trim36 (trim36)


Basic Information

Item Value
gene id trim36
gene name trim36
gene type coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053117.1
NCBI id CM020914.1
chromosome length 43979800
location 21955578 ~ 21989582 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

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Function

symbol description
trim36 Predicted to enable ubiquitin-protein transferase activity and zinc ion binding activity. Predicted to act upstream of or within regulation of cell cycle. Predicted to be located in cytoplasm; cytoskeleton; and membrane. Predicted to be integral component of membrane. Is expressed in nervous system. Human ortholog(s) of this gene implicated in anencephaly. Orthologous to human TRIM36 (tripartite motif containing 36).

NR:

description
PREDICTED: E3 ubiquitin-protein ligase TRIM36 isoform X5

GO:

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KEGG:

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K12013 TRIM36; tripartite motif-containing protein 36

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Neighbor

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G63792 NA non-coding downstream 142302 22131884 ~ 22150124 (+)
G63872 NA non-coding downstream 914453 22904035 ~ 22905966 (+)
G63914 NA non-coding downstream 997599 22987181 ~ 22988040 (+)
LOC120560300 NA non-coding downstream 1230268 23219850 ~ 23245368 (+)
G63976 smim15,LOC106580593,LOC103398561 non-coding downstream 1285338 23274920 ~ 23281109 (+)
LOC120560787 NA other upstream 356289 21588876 ~ 21599289 (+)
G63480 rbm19 other upstream 1277662 20676417 ~ 20677916 (+)
wdr31 wdr31,LOC102796061 other upstream 1464992 20473651 ~ 20490586 (+)
vps13a vps13a other upstream 1513485 20400947 ~ 20442093 (+)
c6h2orf68 c21h2orf68,c9h2orf68,LOC104941594,LOC103363183,LOC104920309 other upstream 2192054 19759596 ~ 19763524 (+)
G63905 NA other downstream 940317 22929899 ~ 22930205 (+)
LOC120560905 clg12h9orf3,LOC103358904,LOC102294417,LOC101470200,LOC102214270 other downstream 1498385 23487967 ~ 23562285 (+)
G64108 NA other downstream 1703080 23692662 ~ 23693291 (+)
prxl2c aaed1 other downstream 2831732 24821314 ~ 24823066 (+)
cdc14b cdc14b,LOC102776968,LOC103141798,LOC106948523 other downstream 2834136 24823718 ~ 24837448 (+)

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