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Basic Information

Item Value
gene id map11
gene name c7h7orf43,cunh7orf43,si:dkey-3k24.5,LOC107687048,LOC107594676,LOC107754664,LOC107561780,LOC105895567
gene type misc
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047598.1
NCBI id CM018544.1
chromosome length 33267568
location 17792226 ~ 17839915 (-)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>TU78662
AGGCCGTGGGCAGAAGGAGGACCCGGCAGTAAATGCAGTAGTGTGTCATTCTCCTCTAAGTAACCTTGGTTACTGTCGCAAAGGCagcactctctctgtctctgtggcCTTCCAGATCCTCAAAGCTGGCCTCTTTGagCTGAGTCAGCACATGAAACTAAAGCTGCAGTTTACAGCATCCGTGTCGAACCCGCCCCCTGAAGCCCGTCCTCTCTCACGTAAGAACAGTCCGTCCAGTCCTGCTGTACGAGACATACTGGACCGACACCAGGCCAGCCTGAGCCTGGGCCGCTCGCAGTCTTTCTCCCATCAGCAGCCCTCCAAGTCCCACCTCACCAGGACAGGCAGTGTTATGGAACGGCGTGCAATCACTCCTCCTGTCGGTTCTCCTGTCGGTCGGCCACTCTACCTCCCCCCGGAGCGGAGCATTTTATCGCTCGACAAGATCGCCAAGCGCGAGTGCAAAGTGCTGGTGCTGGAGTCACACAgctaaatgtacacacacacacgcacacacacacaaatgcatcaCTGGGAAGAATAGGAAGCGTCACACTGGAATTTAATTTTGAAATCTTAGTTGTAGTGAGTTGTTAATTATCCAACTTGAACTGATTTGTTCTGGAAAAGTGTAACGTGGAATGTTTAAGGTTCTCTGTAATGTAGCAGACACAGGGTCTTTTAGTTTTAGTAGTGTTCAAGTGAGGGGTTGATTTTTATGTTTCTACACGTTCATTGTTTACATGCTGTGCATTAAGGCTCCGCATCTGCTTTCAGATCAGGCGCAAAATATGCTACTGTCTACTGACATCATTCTGAAAGGCAGGTAAAATAAGAACACAGAAATGCTGTAATCCACAAACTTATGAAGTAGTTCAGTCACTTTAAGGCCTTGTTTTAAATTTGTCACTCCTTAATTCAGTGCACAGTGCACTATGTGAAGACTAGTGTCTGAGGAAACACATGGGGTCATGAACCTGGAATTGACTGGAAGTCAACCTGCCTGAATGTTTGTTTATAACATTTGTGAGTCAGTCTTTTCTGACTGTTCTCTATTACAGTATGCTGTTCCACTGACCTCCACCAGTggataccttttttttttttttaatttttaaaattatttctgaatgtaaatgtatttatttatttttcgtGGTCTTGCCAGTCTTAATATCTACATCCATTCCTTTGCTCCTGCGCAATCctttgtatttctttgttttaatgttttaatatatatatattgtttatttatgagCCTTTAAATTGATTGGGTTTTTTGATTATTGATACCTGATATAAGCTGCTATTATGTATCACAGTACATTTCAATCTTAAGTGTTGTTTTTGGGAAACTTAAATGCAAATTCCTGAGGCAGTGCAGCGTCTGTTTTTGACTGTCTCTTTGACTGACTATGATCctgatggttaaaaaaatgttctgaaaggccaaattaaaatattatgcaaTCTTTGGATGGAAACTACAGTGCCCTAGTGTAGCATAGTCTTTGATATTAGTAACATTCTCACACATAACAGCTTCCTTCTCTAATACATGATTGTTATACATATAATGGAATATGGAATGTTCTCTCTTGATCTCAGCCATATCCAGCTTGAGGTCCCCCCCCTCCACCCTCCCCTTTCTCATAGTGCTTTGCTTGACATAAGCACTctccctcatacacacacatacacacaaccatGCCGATGCCCACAGGTGAGTTGATGAGCCACTTTATGTTCCTCCTGGTGGGCGTCATGTTGTCTGAcatcattttgatttatttctatGCTTTATACTTATATTCAATGAGTCCTATGTTCCAGTTCTGTGCTCCAGCGGTGGCTACCAGCACCATGTTATTGATTTGTGTGTATTGATTTTGTGCCGGTCTTTGGGGGCAGATGCTGACATGCCTCTCAGCTGTATTGATAATTGAACAGAAGGCTTTAAGCCCCCCTGCCTGATTTCACATTACAATCATTGCATGACTGATCTGATTTGACCCCTTGAATAGAGAATTGGTGTGCATTAATATTCAGTGCTTGTATGATGAGGACCTGTTTGTTTGTATTCCATAACAAAATTTTAGCTAGACAGTGCAGCTACCTGCTTAAAAGCTCTCTCTTTTGCAGTTCTCTGTGGTCTAATATCTACAAGTATGATCAACCTGACTGACCTACTTTACTGTATGAGGCACGAAAATGTGATCATAATGCCATAGCTTCAGTAAGAAGAACTCCTCTCGTTATTTCAATGTTCAACAAACTATTTCAAACTTTGGACTTGAAGTTGATACTACTCCATAAATATGCTCAATACATGaagtttcatgttttattattttgtattttttttgTATTACAT
>XM_026936039.2
TTGGGTTTCAGCTCCTTAGCTGTACGCCATCGTGATTCGATTAATAGGCCTGCAGGCTGGTTTGAATGTACCACAGGAGCTGACAGAACAACGACATGGCCCAAAACAGGCtgtattttaattgtatttattgcGGATAATTGTCATGTAAATAGACCTACACGAGAGACGAATCAGGGCGATTCGATGATTTATGTCTGGGGAGAGGATGTTTTCCCGCTGCTAGTTAAACAGGCCACCCGGATCTATTAGCTTAGCTGGCTAGCTCTCTGCTTTCGCGGTGATAATAACATCCCAGTCATGGTTTTGATGATGGAATCGCAGTGCGAGTATTTTATGTATTTCCCCGCCGTGCCCATTTCCGACCTGTCAGACCCGGCTCGGTACCGCAGCCTCCCGCGCCGCAGCCATCTGTACCTGGGGGAGACGGTGCGCTTCCTGCTGGTGCTGCGCGCGCAGAGCGGCTCGGGCTCCGGGTGCAGTGAGGAGCGCGCGGGCCGCGGCTGGCGGGAACTGGCTGCGTCTCTGCGCGCGCTCGCCAGCGTGTGTCCGGGTGAGAGCAGGGCGCGGGGGAGAGAGCGTTCCGGGGAAGATGCAGCCGAGGAGGAGGagagtgatgaagatgatggagCGGCGAGCTGCTCAGCCAGAGGAGCCACGACATACCGGGGATTCAGGGAGTGTAAGCCGCTTCTCATCCACAATAACCCCGGTAACGGCGCCAGGGAGTTCCGCAGAGCTCCGGTGCAGTCACCTGTGGATGAGCCAGTGGTTCTGAATGATGAAGTCATCTTCCCCCTGACTGTGTCCTTGGATAAACTCCCAGTCAACACACTCAAAGTGAAGATCATAGTGACTGTATGGaaacaggaggaggagaaggcTGAGATCCAGGAACATGGCTACCTCAGCATTCTTCAGCAGAAGAGCCCGTGCCAAACCTTCCGCCAGGACCTCAACACCTTCAAAGCCCAAGTCAGCACCACTCTAAACGTCCTTCCTCCACCCACAGTGAAGTGTCAGCAGATGACTGTGTCTGGAAAGCATCTGACTGTACTTAAAGTGTTAAACGGAAGCTCTCAGGAGGACGTGTGTGTACATGATGTACGAATCCTGCCCAACTTCAATGCCTCTTATTTACCCATGATGCCTGATGGCTCCGTGCTGCTGGTCGACAATGTGTGCCATCAGTCAGGTGAGGTTGCCATGGCGTCCTTCTACAGGATGGACAGTGAGTCTAGTCACCTTCCCAGCATGCTCAGTGCTCTAGAGCAGcaaaacttcctgtttcaaCTGCAGCTCAGTGACCAGGCCCAGGATGATTCTAATGAGGGTCTTGAGGTGCCACTGATAGCAGTCCTCCAGTGGTCCACTCCCAAGCTGCCATTTACCAGCtccatctacacacactacagtgtgcCTAGCATCAGACTGGACCGGCCTCACTTCATCATGACCGCAAGCTGCCCCAGTGCCGTAAGAGCTCACGAGCACTTCAGAGTGCGCTACACACTCCTCAACAACCTGCAGGACTTCCTGGCTGTACGGCTCGTCTGGACACCAGAAGGCCGTGGGCAGAAGGAGGACCCGGCAGTAAATGCAGTAGTGTGTCATTCTCCTCTAAGTAACCTTGGTTACTGTCGCAAAGGCagcactctctctgtctctgtggcCTTCCAGATCCTCAAAGCTGGCCTCTTTGagCTGAGTCAGCACATGAAACTAAAGCTGCAGTTTACAGCATCCGTGTCGAACCCGCCCCCTGAAGCCCGTCCTCTCTCACGTAAGAACAGTCCGTCCAGTCCTGCTGTACGAGACATACTGGACCGACACCAGGCCAGCCTGAGCCTGGGCCGCTCGCAGTCTTTCTCCCATCAGCAGCCCTCCAAGTCCCACCTCACCAGGACAGGCAGTGTTATGGAACGGCGTGCAATCACTCCTCCTGTCGGTTCTCCTGTCGGTCGGCCACTCTACCTCCCCCCGGAGCGGAGCATTTTATCGCTCGACAAGATCGCCAAGCGCGAGTGCAAAGTGCTGGTGCTGGAGTCACACAgctaaatgtacacacacacacgcacacacacacaaatgcatcaCTGGGAAGAATAGGAAGCGTCACACTGGAATTTAATTTTGAAATCTTAGTTGTAGTGAGTTGTTAATTATCCAACTTGAACTGATTTGTTCTGGAAAAGTGTAACGTGGAATGTTTAAGGTTCTCTGTAATGTAGCAGACACAGGGTCTTTTAGTTTTAGTAGTGTTCAAGTGAGGGGTTGATTTTTATGTTTCTACACGTTCATTGTTTACATGCTGTGCATTAAGGCTCCGCATCTGCTTTCAGATCAGGCGCAAAATATGCTACTGTCTACTGACATCATTCTGAAAGGCAGGTAAAATAAGAACACAGAAATGCTGTAATCCACAAACTTATGAAGTAGTTCAGTCACTTTAAGGCCTTGTTTTAAATTTGTCACTCCTTAATTCAGTGCACAGTGCACTATGTGAAGACTAGTGTCTGAGGAAACACATGGGGTCATGAACCTGGAATTGACTGGAAGTCAACCTGCCTGAATGTTTGTTTATAACATTTGTGAGTCAGTCTTTTCTGACTGTTCTCTATTACAGTATGCTGTTCCACTGACCTCCACCAGTggataccttttttttttttttaatttttaaaattatttctgaatgtaaatgtatttatttatttttcgtGGTCTTGCCAGTCTTAATATCTACATCCATTCCTTTGCTCCTGCGCAATCctttgtatttctttgttttaatgttttaatatatatatattgtttatttatgagCCTTTAAATTGATTGGGTTTTTTGATTATTGATACCTGATATAAGCTGCTATTATGTATCACAGTACATTTCAATCTTAAGTGTTGTTTTTGGGAAACTTAAATGCAAATTCCTGAGGCAGTGCAGCGTCTGTTTTTGACTGTCTCTTTGACTGACTATGATCctgatggttaaaaaaatgttctgaaaggccaaattaaaatattatgcaaTCTTTGGATGGAAACTACAGTGCCCTAGTGTAGCATAGTCTTTGATATTAGTAACATTCTCACACATAACAGCTTCCTTCTCTAATACATGATTGTTATACATATAATGGAATATGGAATGTTCTCTCTTGATCTCAGCCATATCCAGCTTGAGGTCCCCCCCCTCCACCCTCCCCTTTCTCATAGTGCTTTGCTTGACATAAGCACTctccctcatacacacacatacacacaaccatGCCGATGCCCACAGGTGAGTTGATGAGCCACTTTATGTTCCTCCTGGTGGGCGTCATGTTGTCTGAcatcattttgatttatttctatGCTTTATACTTATATTCAATGAGTCCTATGTTCCAGTTCTGTGCTCCAGCGGTGGCTACCAGCACCATGTTATTGATTTGTGTGTATTGATTTTGTGCCGGTCTTTGGGGGCAGATGCTGACATGCCTCTCAGCTGTATTGATAATTGAACAGAAGGCTTTAAGCCCCCCTGCCTGATTTCACATTACAATCATTGCATGACTGATCTGATTTGACCCCTTGAATAGAGAATTGGTGTGCATTAATATTCAGTGCTTGTATGATGAGGACCTGTTTGTTTGTATTCCATAACAAAATTTTAGCTAGACAGTGCAGCTACCTGCTTAAAAGCTCTCTCTTTTGCAGTTCTCTGTGGTCTAATATCTACAAGTATGATCAACCTGACTGACCTACTTTACTGTATGAGGCACGAAAATGTGATCATAATGCCATAGCTTCAGTAAGAAGAACTCCTCTCGTTATTTCAATGTTCAACAAACTATTTCAAACTTTGGACTTGAAGTTGATACTACTCCATAAATATGCTCAATACATGaagtttcatgttttattattttgtatttttttgtattacatcATAGGAATCAAATTGGTACATTTATCATATGGGttattgaagtttttttttttttcatctaagCACTTTATTGCAATTCTTTTATCTTTCTTGGATTGTCATTGGATTGTTTGATTGCTGATGTCTAAAGGTTTACTCTTATCTGAAGTGTTTAAATtgcaaaatg

