G68755


Basic Information

Item Value
gene id G68755
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053117.1
NCBI id CM020914.1
chromosome length 43979800
location 40269701 ~ 40373388 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU92002
gtgtgtgagtgtgtctgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtctgagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtggggggggtgtgtgtgtg
>TU92003
gtgtgtgagtgtgtctgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtttgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgt
>TU92004
tgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtttgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgt
>TU92005
gtgtgtgagtgtgtctgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
>TU92006
tgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtct
>TU92007
tgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtcagtgtgtctctgtgtatgtcagtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
>TU92009
gtgtgtgagtgtgtctgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtcagtgtgtctctgtgtatgtcagtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
>TU92010
gtgtgtgagtgtgtctgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgttcagtgtgtctctgtgtatgtcagtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtcagtgtgtctctgtgtatgtcagtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
>TU92011
gtgtgtgagtgtgtctgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgt
>TU92012
tctgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtatgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtatgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtatgtctctgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtct
>TU92013
tgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtttgtgtgtgtgtgtgt
>TU92014
tctgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtatgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtatgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtctgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
>TU92015
gtgtgtgttctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgttctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtcagtgtgtctctgtgtatgtcagtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
>TU92016
gtgtgtgagtgtgtctgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtct

Function

NR:

description
myopalladin-like isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU92002 False 312 lncRNA 0.51 3 40340972 40373388
TU92003 False 214 lncRNA 0.50 3 40269701 40373388
TU92004 False 249 lncRNA 0.49 2 40269701 40373003
TU92005 False 253 lncRNA 0.50 2 40368481 40373388
TU92006 False 241 lncRNA 0.49 3 40366363 40373003
TU92007 False 352 lncRNA 0.50 2 40368481 40373003
TU92009 False 327 lncRNA 0.50 2 40368481 40373388
TU92010 True 386 lncRNA 0.49 3 40368481 40373388
TU92011 False 356 lncRNA 0.50 2 40372283 40373388
TU92012 False 309 lncRNA 0.48 2 40366363 40367620
TU92013 False 243 lncRNA 0.49 2 40367870 40373003
TU92014 False 253 lncRNA 0.48 3 40363413 40367620
TU92015 False 225 lncRNA 0.49 2 40368481 40368843
TU92016 False 212 lncRNA 0.49 3 40366363 40373388

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
dpysl2a LOC100711297,LOC102201039,LOC101475506 coding downstream 481 40221529 ~ 40269220 (-)
LOC120559991 rph3a,LOC101477332,LOC102779512,LOC104921713 coding downstream 138470 40041370 ~ 40131231 (-)
LOC120560309 hectd4 coding downstream 271843 39886603 ~ 39997858 (-)
LOC120560407 ttc28 coding downstream 428275 39449933 ~ 39841426 (-)
mn1b mn1,LOC102781903 coding downstream 874879 39366677 ~ 39394822 (-)
ciao1 ciao1 coding upstream 269341 40642729 ~ 40651595 (-)
LOC120560039 NA coding upstream 284224 40657612 ~ 40665117 (-)
LOC120561018 NA coding upstream 426211 40799599 ~ 40800695 (-)
LOC120560210 NA coding upstream 898529 41271917 ~ 41277186 (-)
LOC120560230 NA coding upstream 917222 41290610 ~ 41456856 (-)
G68679 NA non-coding downstream 53306 40215132 ~ 40216395 (-)
G68746 NA non-coding downstream 54776 40197293 ~ 40214925 (-)
G68748 NA non-coding downstream 56183 40212554 ~ 40213518 (-)
G68745 NA non-coding downstream 76112 40192230 ~ 40193589 (-)
G68739 NA non-coding downstream 115382 40153060 ~ 40154319 (-)
G68775 NA non-coding upstream 2654 40376042 ~ 40376269 (-)
G68779 NA non-coding upstream 10970 40384358 ~ 40406844 (-)
G68756 NA non-coding upstream 12622 40386010 ~ 40570878 (-)
G68778 NA non-coding upstream 23273 40396661 ~ 40399087 (-)
G68782 NA non-coding upstream 32033 40405421 ~ 40418781 (-)
LOC120560061 NA other downstream 242958 40000006 ~ 40026743 (-)
G68717 NA other downstream 333855 39935372 ~ 39935846 (-)
LOC120560826 pitpnb,LOC104952320 other downstream 808133 39410239 ~ 39461568 (-)
LOC120560036 NA other downstream 1924905 38336088 ~ 38344796 (-)
G67577 NA other downstream 2714934 37535859 ~ 37554767 (-)
G68952 NA other upstream 550686 40924074 ~ 40950607 (-)
G68985 NA other upstream 702617 41076005 ~ 41077465 (-)
LOC120560231 NA other upstream 945808 41319196 ~ 41401901 (-)
G68897 NA other upstream 1379148 41752536 ~ 41829133 (-)
G68907 NA other upstream 1381484 41754872 ~ 41782162 (-)

Expression


Co-expression Network