ydjc (ydjc)



Basic Information


Item Value
gene id ydjc
gene name ydjc
gene type coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_053117.1
NCBI id CM020914.1
chromosome length 43979800
location 3830346 ~ 3844040 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence


>XM_039804163.1
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Function


symbol description
ydjc Predicted to enable magnesium ion binding activity. Orthologous to human YDJC (YdjC chitooligosaccharide deacetylase homolog).

NR:

description
carbohydrate deacetylase

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_039804163.1 True 3661 mRNA 0.46 6 3830346 3841961
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XM_039804166.1 False 3271 mRNA 0.44 6 3830346 3844040

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
pias2 pias2 coding downstream 13526 3799032 ~ 3816820 (-)
ptar1 ptar1 coding downstream 208866 3606395 ~ 3621480 (-)
apba1a apba1 coding downstream 227188 3555073 ~ 3603158 (-)
LOC120561346 NA coding downstream 475399 3315816 ~ 3354947 (-)
LOC120561352 gcnt4 coding downstream 515143 3311067 ~ 3315203 (-)
ak6 ak6 coding upstream 602 3844642 ~ 3848510 (-)
isl1a isl1,LOC103469637,LOC107374027,LOC107661270,LOC103141950,LOC102231175 coding upstream 258977 4103017 ~ 4109223 (-)
LOC120560167 NA coding upstream 617389 4461429 ~ 4471480 (-)
pnpla7b pnpla7 coding upstream 633235 4477275 ~ 4529746 (-)
dph7 dph7 coding upstream 687928 4531968 ~ 4543886 (-)
G58995 LOC104961333,LOC107396654,LOC101067868,LOC102226353,LOC108248341,LOC107088009 non-coding downstream 2920 3818433 ~ 3827426 (-)
LOC120561443 NA non-coding downstream 37828 3790420 ~ 3792518 (-)
G59000 LOC104943502 non-coding downstream 63911 3766191 ~ 3766435 (-)
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G59029 NA non-coding upstream 17804 3861844 ~ 3866088 (-)
G59039 NA non-coding upstream 51672 3895712 ~ 3896725 (-)
LOC120560115 NA non-coding upstream 141588 3985628 ~ 3992944 (-)
LOC120560054 NA non-coding upstream 255758 4099798 ~ 4102914 (-)
G59098 NA non-coding upstream 339313 4183353 ~ 4183917 (-)
G58994 NA other downstream 141008 3688629 ~ 3689338 (-)
G58920 LOC106099046,LOC107687292,LOC107712180,LOC107663003 other downstream 413492 3415627 ~ 3416854 (-)
G58919 NA other downstream 432850 3397169 ~ 3397496 (-)
si:ch211-102c2.4 NA other downstream 590283 3232606 ~ 3240063 (-)
tnc tnc,LOC104930867,LOC103356464 other downstream 695797 3049669 ~ 3134549 (-)
golph3a golph3,LOC103397487,LOC108249570 other upstream 365708 4209748 ~ 4224568 (-)
sub1b sub1 other upstream 580109 4424149 ~ 4430090 (-)
LOC120560375 NA other upstream 588804 4432844 ~ 4436316 (-)
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LOC120561494 NA other upstream 1745533 5589573 ~ 5591810 (-)

Expression



Co-expression Network