LOC120559567 (klhdc8b)


Basic Information

Item Value
gene id LOC120559567
gene name klhdc8b
gene type coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053116.1
NCBI id CM020913.1
chromosome length 44101041
location 33323805 ~ 33470306 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>XM_039801391.1
CACTCTCCTCATTCCCTCGCTCTTTCTTATTCCCTTTTCTGTCCATCTTTCACACACTAGCATCCCTATCTTCTTTACCCCCCCTCCTTCTATCCATCTTTCACTTTTCCCTTGTCTCTTTACCTCTGTGGACGCAGAGGTTCAGGCGGTCActcaaacagacagaaacaagcTTGTTCCTCTGCTTGTTTCTTCTGCTCtcgctcagttttgttccaccTTTGcgagccccccaccccccactccaccttctgtctcttcctcttcctcctccctggCGTGGTGTGTGATGCTGTGtcccctcctctctgtcctggaGACATGCCTGTGCAGGAGATGGCGGTGAGTCCTGTCAAGTCCCTGTACTGGGAGCCGTTCCCCCCCATGTCGCAGCGCCGCGTCTACTGCACTCCCGTCTACCACGAAGGCCTGCTCTACGTGCTGGGGGGCTGCAGCGAGACGGGCGCACCCCTGGACAGCGTCGAAGTCCTGGATGTGGAGAGCCAGACGTGGAGCCAGCTGCCGCCGCTGCCCACTGCGCGGGCGGGGGCCTCGGCCGTGGCCTTGGGGGGCCAGGTGATGGTGCTCGGGGGCATGAACCAGCAGCAGACCCCGCTGGCGTCCGTGGAGATGTACCACCCCGACGAGGGCAAATGGGAGACGAAGGCCAGCCTGGGTCAGCCGTCCATGGGAGTCaccgctgtggagaaagATGGAAAGGTGTATGCGCTGGGAGGTATGGGAACCGACACAACGCCACAGGCCCTGGTGAGGGTTTATGACGCGGAGAAGGATCAATGGCAGCCGATGACATCCATGCCCACGCCGCGGTACGGAGCCACGCCCTTCGTAAGAGGAAATAAAATCTACATGATGGGTGGTCGTCAGGGAAAGATGCCTGTGACGGCGCTGGAGGCTTTTGACCTGGATATGAAGAGCTGGACACGTTACTCCTGCATCCCGAGCCGAAGGGCCTTTTCCTGCTGCGCTTCCAATGAGCGAAGTCTCTTCAGCCTGGGGGGCCTCCAGCAGCCAGGGCCGCATAACTTCTACTCCAGGCCTCACTTTGTCAGTACCATGGAGGAGTATGATCTGGATCAAGGTATCTGGATCAAACCCAGCCGAACATCCAGGATGAGGGAGAAGAGGGCTGACTTTGTGGCAGGATGCCTGGGAGGAAGGGTAATCGCAGCTGGTGGTCTAGGTAATGAACCATTGCCGCTGGGCACGGCGGAGAGCTACAACCCTGTGAAGCGTCGCTGGGAGTATGTGGCGCCCATGCCCACTGCACGCTGCTCCTCTGCCCTCCTGCAGACAAACAGCATGCTCTTTGTCATCGGCGGAGTCGCCCAGGGACCGAGTCATGCTGTGGAAGCCCTCTGCTTACCGGAAACAGtgtgacacatgcacacacgctaacacacacacaggagtgcAAACTGGCATTGATATTTTATTCATGTGTGTGCATAAACACATGAATTGGTTCCACAGATCGCATTTAGATACTTTTCTACCTTTATGTCCAACTGATGGATTCCTATTGTACACTGGGATGTAAGAAACAATTTTTGACATTCAACAAGCATTTTCAACTGCAGAGACAGTTTGTGACAGAGCTGGACCAATACAAGATTAAAGCGAGGACAGAACACTGACAGCTTTTCTACACTGGGGAaatcagagagaaagaaaagaatgagcaaaaaacagacacacacacacggtgtcTGAAGAAACAACACGCCTTTGAACTGTTGAgtatttttcagaattaaagcagGGTACTTTTCTGGATATCAAAGGAAGATAGGGCCATATCTGCATTTCTTCTATGCGGCAGCGTCGCTTTCCCTGCTGCTGCGTCAGCGAGCTCGGACACTTTTCTATGACCTTAGAAACAGTTTCAGACAGTGTCGTTCTGGGAATGTGTATGTCTGTTGTGGTTCTTCTGTTTTTGTTGCAGTGTTGTATATGTGTGAAAGTTAGCGCTGCAGCTAGCAACCGCTACCACAGTGTCAACAACAGTGGCCCTTGACATGCGTTCACACTTCAAGCAACTGCTAGTCAGAAGCCCATCTATTTTCTACAACCACTGTAGCGTTGGCTGACGTTGACCACAGTCactgtgtttcctttatttgttGTTGTAGAAAAGCTGACTGTGGTCGGCACCTCGTTCTGCTACACATCTATCCGCCCCTGCTTTAACGTTAGCGCCACAGCAATCAATCCCGAGCAAATTACCAAGGCTCAAACGGTCCTTCACACTGTAGCACAAGGATGTAGTTGCTCGTTGAGTGAATGCAGAGTTCCTCATACCTGCTGTACTGAAGCATCCAGACATATTAATAACCTGAAATCAGCCTCCTGACACTGTATATTCCCCTTGATTTTTAGGATTGATAGTAATACATTGTATTACTGTATTTACATAAAATTAATGTCAGTCCGATGATGGATGAAATGGGAAGAGCATCTCAAAGGGATGATACATGGGCAACATTTTGAaatcagtgttgggcaagttagtGGAAAAATCTAGTCATTACAGATTATATATTATTCTCTGAAATTGTTTGTATTATATTACTTGACTAATTATTCAACAGCAAAAGTAATTAGTTGCATTAAGTTACCCATCCCAGCTCCGTCAAAGGTGCCTTTAAACAACTCCAAAGCCTCCACACCCGCATGTCACATCAACTGTATTTAACGTGTACGGTATAGAAATCGGAAAAATATgtcggcagttcgtgaaatggtcacgtaatttaatctatttgattcgtgtacacggacacgtttatctcttttttttcgtGGTGATCAGCAGGTTTTtgaaactaatgtatttcaatgggaagcatcttgcgtgatcacagcacgactacggtagcgagtagtatgaaatgccgaaaatccgcatagggaggttggttccccgttcttcttttcctaaacccaacctctgtGGGTCCATCACGGAATTTTCAGCGATAGTGTTCATTTCACGCCCGACATTGcgtgctgaccaccacgaaaaaaagagataaacatGTCCGTGTACACataatcaatagattaaaaattacgtgaccatttcacgaactgccgtgagaccgtgttgacAGTTTGGAGGTATTTACAGATGGTTTAAGTCCTGTTGTTAGGGTGACACTGCTGTTCACACACTCTCCACCAATAAACAAAACCCAGGTGATTCCTGAATGTGGGTTTACcagtggctaacgttagctagccagCAAAGAACACACAGCTTGTAAATTAAGACAACTTGAAGTTAGTGGAAGACACTTTTCACATCTTTTGGCTGCCTTACAACACGTCCAGCTCTTTCGCCAGGCTAACACATAACGCCGCGCTCTTTCCACTGAAGGCATGAGACAAAACTGATTACTGACTCCTGgccaaattgtcaaagaaacAAAGTGTAACTGGGATTAGTAAATTGTAATCCCTTACACTCATTGTTACTGGAAAAGTAACACATTACTGTAAGACATTACTAAGTAACTACTGCCcactgttagcatgttagccaaAACAGTATGTGACATACTACACATAGTAtaacatacttttattttgaaattcctttttgattttatttcacACACATGCATCAAATGCAGAGAGATTGTCCCCAAGCCAAGTCCGTATGGACTGTGCTACTGCCTGACATTAACTAAAACCTAAAAATTTgtaatctgtctgtctgtcctttgaTTTTATCAACAACCGTTTATCCGatcgacttcacacttggcaggTGTATTGCTGAGGACACAAGGAAGTGCAGTGTCTAGTGTGAGCTCTTAAGATTTATTGGACATATTTATGAGTAGTTATTTCCACACTGTAGTATTGAGAATGGACCCCTATTTACTGTTACACCGCAAAACAGTATGCTGGGTACAGCTCGCTCTCCGTCGctcatacagtacattcaagaacagatgaagaaagagagaccggAGATGTTATAAACTTAAACATAAACAATGTAACTTTCAGAATGAACGCTTCCTGTTCCCAGAAATAGCCTGATCTCAAATAGATAGCTTTGATCAAATGACATGTATACTAGGGTACACATCTATGTCATGGCAAGTGTGTTGCTTAGGACACAAGGAAGCATAGTGTCGAGTCCAGTGTGAAGTTTTTTTTGGATAAACGGTTCTCGGGAAAGCAGCAGTACCGGTGACCAAGCATGCGGCCCATTCCGAGCAGGCACGTTTTGAATGAGCACTGCACAGATAAATGGCAAAGAATTATGCTGGGAGTGCTTTGAGAGGTTTCTATGGACACATGTTTTTGCCATGACTCCATTGGAATCTATTGTAACTGCTGTGAATCTAAGTTGACAACAGCTACTACAAACCTTTTAGAGGCACCTTTCAGTCCTACAGGTTGAGCAGCTGATACTCAAAAGATGGACTTTTTGTTTGGGCTGAGGTCAGGCTTTGTGTGCAAGAGTTAGGAATAAAAGATGATGGAGGTTAGCGGCTGTGCAGAATGTTTTGTGACAGATTCAGTGACTTCAGTGACAGCAGACGAGGTCGGGCATGAAACGAACAAATGACTCAGTGCAGTGTGTTACTGTGTGGTAAGCTGCCTCTGTTGGTCTTTCTTATTCTGCCATACTGGTAGCATTTTCAAATATAGACAGCCATCAGCTCCTCCATTCAGACTACTGTAACACAGAGGAGTCAATCGTGGCTCTGTTGGTTTGGTCCCAGGTTCTTTTACAAAAATTTGCATTATTAGGCAATTGATTTACAAGGTTAACTGCTCTTGCCTGTAGAATACAGGTGATGTTAGCCACAACAAAATGtcaagtttattttaaaataccagagtttatttgatgactggATGATTAAAGGTAGGATGTGCTTCAAAATGATTAATGACCGTGAGACTTGCAGTAGGAAAGAAATTGGAAAATTAAAGCCAGATTGGATCGACAGCTATGA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Function

