plat (plat)



Basic Information


Item Value
gene id plat
gene name plat
gene type coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_053117.1
NCBI id CM020914.1
chromosome length 43979800
location 26585780 ~ 26597313 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence


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Function


symbol description
plat Predicted to enable serine-type endopeptidase activity. Predicted to be involved in plasminogen activation and smooth muscle cell migration. Predicted to be located in extracellular region. Predicted to be active in extracellular space. Is expressed in ovarian follicle. Human ortholog(s) of this gene implicated in several diseases, including antiphospholipid syndrome; diabetic angiopathy; factor VIII deficiency; osteonecrosis; and thrombophilia (multiple). Orthologous to human PLAT (plasminogen activator, tissue type).

NR:

description
PREDICTED: tissue-type plasminogen activator isoform X1

GO: NA

KEGG:

id description
K01343 PLAT; tissue plasminogen activator

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_039804085.1 False 3373 mRNA 0.45 16 26585787 26597313
XM_039804086.1 False 3227 mRNA 0.45 15 26585780 26597313
XM_039804087.1 False 3092 mRNA 0.45 14 26585780 26597313

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
vdac3 vdac3 coding upstream 32049 26543026 ~ 26553731 (+)
rpl6 rpl6 coding upstream 74535 26506645 ~ 26511245 (+)
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ufd1l ufd1l coding upstream 92216 26489321 ~ 26493564 (+)
dhx37 dhx37 coding upstream 97379 26476188 ~ 26488401 (+)
si:dkeyp-117b11.1 NA coding downstream 682 26597995 ~ 26607634 (+)
si:dkey-178e17.3 sbspon,LOC103359527 coding downstream 69420 26666733 ~ 26679998 (+)
pi4kab pi4ka coding downstream 90019 26687332 ~ 26719116 (+)
LOC120561052 LOC104921679,LOC106580276,LOC105940836,LOC102302829,LOC106700476 coding downstream 192885 26790198 ~ 26791064 (+)
LOC120561053 NA coding downstream 196378 26793691 ~ 26794572 (+)
G64893 NA non-coding upstream 4967 26572244 ~ 26580813 (+)
G64841 enkd1,LOC102781555 non-coding upstream 45144 26540415 ~ 26540636 (+)
G64840 NA non-coding upstream 45557 26538658 ~ 26540223 (+)
G64839 NA non-coding upstream 47239 26538268 ~ 26538541 (+)
G64838 polb non-coding upstream 48085 26535012 ~ 26537695 (+)
G64930 NA non-coding downstream 65454 26662767 ~ 26663526 (+)
G64944 NA non-coding downstream 85205 26682518 ~ 26684255 (+)
G64949 btf3,LOC103470010,LOC107089645,LOC106958054,LOC106926613 non-coding downstream 164078 26761391 ~ 26829185 (+)
G64967 ykt6 non-coding downstream 296388 26893701 ~ 26896143 (+)
LOC120560738 NA non-coding downstream 300589 26897902 ~ 26899558 (+)
c6h22orf39 clg12h22orf39 other upstream 88793 26494284 ~ 26496987 (+)
G64814 cldn5,LOC103357131 other upstream 171183 26412869 ~ 26414597 (+)
nsd3 whsc1l1 other upstream 201937 26359120 ~ 26383843 (+)
LOC120560359 NA other upstream 657184 25926087 ~ 25928596 (+)
LOC120560031 LOC104941040,LOC103357154,LOC102795853 other upstream 670203 25914279 ~ 25915577 (+)
cltcl1 LOC100691387,LOC103359525 other downstream 16924 26614237 ~ 26644167 (+)
si:dkey-178e17.1 slc25a1,LOC100697273,LOC101470788,LOC103359526,LOC102784907,LOC107394264,LOC103145904 other downstream 47348 26644661 ~ 26661895 (+)
ndufs4 ndufs4 other downstream 414897 27012210 ~ 27039599 (+)
G65084 lipg other downstream 607921 27205234 ~ 27370959 (+)
mboat4 NA other downstream 2248313 28845626 ~ 28849471 (+)

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