paqr3a (paqr3,LOC104954486,LOC103364579,LOC102780134)


Basic Information

Item Value
gene id paqr3a
gene name paqr3,LOC104954486,LOC103364579,LOC102780134
gene type coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053117.1
NCBI id CM020914.1
chromosome length 43979800
location 33779007 ~ 33790810 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>XM_039804183.1
ATTCAGGCAGTCTTTTGGGACAGCGGAGGGGTCCGTTACTGATGACGTCTCTGGTGATTTGGAAGATGTTGTAGCCGAAACTTGATGCACTGCGTTGTATATTAAATTAATGTTaatatatttaaacaaatgcGTAGTACGTACTATAAGCCACACAATGCAACAAATTGCACATATACAAAATTGAAAGTTTCAGGTCCGACTAAAACAGACTCCTCCAGCCCAGCCATGCCTCAGAAACCCCAAAAGAGCGCCCAGACTTCACACTACATTGAGCTGGGAGGTTATCAGTACTGGCCTGTGCTGGTGCCCCGAGGTATCAGACTGTACACCTACGAACAGATCCCAGTGTTTCTGAGGGAGAACCCCTACATCACAGATGGATACAGAGCCTACCTGCCCTCCAGACTGTGCATCAAAAGCCTCTTCATTTTATCCAATGAGACGGTAAATATCTGGAGCCATCTGTTGGGTTTCCTGCTCTTCTTCTTTGTCGGGGTTTACAACATGGTCTCAGTGCTGCCGGCCATCGGTGCCTCTAAAGAGGACTACGTCATCTACTGCATCGGACTCTTCTGCTTTCAGCTGTGTATGCTGTGTTCGGTGGGTTATCACCTTTTCTGCTGCCACCGCTCAGAGAAGACCAGCCGCCGCTGGATGGCGCTGGACTACGCGGGGGTTTCCATTGGCATTCTGGGCTGCTATGTCCCTGGAGTCTTTTACACTTTCTACTGCAATAATTACTGGCGGCAGGTGTACCTGGTGACGGTCCTGGCCATGATCCTGGCGGCCTTCTTCGCTCAGATCCACCCTCATTACCTCAGCAAGCAGTGGAAGCAGCTGCGCTCGCTCATCTTCTGCGTGGTGGCCGGATACGGCCTCATCCCCACCGTCCACTGGATCTGCATCACTGGCGGCTTCTCTTCAGAGCTCGTCCAGGCTTTTGTTCCTCGAGTCCTGGGGATGTATTTCATCGCTGCATTAGCTCTCATTTTCTACGTTTCAAAAGTTCCTGAACGCTACTTCCCGGGTCAGCTGAACTACCTGGGCTCCAGTCACCAGGTGTGGCACCTGCTGCTGGTGCTGATGTTTTACTGGTGGCACCAGTCGGCGTGCTTTATCATGTCGTACAGGCACAGCCAGCCGTGCCTCGACGCATCCCACCACGCCTAGGACGCTGCTCTCAACGCTGAGATCCCTGACTCTGTCAAACTgGTGGTGAATGGCTGCAGTGTATTCCAGCATGCACAGGTACAAGGCGAGGAGACACCATGGACAGGCCTTCAGTCCATCTCAGTGTCCCCACAGATGGACACATCAGCACCTGTCTTCAGTCCACCTGACCTGTGGAGGAAACCATCAGAGGGGCTGCAAACGGGAATCAGGCCTGTGACCCCCGGGATGAGAGGTGACACatgttgagtttgtttttaAGCTAAAACGGGACCTGTGGTTGAAACGAACACATTTTTTACCATCTTATCACCAGAAACTCAACTCAAACTATAAAATCTCCAGAATTTTCACTGCATCCCAATTTACATAACTGTAAAAGCAGCTTTCATCACCGATGCagcggcaaaaaaaaacaagactcaAATCAGtagcatttcctttttttataaGAGATCATGTTTTCTCTAAGTGCCTGTTAGTGAAACATCATGTAAGTCTGGTTCTGTAAAGGTTTGCTCTGAAGGCCCAATATCTCAACTAAttcactcatttttttttttaaaggtttaccTACAGTGGTTCTCAATCTGAGAGGTGTCCCCCCAAATCTATTTTGAATATAGTTCCACTTTATGATGATGCTTTTAAAAACAGCTTGTTCTGCCTGTAGGCTTCCTTCATTAAGTAATCAAGTAAAATGACCTTAAAAGGGAAACTTAAGTGTTTTAATGTCAACCCTCTGCACAGATGTTCAAAGTATGTGTGGAAATCTGTTTTTACAGTGTTAAGAGCTGTGGAGCTCGACCCAAATCATTTCTAACAGATTCATTTTATTTCCTAACTACTAGTCGTACAAGTTGTTTGTGGTGAAACTGTTAGGTATTTCCTAATGAGAACAAGCAAAAACTAACCAGTAATTAATTCATGTTTAGATAGGAAAACCAAAGACCGCTGTGGAGCAAAGCTCAATATGCTCATCAGTTTACATCACATTTTGATTGTTAATTTTGTCCATGAGTGTGCACAGTATTGATGTGTCTCACTGCTGAGAGACAAcagattgtttgttttaatcccAGGGTGGTGAAATGTACTTATTCTAAATACAGATACTACACAGAATCATGAGCTGTACAAGTACCTGGTCCTCCAGAATGTaatgcttttcttttcatgtattGGGGCTGCAATGCCTCAGTTCATCCTGGCATTTATATCACATCTGCACAGGATGTTTAGAGGGGAACAGCCTCAGTGTTCACTACTGGAATGTTTTCTTTGAGAAGTGTTTAAGTccagtttatttaaaaactgCGCTGAACCCCCTACGTTATTAAATAGTTTCTCGCTCTCATatcttcattttattatttttcggCACTAACCAGTGAAAGTTGAGACTTATTCAAATGGTGAGTGGTCAGCACGGCCTCTAGTGGCTGCTAGTAAGACTTTTAGGCCTTTTTTAAACTGTGTCCCAATTCTAAACTGATACTTGATACATGACTACACATGTTGACTTACATGTTGCATTACAAACTACATTTATTTCTTGAACACTAAAAGATAACTGTATCGTTTAGTCTACgtaacatacatactgtataggtAACTGACAAAAAGTTTCAGTTGCCTATATGTATCAGTGTTTAGCCACCTGCACTACACTGTCTCTACATGTGTATTGTGTATACTAACTGAAAATGATACAAGGCTTCAGccaatttcactttttttgagcGGTCTGGAGATGTAGCACCATTCACAATTTTCAACTCTTCTTTACAGCAGTGAGAAAATCCTTTCCATTTAAAAGTGATGTATTCTGCCATGTTACTGTAATTAATTTCAAGTAAGAATTAGTTTGAAGTTGGGACAcagttgtttttaaagattaaagcactgatttaacattttttaaatctgtatCCACGTGCATTGTAGTTCATATTGCAATGACTTTTCCCCACACTGTACATTCAGATGACTTTACTTTTTCTCTCTATAGTTTAGTACTGTAGTAACAACTGTTTAACTGCTTTTTCTGCCTGAAGTGAACTTTCGTTCAGACACCGTACTATTTCTCCAGCTCACTTAGGGTGATGTGCAATGTTAAAGGTCAACTGGTTTGTTATTGAATTGCTTCATTCCAAAATGCAACACAACCATGGTGGACAGAAGTCCTATTTTAACTTCAATGCTCAGAATTtcaaaacaaatgtttaaatgatCTCAAATGTTAGTTTTGGACTTTTGACTCTTAATGTTCATGCATTTCTGCTTGTCATTGTTTAATTACAATATCCAGTTAAATGGTAGCGGTCTCATTTTGGaatgaaagtcttttgtttgttttgtgtgtaataTTCAGTGTTTAAGTTTTAGGCCGATGACAAAATGTTCTCTAGTGTTAAGATTTCAGATTGCTTTTGTTGTTCTGTATTTAAATTATTCATTGTGAACCTGCTCTGTACTGTTtgtaaacatgttttctttgatAAGCTCTAAGAGACATCGGCTGTGTGTCTGACTCGTTTTGTAGCAGCGGAAATTTTGTATCTTGTCTTTTCATACCTGAGCAATCAAACTGCTGAACTTGACTCTAAATAAAATTTAACCATGTACTGTTTAAAA
