XLOC_005152



Basic Information


Item Value
gene id XLOC_005152
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007123.7
NCBI id CM002896.2
chromosome length 49182954
location 6348703 ~ 6363580 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence


>TCONS_00011089
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Function


GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00011089 True 14878 lncRNA 0.34 1 6348703 6363580

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_005150 a1cf coding downstream 170809 6160446 ~ 6177894 (-)
XLOC_005149 rltgr coding downstream 189158 6158225 ~ 6159545 (-)
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XLOC_005147 NA coding downstream 199017 6142282 ~ 6149686 (-)
XLOC_005146 aarsd1 coding downstream 285375 6049355 ~ 6063328 (-)
XLOC_005153 si:ch211-253p2.2 coding upstream 179209 6542789 ~ 6551681 (-)
XLOC_005154 pcdh15b coding upstream 202653 6566233 ~ 6905375 (-)
XLOC_005155 NA coding upstream 653939 7017519 ~ 7044694 (-)
XLOC_005156 NA coding upstream 707059 7070639 ~ 7083373 (-)
XLOC_005157 NA coding upstream 778887 7142467 ~ 7142830 (-)
XLOC_005143 NA non-coding downstream 376134 5756203 ~ 5972569 (-)
XLOC_005140 NA non-coding downstream 778533 5529187 ~ 5570170 (-)
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XLOC_005163 NA non-coding upstream 1042508 7406088 ~ 7441307 (-)

Expression



Co-expression Network