bnip2 (bnip2)


Basic Information

Item Value
gene id bnip2
gene name bnip2
gene type coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047603.1
NCBI id CM018549.1
chromosome length 29458963
location 16443455 ~ 16458395 (-)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

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Function

symbol description
bnip2 Predicted to enable exopolyphosphatase activity. Predicted to be involved in apoptotic process and polyphosphate catabolic process. Predicted to be active in cytoplasm. Orthologous to human BNIP2 (BCL2 interacting protein 2).

NR:

description
BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 2-like

GO: NA

KEGG:

id description
K18448 BNIP2; BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 2

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_034307284.1 True 3648 mRNA 0.42 12 16443455 16458395

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
otud7a otud7a,LOC108275340,LOC107715690,LOC107659507,LOC107752330,LOC107698115,LOC107550219,LOC107598848 coding downstream 81080 16325942 ~ 16362375 (-)
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etfbkmt etfbkmt other upstream 1844747 18303142 ~ 18305329 (-)
LOC113530223 NA other upstream 1846243 18304638 ~ 18304801 (-)
parp6b parp6,parp6b,LOC108275327,LOC108436940,LOC107661437,LOC107753615,LOC107598827,LOC107665100 other upstream 1895579 18353974 ~ 18364036 (-)

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