>XM_039804184.1
TTATTCAGGCAGTCTTTTGGGACAGCGGAGGGGTCCGTTACTGATGACGTCTCTGGTGATTTGGAAGATGTTGTAGCCGAAACTTGATGCACTGCGTTGTATATTAAATTAATGTTaatatatttaaacaaatgcGTAGTACGTACTATAAGCCACACAATGCAACAAATTGCACATATACAAAATTGAAAGGTCCGACTAAAACAGACTCCTCCAGCCCAGCCATGCCTCAGAAACCCCAAAAGAGCGCCCAGACTTCACACTACATTGAGCTGGGAGGTTATCAGTACTGGCCTGTGCTGGTGCCCCGAGGTATCAGACTGTACACCTACGAACAGATCCCAGTGTTTCTGAGGGAGAACCCCTACATCACAGATGGATACAGAGCCTACCTGCCCTCCAGACTGTGCATCAAAAGCCTCTTCATTTTATCCAATGAGACGGTAAATATCTGGAGCCATCTGTTGGGTTTCCTGCTCTTCTTCTTTGTCGGGGTTTACAACATGGTCTCAGTGCTGCCGGCCATCGGTGCCTCTAAAGAGGACTACGTCATCTACTGCATCGGACTCTTCTGCTTTCAGCTGTGTATGCTGTGTTCGGTGGGTTATCACCTTTTCTGCTGCCACCGCTCAGAGAAGACCAGCCGCCGCTGGATGGCGCTGGACTACGCGGGGGTTTCCATTGGCATTCTGGGCTGCTATGTCCCTGGAGTCTTTTACACTTTCTACTGCAATAATTACTGGCGGCAGGTGTACCTGGTGACGGTCCTGGCCATGATCCTGGCGGCCTTCTTCGCTCAGATCCACCCTCATTACCTCAGCAAGCAGTGGAAGCAGCTGCGCTCGCTCATCTTCTGCGTGGTGGCCGGATACGGCCTCATCCCCACCGTCCACTGGATCTGCATCACTGGCGGCTTCTCTTCAGAGCTCGTCCAGGCTTTTGTTCCTCGAGTCCTGGGGATGTATTTCATCGCTGCATTAGCTCTCATTTTCTACGTTTCAAAAGTTCCTGAACGCTACTTCCCGGGTCAGCTGAACTACCTGGGCTCCAGTCACCAGGTGTGGCACCTGCTGCTGGTGCTGATGTTTTACTGGTGGCACCAGTCGGCGTGCTTTATCATGTCGTACAGGCACAGCCAGCCGTGCCTCGACGCATCCCACCACGCCTAGGACGCTGCTCTCAACGCTGAGATCCCTGACTCTGTCAAACTgGTGGTGAATGGCTGCAGTGTATTCCAGCATGCACAGGTACAAGGCGAGGAGACACCATGGACAGGCCTTCAGTCCATCTCAGTGTCCCCACAGATGGACACATCAGCACCTGTCTTCAGTCCACCTGACCTGTGGAGGAAACCATCAGAGGGGCTGCAAACGGGAATCAGGCCTGTGACCCCCGGGATGAGAGGTGACACatgttgagtttgtttttaAGCTAAAACGGGACCTGTGGTTGAAACGAACACATTTTTTACCATCTTATCACCAGAAACTCAACTCAAACTATAAAATCTCCAGAATTTTCACTGCATCCCAATTTACATAACTGTAAAAGCAGCTTTCATCACCGATGCagcggcaaaaaaaaacaagactcaAATCAGtagcatttcctttttttataaGAGATCATGTTTTCTCTAAGTGCCTGTTAGTGAAACATCATGTAAGTCTGGTTCTGTAAAGGTTTGCTCTGAAGGCCCAATATCTCAACTAAttcactcatttttttttttaaaggtttaccTACAGTGGTTCTCAATCTGAGAGGTGTCCCCCCAAATCTATTTTGAATATAGTTCCACTTTATGATGATGCTTTTAAAAACAGCTTGTTCTGCCTGTAGGCTTCCTTCATTAAGTAATCAAGTAAAATGACCTTAAAAGGGAAACTTAAGTGTTTTAATGTCAACCCTCTGCACAGATGTTCAAAGTATGTGTGGAAATCTGTTTTTACAGTGTTAAGAGCTGTGGAGCTCGACCCAAATCATTTCTAACAGATTCATTTTATTTCCTAACTACTAGTCGTACAAGTTGTTTGTGGTGAAACTGTTAGGTATTTCCTAATGAGAACAAGCAAAAACTAACCAGTAATTAATTCATGTTTAGATAGGAAAACCAAAGACCGCTGTGGAGCAAAGCTCAATATGCTCATCAGTTTACATCACATTTTGATTGTTAATTTTGTCCATGAGTGTGCACAGTATTGATGTGTCTCACTGCTGAGAGACAAcagattgtttgttttaatcccAGGGTGGTGAAATGTACTTATTCTAAATACAGATACTACACAGAATCATGAGCTGTACAAGTACCTGGTCCTCCAGAATGTaatgcttttcttttcatgtattGGGGCTGCAATGCCTCAGTTCATCCTGGCATTTATATCACATCTGCACAGGATGTTTAGAGGGGAACAGCCTCAGTGTTCACTACTGGAATGTTTTCTTTGAGAAGTGTTTAAGTccagtttatttaaaaactgCGCTGAACCCCCTACGTTATTAAATAGTTTCTCGCTCTCATatcttcattttattatttttcggCACTAACCAGTGAAAGTTGAGACTTATTCAAATGGTGAGTGGTCAGCACGGCCTCTAGTGGCTGCTAGTAAGACTTTTAGGCCTTTTTTAAACTGTGTCCCAATTCTAAACTGATACTTGATACATGACTACACATGTTGACTTACATGTTGCATTACAAACTACATTTATTTCTTGAACACTAAAAGATAACTGTATCGTTTAGTCTACgtaacatacatactgtataggtAACTGACAAAAAGTTTCAGTTGCCTATATGTATCAGTGTTTAGCCACCTGCACTACACTGTCTCTACATGTGTATTGTGTATACTAACTGAAAATGATACAAGGCTTCAGccaatttcactttttttgagcGGTCTGGAGATGTAGCACCATTCACAATTTTCAACTCTTCTTTACAGCAGTGAGAAAATCCTTTCCATTTAAAAGTGATGTATTCTGCCATGTTACTGTAATTAATTTCAAGTAAGAATTAGTTTGAAGTTGGGACAcagttgtttttaaagattaaagcactgatttaacattttttaaatctgtatCCACGTGCATTGTAGTTCATATTGCAATGACTTTTCCCCACACTGTACATTCAGATGACTTTACTTTTTCTCTCTATAGTTTAGTACTGTAGTAACAACTGTTTAACTGCTTTTTCTGCCTGAAGTGAACTTTCGTTCAGACACCGTACTATTTCTCCAGCTCACTTAGGGTGATGTGCAATGTTAAAGGTCAACTGGTTTGTTATTGAATTGCTTCATTCCAAAATGCAACACAACCATGGTGGACAGAAGTCCTATTTTAACTTCAATGCTCAGAATTtcaaaacaaatgtttaaatgatCTCAAATGTTAGTTTTGGACTTTTGACTCTTAATGTTCATGCATTTCTGCTTGTCATTGTTTAATTACAATATCCAGTTAAATGGTAGCGGTCTCATTTTGGaatgaaagtcttttgtttgttttgtgtgtaataTTCAGTGTTTAAGTTTTAGGCCGATGACAAAATGTTCTCTAGTGTTAAGATTTCAGATTGCTTTTGTTGTTCTGTATTTAAATTATTCATTGTGAACCTGCTCTGTACTGTTtgtaaacatgttttctttgatAAGCTCTAAGAGACATCGGCTGTGTGTCTGACTCGTTTTGTAGCAGCGGAAATTTTGTATCTTGTCTTTTCATACCTGAGCAATCAAACTGCTGAACTTGACTCTAAATAAAATTTAACCATGTACTGTTTAAAA
>XM_039804185.1
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Function

symbol description
paqr3 Predicted to enable signaling receptor activity. Acts upstream of or within negative regulation of neuron projection development; negative regulation of protein phosphorylation; and protein localization to Golgi apparatus. Located in Golgi apparatus.

