G55190 NA non-coding upstream 252570 34380065 ~ 34407170 (-)
G55203 NA non-coding upstream 429686 34557181 ~ 34557690 (-)
G55328 NA non-coding upstream 702874 34830369 ~ 34878720 (-)
lamb2 NA other downstream 409078 33555800 ~ 33614940 (-)
zgc:158296 NA other downstream 1052855 32966635 ~ 32971163 (-)
G54834 NA other downstream 1136728 32880193 ~ 32887290 (-)
G54756 LOC107088573,LOC106566972 other downstream 1250532 32767357 ~ 32773486 (-)
LOC120559593 plxnb1,LOC103373813,LOC107100289 other downstream 1357559 32590983 ~ 32666459 (-)
ntsr1 ntsr1,LOC103361890,LOC104959625 other upstream 109071 34236566 ~ 34291069 (-)
LOC120559165 NA other upstream 1142401 35269896 ~ 35277854 (-)
G55492 NA other upstream 1277109 35404604 ~ 35409766 (-)
si:ch73-70k4.1 NA other upstream 1747127 35874622 ~ 35898736 (-)
LOC120559361 NA other upstream 2430035 36557530 ~ 36559959 (-)

Expression


Co-expression Network