G66652


Basic Information

Item Value
gene id G66652
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053117.1
NCBI id CM020914.1
chromosome length 43979800
location 34187830 ~ 34281929 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU89177
GGTAACCCCCAATGTCAATTGTTTTATTTGCCTTTAGATCATAACCGCTTGTAGATTCTGCTCCTACAACAACAAACCTTAACTATTaacttttttaaagaaaaaaaacacacaaatcagATTAgcgggatttttttttctttctcatttcACATAGTTGTGAAATTTTAgagtaaaaacacaacaaaatattattgctgcaacacaacaatCCCAGACGATAGAACTGGAACCTGCTATCACTCCCAAATTAACTGACAGGTATTTTAATGAAAGGAGGAACCCTACAAAACAACTGAAAGTTAGGAATGTTTACGAGGATGTGAAAGGTTTGTTTACAATCACTGGTCCATATTTTCAATTCTGATCAGCCGAGAAACGCCAAAATACTTAATTCAATTAAACGTTAAGAGAAAATAGCtgcatttttaaagattaaaaagtACTGCTTGggcgttttttttaaagtaatgaCACTAAATTGGTGTGTTTCATATGGGAACTAGAATATGAAATCATCTCTTGCCACAGCTGCTTGTAAATAACAACAGCACTGATAATATTGAAGACTATTAAGATTATTTTAGGGGGCTTTCAGATTGACACTTGTTTTGTAGCAAATCTCAACCGGAAAGCTACCTCACGGTGCTGCGTTAATGTTGCTGAAGGTATCGTGTCCATCTCGTCCGATTTATGCTCATTGTGATTTAAAAGATGCAACTTGTGAGATTTCTGCAGCACGATGATGTAATAAAATGATTGGTTCATGTCAAATCAGTGCTCAGATCTCAAATATTAATAAGCATTGCAAACTAATTAGCCCCTACTCTTTgaattgttttgaaaaaaatagtTTAACACATGAAATATATTTCAAACACAATTGTGACATTGACCAACAATGCGCTTaatactttaagctttttgagtcgTGCTTTCAAACACCTACGGTCTTAAGAGTATCGTCCCGTTTCCCCTTACCTCACTGGCCAAAGAATCTCCCCGGAATGAGTGACTTATGCTCTGTCGATAAtaagatatttatttattgttgccagaggtaaaaaaaaaagacttcctGAGAAGAATCTGCCAATGATTTGTGACCAGGAGCCGAATGTATTTAGCAAAGGCTCCCTATGAAATTGGTTGTCGGAGCCTCTTAATGCCAGATTCCTGTGGACTTTGTATATTTGTGCCAGATGATTAGAACTAATAGCCCTTTATGTAAGTTGTAACTCAGGGCTATGCTATGCATCCAGCAGTACCTCTCAAACTGAAGACTCTCAGAGTCACGTCGTAAGAGCAAAACCAAACGGCAAGCTATTGGTATGGATATCCTTTATAAAGCACAGGTAATGTATGtacttacatacatatatgttgttgttgtagaaGTCCCACGTCTTGGTGCATTTTTGATAAAACTGATGCTAGCCTTTTGCTTTATTAtctaaaaagaaaattgaaattagTCTAACTTTTGAGGTGCCAAAAGGTGCAAAAcgtgtttatttaaatttggTTTAGTTGTAAGGCTTTTTAAGAGAAGCACGAGTATCAATGTGGGATTGATAAGATTAATGAATGCAGTGGTAGGACTGGGTATCAATACTGATGCAGTACCTGAGATTCAGTACCAATATTATTTAGATTATTTTGAGAAAttccaaattaaaaacatttttgaaaaaataaagtgattttttttctacagaaCCCCTTTTTGTCTGTTAGACTAGGGGCCAGACTTCTCAAATGTTTAATGCCATCTAAACCAGTAGCTCCAAACCTGGTGTCATGAGATAATTAACATGGTagcaaacaagacatttttattttctatctttatttttgggACTTTTATGTAGtctttgcttcttcttttttcctgtATAGATGGTGTCAGGTAAATTCTAAAAAGACAATATACATCTCTGATTCAAGAATCAGTTCAAAAGATTACGAATCTGGGCAGACATTCAATGCCAGCTTTCAGTACCTGACATTTCTCGATACTTTGACACTTTTTGATGGgtccaaaataaaatattgaggtttgatacccagccctacctctGCAGGGGAACTCTATAATAGCTGCCTACACATGCACTCACAGTGTTTAACATATCAGGCACATTTCACACTGTAGTGTCTAGTAAACCCTGATGTTTTGAGATTGAATTAGTTAAATTAGTCAAAGCATTTGCTCTGTTCAGTATTTGAATAGAAAAGCCATAATTTTGGGATAAAAGGTGTCTGCACAACACAGCACCCTGTAACCTCAGCTTTAAACCGTACTCCGATCAGTATCGGCTTCGCTTCATTTGCACATGATTTGACGCTGACGTTAATACTAACGGATACACCTCCAGTTTTGGTGGAGTTGATGAAGTCTATCTTTTTGAGCATTTTGAGGCCTATACTTCACTCCTAAACTCACAGGGTTTTCTGATTTTGTACAACAGCTGTACATGATTTAAATTGCCTTTGCTGACAGGGCGTCTGTGAGGGTAATGTACCATTCTCTGATTAAGGGGCGTATTTTTCTCACAAATCAAAGATGTACCTGGtgttgtacatttttttttttcttcattgccCAGTGCACTAAGATCTCATATGTGAATACAACTTCCATCTGTCTCTGATACTCTTGTAGAGACAAAACTGGTCTCTGtccaacttttattttgaactaTTTTCAGCAATTTCTGTCTCTAACATACATGCAGTCTTTCAATTGGTACTTTGTACAATTCAGTATTACCAagtttttgagaaaaaaagataaatgttcCACGTTTAAAAGCAGTTTGTCTTGATGGCTTTCATTTCTCCAGTGCACATCTTTTCACGCTCTGAGATGATGCTTAATCAAAATTAATTTGGTACTCTACTTGatgtttttccaaaaaaaatgtttttccagaTCCCCTTCACACATACCATCCAACATCCACAGCCACTTCCTTTACTATCATTACCTAGAGCATTTGCCCTGTTAATTTTGTCTCTGTAGAGCACACCTCACATACTTTTTCTACAAACAACGTGCCTAGTTTGTACAATTTCTCCAACAGCAGCACTGCCCATGAGACCAAGACGCTCAGAGATTAACCCAGCGCCATCATCCAACCATCCAGCCATCCATCCTTTCATCcctccaatccaatccaatgaCATCATGAAGAATTGATACTGATGAATTAATTGCTTACCTCAGActgctttctgttttgttttttatcaaaTTGCTTTTTTGTATCCATAACATCAAGGACACTTAATTTCTACCAGATATCtgaaattcacacacacttgttttgttgcagtttctctgcaaagagtTTGCTGTATCTTTCACAAGATTATCACAACCATCATCGCATGCGATTTCTGAATGTTAAAAACCCTGTTGTTCAATATCtggccctgtttttttttttttttTTAAACTGTGAATAATGTTGTGGAAAAGGaattcaaaaacacaaacaaatgccAAATAAGTCTGATAAAAAGTAAATCCTCATGTTATTTTTTACAATACTGAACACAGGTTAATGCACTGGATAATTTGCTGGAATGAGGCTATTATAAATTTGGACTACAAAGGGGAAAGGCAGCAACTTCAGTGTCCGAAAGTCTTCAAAAGTCTTCCTCTGTCAGTTGCTTTGACAGCCTAAAAATTCAAACTTCCAATTGGCATCTGTCAattcaaaaaaatgaaaataatttttctgGAAACAAACTATTTATATTCTTGGTGCATTCCTAGAAAAAAGGTCTTTAAAGTTGCTGCCTTTCGGTAACTTTGAGCAGATGTTGTATTCATGTGAAATGAAACTGGGTTAGGATCCTCCGCCACCAGCAGTCACCAACAAAGGTGCTACATTATTTCTCAATAGTATTTCTAAGAACTGCACTTAAACCTGTTATATTTAACAACAGTGTTAAGTTTATGTTATCAGATTCCAGACAGGCAGCTCTTCACCACAAGGGTTTTCAGTCCAACCAGCTTCCACCGCAGACAAGAGGAAGCAGTCAGTGAGCGTTTGGATGGAAGGAAAACTTGCAGCTTTGTGGTGGAGAGCTGCTAAACGTAGACGGAGCACGTTTGGTATTGTGGAAGCCAAAGTGTACGTCACGTCTGAAgattaaatgacaaaaaggtGCAAAACTTACTGTTTGACTGCGAGGACAAGTGGAAGCTTGTCTAACGTAGGAGGGCTGAGCTGACTTTGTGGTTTTcctctgacaaaaaaaacacatctgtcCTTTGTAGAGGTCCTTTTCCAATTTCCATTTGTTATGAAAGTTGAAGCTGCACATTGTAGGCGAATTATCAAGTTTTGTTCTCTAAAGTCATGAAGGCCCAGTGGAAGCCCTCCCCCCCACCCTTGTgttgtcaacacaagggttaaagcttTAAAATCAGTAAAAAGGCACTTAATCACTTCGTTAGTTTATCTTTTTATGAGAGATATCATAGAATAAAATGTGTTCCCCAAAAACCTGATATTAGGTTTTCATCCAAATAAGTGATTTGGTTAAACTTTTCAGTGGTTCCTGGGGGCCCTATGTCTCAACACTTGTATGAATAGAAATAATTTCTTGCCATGTTGAATCACTGATATTCCCATGAATGAATGGAGGACTTCTACAAAGGCTACAGCTGTGTTTAACATGTGAGCTGTTACACCTCAGTTGAAACCAAACATGCTCAACCGCACTTGTATCATCTCTTAACACAAAGCCCCGACTCTCTCCACCTCCTGTAGGCAATAAACATCTCATTTTTTGAAaagaaaaaaaaacaggagttaTTTCATATGCTAGATTTAAATAATTACAACAGCAAACATAAAAAATCCTTACATTTGTGAAGCTGGAACCATACTTTCTTTTTTCCGGTTTTGTACGAATTTCCCcgctggggatcaataaaggttTATCTTATTAGGCGGCtgcatatatgaaaaaaaaacacctaaccctaaaaaaattctaacaaaagGTTTCTCAG

Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko05410 Hypertrophic cardiomyopathy
ko05414 Dilated cardiomyopathy

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU89177 True 5032 lncRNA 0.37 4 34187830 34281929

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
cnot6l cnot6l coding upstream 210 34170475 ~ 34187620 (+)
paqr3a paqr3,LOC104954486,LOC103364579,LOC102780134 coding upstream 397020 33779007 ~ 33790810 (+)
prkg2 prkg2 coding upstream 843815 33303339 ~ 33344015 (+)
rasgef1ba rasgef1b coding upstream 893729 33156914 ~ 33294101 (+)
LOC120560373 LOC106570904 coding upstream 935423 33248404 ~ 33252407 (+)
LOC120560630 set,LOC102777863,LOC107083999,LOC100696975,LOC105014167 coding downstream 28171 34310100 ~ 34314260 (+)
LOC120560629 LOC100693693 coding downstream 34377 34316306 ~ 34330925 (+)
gle1 gle1 coding downstream 49913 34331842 ~ 34344199 (+)
si:ch211-251j10.3 ralgds,LOC102776401 coding downstream 69782 34351711 ~ 34421494 (+)
smarcb1a smarcb1,LOC103361055,LOC106521870,LOC108242792,LOC100696262,LOC105917974 coding downstream 145892 34427821 ~ 34438507 (+)
LOC120560041 NA non-coding upstream 310823 33876175 ~ 33877007 (+)
LOC120561187 NA non-coding upstream 415296 33769844 ~ 33772534 (+)
G66571 NA non-coding upstream 431875 33755569 ~ 33755955 (+)
G66568 NA non-coding upstream 462048 33725520 ~ 33725782 (+)
G66522 bmp3 non-coding upstream 834880 33351699 ~ 33352950 (+)
G66689 NA non-coding downstream 149013 34430942 ~ 34439928 (+)
G66692 LOC104949787,LOC104934882 non-coding downstream 174561 34456490 ~ 34456749 (+)
G66695 NA non-coding downstream 204609 34486538 ~ 34486751 (+)
G66769 NA non-coding downstream 226213 34508142 ~ 34509613 (+)
G66830 NA non-coding downstream 533660 34815589 ~ 34816327 (+)
G66578 NA other upstream 411432 33775925 ~ 33776398 (+)
antxr2a antxr2 other upstream 584205 33517599 ~ 33603625 (+)
cds1 cds1,LOC103364266,LOC106922331,LOC103134889,LOC107386064 other upstream 1075014 33077246 ~ 33112816 (+)
slc39a14 slc39a14 other upstream 1574892 32572200 ~ 32612938 (+)
LOC120560610 ypel1,ypelc,YPEL1,ypeld,LOC103374080,LOC106586007,LOC106931471 other upstream 1677093 32477038 ~ 32510737 (+)
cfap157 NA other downstream 232081 34514010 ~ 34527405 (+)
LOC120561070 NA other downstream 484001 34765930 ~ 34773806 (+)
G66832 NA other downstream 579570 34861499 ~ 34864690 (+)
LOC120561428 fam163b,LOC103374717,LOC102797860,LOC101061299,LOC102298266,LOC101485828,LOC104964271,LOC102215914 other downstream 764915 35046844 ~ 35059631 (+)
LOC120560625 cep120 other downstream 1240736 35522665 ~ 35549231 (+)

Expression


Co-expression Network