khdrbs3 (khdrbs3,LOC107687064,LOC107727300,LOC107566726,LOC102789115)



Basic Information


Item Value
gene id khdrbs3
gene name khdrbs3,LOC107687064,LOC107727300,LOC107566726,LOC102789115
gene type coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_047603.1
NCBI id CM018549.1
chromosome length 29458963
location 3702496 ~ 3816623 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence


>XM_026909875.2
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Function


symbol description
khdrbs3 Is expressed in brain; eye; and testis. Orthologous to human KHDRBS3 (KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3).

NR:

description
KH domain-containing, RNA-binding, signal transduction-associated protein 3-like

GO:

id name namespace
GO:0003723 RNA binding molecular_function

KEGG:

id description
K14942 KHDRBS3, SLM2; KH domain-containing, RNA-binding, signal transduction-associated protein 3

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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LOC113523857 NA coding upstream 338148 3364215 ~ 3364348 (+)
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LOC113523835 LOC108274547,LOC107554574,LOC107669946,LOC107727308 coding downstream 193296 4009919 ~ 4046648 (+)
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map7d1b map7d1,LOC108274711,LOC108438234,LOC107734037,LOC107551771,LOC107669943 coding downstream 720873 4537496 ~ 4593588 (+)
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fhl3b fhl3,LOC108438237,LOC107734040,LOC107551770,LOC107681628 other downstream 668210 4484833 ~ 4509248 (+)
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LOC113547098 deptor,LOC108274614,LOC108442483,LOC107685573 other downstream 2770588 6587211 ~ 6593605 (+)
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LOC113547145 NA other downstream 2966893 6783516 ~ 6785437 (+)

Expression



Co-expression Network