G57142


Basic Information

Item Value
gene id G57142
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053116.1
NCBI id CM020913.1
chromosome length 44101041
location 41063011 ~ 41063672 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU76746
acaggtctggttacaccgccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctggttacaccgccacctacaggtctggttacacctccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctggttacaccgccacctacaggtctggttacaccgccacctacaggtctggttac
>TU76747
acaggtctggttacaccgccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctggttacaccgccacctacaggtctggttacacctccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctggttacaccgccacctacaggtctggttac
>TU76749
acaggtctggttacaccgccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctggttacacctccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctggttacaccgccacctacaggtctggttacaccgccacctacaggtctggttac
>TU76752
acaggtctggttacaccgccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctggttacaccgccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctcgttacagcgccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacacctacaggtctggttacacctccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctggttacaccgccacctacaggtctggttacaccgccacctacaggtctggttac
>TU76753
acaggtctggttacaccgccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctggttacaccgccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctcgttacagcgccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctcgttacagcgccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacagcgccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctggttacaccgccacctacaggtctggttacaccgccacctacaggtctggttac
>TU76756
acaggtctggttacaccgccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctggttacaccgccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctcgttacagcgccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctggttacaccgccacctacaggtctggttac
>TU76757
acaggtctggttacaccgccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctggttacaccgccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctcgttacagcgccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctcgttacagcgccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacacctccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctggttacacctccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctcgttacaccgccacctacaggtctggttacaccgccacctacaggtctggttac

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU76746 False 254 lncRNA 0.57 2 41063011 41063672
TU76747 False 230 lncRNA 0.57 3 41063011 41063672
TU76749 False 230 lncRNA 0.57 2 41063011 41063672
TU76752 True 464 lncRNA 0.56 3 41063011 41063672
TU76753 False 446 lncRNA 0.57 2 41063011 41063672
TU76756 False 302 lncRNA 0.57 3 41063011 41063672
TU76757 False 422 lncRNA 0.57 4 41063011 41063672

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
itpr3 itpr3 coding downstream 37537 40845208 ~ 41025474 (-)
trnak-uuu_11 NA coding downstream 111416 40951523 ~ 40951595 (-)
trnak-uuu_10 NA coding downstream 114410 40948529 ~ 40948601 (-)
trnak-uuu_9 NA coding downstream 117484 40945455 ~ 40945527 (-)
trnak-uuu_8 NA coding downstream 122085 40940854 ~ 40940926 (-)
LOC120559074 NA coding upstream 102183 41165855 ~ 41199134 (-)
LOC120558615 NA coding upstream 232408 41296080 ~ 41707346 (-)
LOC120558619 NA coding upstream 321637 41385309 ~ 41387846 (-)
LOC120558620 NA coding upstream 350366 41414038 ~ 41414898 (-)
LOC120559078 NA coding upstream 424459 41488131 ~ 41496505 (-)
LOC120559792 NA non-coding downstream 8126 41054105 ~ 41054885 (-)
G57029 NA non-coding downstream 84112 40969988 ~ 40978899 (-)
G57038 NA non-coding downstream 123518 40927305 ~ 40939493 (-)
G57128 NA non-coding downstream 143685 40911288 ~ 40919326 (-)
G57127 cirbp non-coding downstream 173108 40888417 ~ 40889903 (-)
G57144 NA non-coding upstream 7704 41071376 ~ 41072514 (-)
G57034 NA non-coding upstream 46038 41109710 ~ 41112961 (-)
G57031 NA non-coding upstream 57599 41121271 ~ 41126279 (-)
G57149 NA non-coding upstream 92259 41155931 ~ 41159605 (-)
G57155 NA non-coding upstream 115751 41179423 ~ 41180486 (-)
G57041 NA other downstream 159087 40834098 ~ 40903924 (-)
G57036 NA other downstream 178405 40877882 ~ 40884606 (-)
LOC120559369 NA other downstream 393668 40660809 ~ 40669343 (-)
plxna3 plxna3,LOC101485239,LOC102288896 other downstream 1434534 39466226 ~ 39628477 (-)
G56721 NA other downstream 1448774 39550498 ~ 39614237 (-)
LOC120559188 arl8a,LOC100698319,LOC105027762,LOC103362481 other upstream 62663 41126335 ~ 41137726 (-)
G57146 NA other upstream 67210 41130882 ~ 41131470 (-)
LOC120559079 NA other upstream 653198 41716870 ~ 41731801 (-)
LOC120558546 NA other upstream 840468 41904140 ~ 41918743 (-)
LOC120558559 NA other upstream 1064571 42128243 ~ 42134658 (-)

Expression


Co-expression Network