slc41a2a


Basic Information

Item Value
gene id slc41a2a
gene name NA
gene type coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047603.1
NCBI id CM018549.1
chromosome length 29458963
location 18245570 ~ 18254770 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>XM_026919581.2
TTAATACGGGCGCGAAACTCGTGATTTGGTCTGTAATGTCTTTGCTCAGTAATTTCTGCTGTTGCACTAGCATGAGATTTCAAAGTAAAAGTGGACTACGAAGAACAAACACAGCTTGCATATACcagcAGTGCTGCACCTCAGGGACCTGACAGTGGAAAGATCTGCTCTCACCCAACAGCAGTGTTGTGGCTTTGCTTAGAGGATGGATGATGGTCAAACAACTATTCAAAAGCGTTACATTAAAGCTTCTCctttactacacacatataaaacattaaaaaaatcttaggGCATATCATAATTTAAATGACTTCCTGGTAGGATAAAATTCTATACATGGGCACAACACAGTATAAGCAAGGTTAGTAACTTTAGCAAATTTAGCACATTTTGCAAAGTTTTATGAAGACCATGAATTCAGTTGGTGGTCCTAATCAGCATGAAGGAAAATGGACATCAGCTGATTTAGAGGTTAGAGATGATGAGAATCAGAATATTCCTTCTCTATGGTATGGAGGAATTGACAAATGCTTGGGTCTCACCAACAGTAACACTAGAAATATAGACAAGGGGTACTCTGAGTTGGACCCCTTGCTTCCTAATGATCATTCGTGGCCCTCAGTCCATGATGAGGAACAAGCGTCCACTGGTGCTCAGGCCATGCCGAGCGAATCATACTGTACCATGGTGCTTCAGATCCTGGCTCCATTCCTCCTGGCAGGCTTTGGTACAGTAATGGCTGGCATGCTGTTGGACATTGTGCAGCACTGGGACGTGTTTCAGAAAGTAACAGAGATCTTCATCCTGGTGCCGGCATTACTTGGCATGAAAGGCAACCTGGAGATGACACTGGCATCAAGACTCTCTACAGTGGTGAATGTTGGCAGAATTAACTCCTCAAAAGAGAAGTGGAAACTGATCATTGGAAATCTTGCCCTCAAGCAgGTTCAGGCTACAGTGCTGGGTTTCCTTGCAGCAGTGGCAGCCTCTGTACTTGGATATGTTCTGGATGAGAAATTGACCATAAATGGTACAGCAATGTTATGCTGCAGTGGTGTAGTGACAGCATTCATGGCATCGTTACTGCAAGGTATCATTATGGTGGGTGTGATTATTGGCTCAAAGAGGACCGGGATTAATCCTGACAACATAGCAGCACCAATTGCGGCTAGTTTTGGTGACCTCATCACTTTGGGGTTGCTTGCCATCATCAGTCAAAGGCTTTTCTCTTGCATtgaACTCTACCCCTATATTATCTACGTAGTGTGTGTCGTCTTTCTGTGCCTGACACCAGTCTGGGTAATAATTTCGTTTTGTCACTCTGAAAGCCACAAACTGCTGTACAATGGTTGGGAACCCATAATCACAGCCATGGTTATCAGCAGCATAGGTGGACTTATCCTGGACAAAACCATTACTGACTCAAACTTAGGAGGAGTAGTGGTTTACACCCCGGTGATAAATGGTGTTGGTGGTAACCTGGCTGCCATCCAGTCCAGCCGTATAGCCACGTATCTACATTTTCACTGCTCCCTGGGAAGGTTGCCTGAGGACGCAAAGTGCTGTTACTGTCCATTCCGAACCTTTTACGGCAAAgGATATAACAACAGAACAGCTCGGGTGCTGCTTCTTTTAGCCATTCCAGGCCATGTGgtctttctctttattatttatctaatgCAAGGTGCCAACACCAGCCCAACACCAACCTTCATCACCCTCTACTTGGTTGCAGCTCTAACACAGGTATTTATACTGTTGTGCATAGCTGACTGGATGGTTCACTGCTTGTGGAAGTATGGCCGAGACCCAGATAGCTTTTCTATCCCCTATTTGACAGCCTTGGGGGATCTACTGGGCACTGGCTTGTTAGctctttgtgtttttgctgtggGCGAATAATGACAATGGACACACTCTTGGATGAAATGGATTTACCAGGAAATTTACGGGCTATATcttaaactattatttattttcacataatttttaTTGTTACTAATTCTTTATCTTTGTTAGACTCTCCTCTTGTTCACTGGAGCTACTGAAGCATGAATACATATTTCCAAGCCATTGCTGAGACACCTCAGCCACTTTGTACAGCAATATTAATTACTTAGTAAGTCTTATGAGTGATACAAAGTTAAGGACATTTTTTATCATTCTATCAATATTATCAATTattatgttcatatttttttaacagtccATATACTTAAAATGTCTCTACTTTCCAACCCTTTCTAGAAGTCAAAAGTCAGCAAGTTGTAACATAAACGGAATGTAGCAAACTGAATCaatcatgctttttatttatgatgGGGACATACACACGTATGTGAAGCACCAAAAACAATTGCTGGCTGATTTTGACTGTCAGCACATAAATGATCAGAAAAGCTTACCTTTTTCCAGAACATGAGAAtgaaaaaatctttaaaatcatctttaaaggttctaaatctttaaagtttttaaagtttaaagaatCTGATAGGTCAAAAATATAACAGAATACAAACCCTGATTATACTCTGATTATATACTGATTACTCC
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Function

NR:

description
solute carrier family 41 member 2-like

GO: NA

KEGG:

id description
K15122 SLC41A; solute carrier family 41

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_034307360.1 False 2482 mRNA 0.41 13 18245858 18254770

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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si:ch211-106e7.2 NA coding downstream 22141 18276911 ~ 18296702 (+)
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pim3 pim3,LOC108275436,LOC108436897,LOC107716739,LOC107598820,LOC107696273,LOC107573827 coding downstream 232714 18487484 ~ 18490931 (+)
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G150932 LOC108436944 non-coding downstream 170547 18425317 ~ 18444052 (+)
G150952 NA non-coding downstream 275369 18530139 ~ 18530708 (+)
tmem17 tmem17,znf774,LOC107678976 other upstream 61537 18182554 ~ 18184033 (+)
G150589 LOC108274445 other upstream 403035 17834237 ~ 17842535 (+)
LOC113529564 ano9,LOC108442698 other upstream 2422979 15807990 ~ 15822591 (+)
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G151401 NA other downstream 1005854 19260624 ~ 19263893 (+)

Expression


Co-expression Network