symbol description
klhdc8b Human ortholog(s) of this gene implicated in Hodgkin's lymphoma. Orthologous to human KLHDC8B (kelch domain containing 8B).

NR:

description
PREDICTED: kelch domain-containing protein 8B

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_039801391.1 True 11229 mRNA 0.42 5 33323805 33470306

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120559885 NA coding downstream 29325 33271132 ~ 33294480 (-)
LOC120559907 NA coding downstream 83377 33221464 ~ 33240428 (-)
pim1 pim1,LOC102786254,LOC100704168,LOC102192917 coding downstream 250727 33068885 ~ 33073078 (-)
zgc:103759 LOC104952901,LOC101466673,LOC100706292,LOC102192048 coding downstream 302461 33016489 ~ 33021344 (-)
arhgap4b LOC103371877,LOC102798993,LOC102215860 coding downstream 308956 32972595 ~ 33014849 (-)
si:dkey-32e6.3 NA coding upstream 38382 33508688 ~ 33524809 (-)
usp19 NA coding upstream 55549 33525855 ~ 33554185 (-)
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si:rp71-17i16.5 LOC103384699,LOC104952370 coding upstream 226541 33696847 ~ 33710767 (-)
LOC120559034 NA coding upstream 260024 33730330 ~ 33731472 (-)
G54922 NA non-coding downstream 4781 33318820 ~ 33319024 (-)
LOC120558313 NA non-coding downstream 14881 33308131 ~ 33308924 (-)
LOC120558525 NA non-coding downstream 140487 33173866 ~ 33183318 (-)
G54735 NA non-coding downstream 635167 32688205 ~ 32688638 (-)
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G54947 NA non-coding upstream 34507 33504813 ~ 33507223 (-)
G54949 NA non-coding upstream 37128 33507434 ~ 33508423 (-)
G55034 LOC103362008,LOC101472191,LOC102782874,LOC105937849,LOC100703845 non-coding upstream 279983 33750289 ~ 33757122 (-)
G55050 NA non-coding upstream 360743 33831049 ~ 33831559 (-)
LOC120558540 NA non-coding upstream 387145 33857451 ~ 33875420 (-)
zgc:158296 NA other downstream 352642 32966635 ~ 32971163 (-)
G54834 NA other downstream 436515 32880193 ~ 32887290 (-)
G54756 LOC107088573,LOC106566972 other downstream 550319 32767357 ~ 32773486 (-)
LOC120559593 plxnb1,LOC103373813,LOC107100289 other downstream 657346 32590983 ~ 32666459 (-)
LOC120558955 LOC104919264,LOC102777709,LOC100695043,LOC102209489,LOC103373809,LOC103152775,LOC101470785,LOC106963186 other downstream 1000530 32292942 ~ 32323275 (-)
lamb2 NA other upstream 85494 33555800 ~ 33614940 (-)
G55124 fam110a,LOC104960682 other upstream 553712 34024018 ~ 34127495 (-)
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LOC120559165 NA other upstream 1799590 35269896 ~ 35277854 (-)

Expression


Co-expression Network