adamts3 (adamts3,LOC100699019,LOC101479253,LOC102313231)



Basic Information


Item Value
gene id adamts3
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gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
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Chromosome Information


Item Value
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NCBI id CM020914.1
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TTTAAGAAGCCGAAGATGCCATTTTAATCAACTACAATAACATATATATCATTCGGAATGTTTACAGTTTCAGCACAATGTGTTACATGGACATAAACAACTCTTTGACTCTTAATGCTGTTGCAATGTTCTCTGGGGAATATTTTAaaagaatagttcaacattttcagaaatatCCTTGTTTGCTTGCTTGTTGAAAGTAAAATATGAAGATTGATAGCACTTTTATATCTCTGCTTTAAATATAAAGCTTTCAGCCAGCAgacgttagcttagcataaatactggaagcaggggaaacagctagtctggcttcgtccaaagtttaaaaaaaatgcctacCTACACCTCTGAAGCTCACTTATTATGgaatatcttgtttgtttaattcgtACAAACCTGACATCTAAAAAACAACACTAAAAAGTTTTGTTAACTtttgacagagccaggctagctgtccCTCTATTTCTAGTtattgtgctaagctaagctaaccgtctcATGGCTGTCAGTTCATGTTTATTATGCAGACATAAGAATGGTGTCAATGCCCTCTACTAActtttggcaagaaagcaaataagcgcatttccccaaatgtcaaaatattcctttaagaagTATCTTATACACATTACTTCATCCCAGCCTTTACCTATTTTCTAAATCAGAACTTTAAACAGTGCTAGCCCTCGACCTTTCcaactatatatattatattgccCTCCTTGTGAAAGTGTTTGCCCAAAAAAGTTGAAGCTGTTAGGTCAAAGAAGGGAACTAAGTAAGGAATGTATTTAACAAGTGTTCTCAATACTGTATGTTATATACAGCAGGCGCTAGTTCAGCTTGAACAgactaaaaaaaagaagtgaaaatTCCACCATGCAACTAAAATGAAACTTCTACTTTGATGTGACCATGAAAAACGCAAACACTCATCTTGAAATTGATTTTTAGTGTTGGATTTGCTGGTTATTTTCTATAGCAACATAAATTGTCGAATTTAaaacttaaagctgcattaagcgttttttttttttaccactagGGGGCAGAAAGACTCCCAAACAAACTCACATAGTTGCATATTTTACACATCCAGCGGAAAGAGAGCAACAGAAATCACAGttctgtccacctgatgaatttAAATCCGgcattcactctccttttagctctgtttagGTCTCTACCAACTTCTGAGGGAAGTATCTATTTCTTTAGCTCCCAGATGTTCCACTTTCTTCACCAGCTACTCGTGTATTTCAGctctctgctgtttggtgctaaCATACATTCAGCTTTTTGATTTGATCTGTGGGGGTTGAGGAGAGCCAAACCAATGTGCTAAAAGCGGTGTAGTGGTGCAGGTGTTTATTCTCATGTGGTTCAGCCCTGTTACATTAAATAGAGTCGTTTGATTAATTTTATAATAAACAAATCTCGCTTAATGGAGCTTTAAGATCATCACGCCCATACATAACAACAAGGTTTTATTGTACAGTTTGTGTTTGCAGGAACAAATCCTAATTTTAAGCACGCTAAAATTTACTGTATGTGGAACATGTTTTTTCCAAGTATTTTCCAAATGGCTTTTTATGGTGTAAGAAGGTTCAGGAGAGAGAAAgctatttattaaaaaaaaaaaaaaaaaataaggatttCCTCACAACCACCATGCATCTGACTGCAATAGCAAAGACACAGTTTTGTGTTTTCAGCAAAGAAATGACTATTCACACTCACTTCTGTGTGCCAATGTATAGTACATGTATATAGCATTGAGTACATGAATATTTATTGAAAGTTAAAGctttgtttttacagtatttgCAGTGCCAGCTGGTCAATAAGCTGCAGCACATAAACCATTGAGTCACATTAATCACCATTTTTCTTTCCacattttcaaattttaaaTAGATTTCTACTTCTATTTTAAAACACATGATAGTGTAggaattacattgttttttgcaAACAATTAGATGTAAATATACATGCTCAGTTTTGAGATGTTTTACTCGTCAGAAAGCTGTCTTTTCACAGCTGTTTCATAGTTGTTAACACAGCTGTTACATCACAGCGAAGTGTACTGACCAGACAAATGCTTTATTTTAACCAATAAAACATTAATAGTGTAGTACCAGAAAACCagtaatgttgttttttatgcTGTTTGTAGATGTCAGTATTTTCTAACCATTTTACATTTTCCTCCCTTGTTCTTTTCACGCCCTTTACTTGCTGCCTATACAACATTGCTGCTAATGTTATACAGAGCTTGTAATGATAAAATAGGGTAGTTGTAGATGTTACATTGACAATCCCTGAGCCTCAGACAGATATTACTGCATAGGATTCTCCATGTACTGTATCAATACCCCTGTGCTATCCATGCATTGAAGTATTACGATTGTCATGACTGTCAGTCACTCTCTGCTCTATTTGCTTTTCAATGTATTTGTGTAGATTGAAGTGTACACTACTGATGCTGTTTGTTGTAATGGGGAGCACATAGCAATAAAAGATATGAATAACTA

