pias2 (pias2)


Basic Information

Item Value
gene id pias2
gene name pias2
gene type coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053117.1
NCBI id CM020914.1
chromosome length 43979800
location 3799032 ~ 3816820 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>XM_039804158.1
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>XM_039804159.1
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Function

symbol description
pias2 Predicted to enable SUMO ligase activity and transcription coregulator activity. Predicted to be involved in protein sumoylation and regulation of transcription by RNA polymerase II. Predicted to be located in nucleus. Orthologous to human PIAS2 (protein inhibitor of activated STAT 2).

NR:

description
E3 SUMO-protein ligase PIAS2-like isoform X1

GO:

id name namespace
GO:0008152 metabolic process biological_process
GO:0019789 SUMO transferase activity molecular_function
GO:0008270 zinc ion binding molecular_function

KEGG:

id description
K16063 PIAS2; E3 SUMO-protein ligase PIAS2

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_039804159.1 False 5598 mRNA 0.44 14 3799032 3816820
XM_039804160.1 True 5672 mRNA 0.43 15 3799032 3816807

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
ptar1 ptar1 coding downstream 177552 3606395 ~ 3621480 (-)
apba1a apba1 coding downstream 195874 3555073 ~ 3603158 (-)
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G59000 LOC104943502 non-coding downstream 32597 3766191 ~ 3766435 (-)
G58998 NA non-coding downstream 61247 3737542 ~ 3737785 (-)
G58996 NA non-coding downstream 63158 3735554 ~ 3735874 (-)
G58966 NA non-coding downstream 192723 3606062 ~ 3606309 (-)
G58995 LOC104961333,LOC107396654,LOC101067868,LOC102226353,LOC108248341,LOC107088009 non-coding upstream 1613 3818433 ~ 3827426 (-)
G59029 NA non-coding upstream 45024 3861844 ~ 3866088 (-)
G59039 NA non-coding upstream 78892 3895712 ~ 3896725 (-)
LOC120560115 NA non-coding upstream 168808 3985628 ~ 3992944 (-)
LOC120560054 NA non-coding upstream 282978 4099798 ~ 4102914 (-)
G58994 NA other downstream 109694 3688629 ~ 3689338 (-)
G58920 LOC106099046,LOC107687292,LOC107712180,LOC107663003 other downstream 382178 3415627 ~ 3416854 (-)
G58919 NA other downstream 401536 3397169 ~ 3397496 (-)
si:ch211-102c2.4 NA other downstream 558969 3232606 ~ 3240063 (-)
tnc tnc,LOC104930867,LOC103356464 other downstream 664483 3049669 ~ 3134549 (-)
golph3a golph3,LOC103397487,LOC108249570 other upstream 392928 4209748 ~ 4224568 (-)
sub1b sub1 other upstream 607329 4424149 ~ 4430090 (-)
LOC120560375 NA other upstream 616024 4432844 ~ 4436316 (-)
LOC120561493 NA other upstream 1649403 5466223 ~ 5466437 (-)
LOC120561494 NA other upstream 1772753 5589573 ~ 5591810 (-)

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