Function

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein C7orf43 homolog

GO: NA

KEGG:

id description
K24261 MAP11; microtubule-associated protein 11

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU78662 False 2377 TUCP 0.41 4 17792226 17830126
XM_026936039.2 True 4108 mRNA 0.46 10 17826640 17839915

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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zgc:77439 LOC108268285,LOC108443975,LOC107666303,LOC107561800,LOC107750567,LOC107669018 coding downstream 22340 17765148 ~ 17769886 (-)
serpine1 serpine1,LOC101154654 coding downstream 40587 17747955 ~ 17751639 (-)
ap1s1 ap1s1,LOC105921790,LOC107666294,LOC103148860,LOC107593725,LOC108443977 coding downstream 45091 17737776 ~ 17747135 (-)
LOC113539922 snapc2 coding downstream 140306 17648230 ~ 17651920 (-)
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her8a her8a,LOC108267186,LOC108262021,LOC107750660,LOC107563304,LOC107754663,LOC107666285 coding upstream 28712 17868627 ~ 17870914 (-)
LOC113539930 LOC108268343 coding upstream 35252 17875167 ~ 17880384 (-)
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LOC117597047 snapc2 non-coding downstream 199756 17591839 ~ 17592470 (-)
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LOC113540242 adamtsl1 other upstream 1210235 19050150 ~ 19155221 (-)
zgc:112271 bola2,LOC105907194,LOC108436240,LOC105020731,LOC107569065,LOC106511278 other upstream 2040053 19879968 ~ 19881640 (-)
G67587 NA other upstream 2048264 19888179 ~ 19888726 (-)
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snrpf snrpf,LOC106609479,LOC107738052 other upstream 2122667 19962582 ~ 19965851 (-)

Expression


Co-expression Network