Function


symbol description
adamts3 Predicted to enable metalloendopeptidase activity. Predicted to be involved in extracellular matrix organization. Predicted to act upstream of or within proteolysis. Predicted to be located in extracellular region. Predicted to be active in extracellular matrix. Is expressed in several structures, including digestive system; nervous system; otic vesicle; pleuroperitoneal region; and thymus. Human ortholog(s) of this gene implicated in Hennekam syndrome. Orthologous to human ADAMTS3 (ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3).

NR:

description
A disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs 3

GO: NA

KEGG:

id description
K08619 ADAMTS3; a disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs 3

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU88608 False 2593 lncRNA 0.35 1 32206919 32209511
XM_039803991.1 True 7771 mRNA 0.45 24 32032576 32209534
XM_039803992.1 False 7714 mRNA 0.45 23 32032576 32209534
XM_039803993.1 False 7690 mRNA 0.45 23 32032576 32209534
XM_039803994.1 False 3531 mRNA 0.55 22 32032893 32205752
XM_039803995.1 False 7549 mRNA 0.45 21 32032576 32209534

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
smarca2 smarca2 coding upstream 65842 31906122 ~ 31966734 (+)
dmrt2a dmrt2 coding upstream 206858 31820669 ~ 31825718 (+)
dmrt1 NA coding upstream 230123 31770292 ~ 31802453 (+)
kank1a kank1 coding upstream 275072 31699526 ~ 31757504 (+)
ctsla LOC104932682 coding upstream 357461 31670525 ~ 31675115 (+)
rufy3 rufy3 coding downstream 194853 32404387 ~ 32426382 (+)
trnap-ugg NA coding downstream 362154 32571688 ~ 32571759 (+)
ascc2 ascc2 coding downstream 405358 32614892 ~ 32626689 (+)
LOC120560720 sec14l2 coding downstream 427302 32636836 ~ 32659330 (+)
rusc2 rusc2,LOC104944866 coding downstream 645180 32854714 ~ 32901547 (+)
LOC120561307 NA non-coding upstream 268803 31759188 ~ 31763773 (+)
G66117 NA non-coding upstream 522220 31461798 ~ 31510356 (+)
LOC120560111 LOC108434293 non-coding upstream 547575 31478501 ~ 31485001 (+)
G66107 NA non-coding upstream 614316 31409955 ~ 31418260 (+)
G66092 LOC103362337,LOC101472255,LOC102204493,LOC102311726,LOC100707713 non-coding upstream 623420 31351198 ~ 31409156 (+)
G66253 NA non-coding downstream 39467 32249001 ~ 32249240 (+)
G66255 NA non-coding downstream 81238 32290772 ~ 32291019 (+)
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dmrt3a dmrt3 other upstream 221023 31807795 ~ 31811553 (+)
LOC120561064 NA other upstream 1139296 30857580 ~ 30893280 (+)
G65899 taok3 other upstream 1454417 30574086 ~ 30578159 (+)
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G66256 slc4a5,LOC102211952,LOC101484802 other downstream 112973 32322507 ~ 32329990 (+)
G66263 LOC106536102 other downstream 155326 32364860 ~ 32369984 (+)
mapk1 mapk1,LOC103371039,LOC107386038 other downstream 230841 32440375 ~ 32470827 (+)
LOC120560610 ypel1,ypelc,YPEL1,ypeld,LOC103374080,LOC106586007,LOC106931471 other downstream 267504 32477038 ~ 32510737 (+)
slc39a14 slc39a14 other downstream 362666 32572200 ~ 32612938 (+)

Expression



Co-expression Network