NR:

description
LOW QUALITY PROTEIN: progestin and adipoQ receptor family member 3-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_039804183.1 False 3810 mRNA 0.42 8 33779009 33790810
XM_039804184.1 False 3806 mRNA 0.42 8 33779007 33790810
XM_039804185.1 True 4281 mRNA 0.41 8 33779271 33790810

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
prkg2 prkg2 coding upstream 434992 33303339 ~ 33344015 (+)
rasgef1ba rasgef1b coding upstream 484906 33156914 ~ 33294101 (+)
LOC120560373 LOC106570904 coding upstream 526600 33248404 ~ 33252407 (+)
wdfy3 NA coding upstream 708497 32957229 ~ 33070510 (+)
rusc2 rusc2,LOC104944866 coding upstream 877460 32854714 ~ 32901547 (+)
cnot6l cnot6l coding downstream 379665 34170475 ~ 34187620 (+)
slc25a25a slc25a25,LOC102778434,LOC103370741 coding downstream 482137 34272947 ~ 34280255 (+)
zdhhc12a zdhhc12,LOC100694502,LOC102293169,LOC101476542 coding downstream 490169 34280979 ~ 34289653 (+)
LOC120560630 set,LOC102777863,LOC107083999,LOC100696975,LOC105014167 coding downstream 519290 34310100 ~ 34314260 (+)
LOC120560629 LOC100693693 coding downstream 525496 34316306 ~ 34330925 (+)
LOC120561187 NA non-coding upstream 6473 33769844 ~ 33772534 (+)
G66571 NA non-coding upstream 23052 33755569 ~ 33755955 (+)
G66568 NA non-coding upstream 53225 33725520 ~ 33725782 (+)
G66522 bmp3 non-coding upstream 426057 33351699 ~ 33352950 (+)
G66521 bmp3,LOC102780994 non-coding upstream 428454 33349506 ~ 33350553 (+)
LOC120560041 NA non-coding downstream 85365 33876175 ~ 33877007 (+)
G66652 NA non-coding downstream 397020 34187830 ~ 34281929 (+)
G66689 NA non-coding downstream 640132 34430942 ~ 34439928 (+)
G66692 LOC104949787,LOC104934882 non-coding downstream 665680 34456490 ~ 34456749 (+)
G66695 NA non-coding downstream 695728 34486538 ~ 34486751 (+)
G66578 NA other upstream 2609 33775925 ~ 33776398 (+)
antxr2a antxr2 other upstream 175382 33517599 ~ 33603625 (+)
cds1 cds1,LOC103364266,LOC106922331,LOC103134889,LOC107386064 other upstream 666191 33077246 ~ 33112816 (+)
slc39a14 slc39a14 other upstream 1166069 32572200 ~ 32612938 (+)
LOC120560610 ypel1,ypelc,YPEL1,ypeld,LOC103374080,LOC106586007,LOC106931471 other upstream 1268270 32477038 ~ 32510737 (+)
cfap157 NA other downstream 723200 34514010 ~ 34527405 (+)
LOC120561070 NA other downstream 975120 34765930 ~ 34773806 (+)
G66832 NA other downstream 1070689 34861499 ~ 34864690 (+)
LOC120561428 fam163b,LOC103374717,LOC102797860,LOC101061299,LOC102298266,LOC101485828,LOC104964271,LOC102215914 other downstream 1256034 35046844 ~ 35059631 (+)
LOC120560625 cep120 other downstream 1731855 35522665 ~ 35549231 (+)

Expression


Co-expression Network