LOC117597085



Basic Information


Item Value
gene id LOC117597085
gene name NA
gene type non-coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_047598.1
NCBI id CM018544.1
chromosome length 33267568
location 23654922 ~ 23767863 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence


>TU82695
tgtgtgtgtgtgtgtgttgaggagcACATGGACGACAGAGGACGAGATTTAGCAGCGCTGCTAATTAACGCAGCCCATCGCCTGGGAAAAATGGGCAACGCAGGACGCATTTAAACACCGGGAATGCCGTCACAGGGTTGTGTTTCACGTCAGACGAGCAAAAAATGctcTGAACACCTCTGCCTTTTTGACTCCGTTTTGGATGAGAGATCATACAAAGGAGCATCCTCAGGAAAAATCATGAAAACTTGTCCCACAAGGCCTGCAAGTTTTGTGCCGGAATAgcttggtatttggagctatccacaATTCCCTCTATATCGACTaaagccccagtcccagctgaagagaagcagccccattgcataatgctgccaccaccatgcttcaccatggCCTCATGTCCTCCCGATGAAGCTGTTTCGACAGGGGGTCAGGATATTGATAAAGGACACTCGAGGCTTACATTAGATGACCGACTAAGAAGAAGAAGTCACTGCAGGAGAGGAGAAGCGAGACCTTCATATCTATCTGCTTACACATACCTTGAGCTCATCGAAGCGCAGAGTGAAGTGGAGGATCTCTGCGAATTGGCGTGCCAGAGCCTGCTCCTGCTCCAAGTGCTGTGTGGGGCTGCAGCGTGCACTCGTTAGGAATCCCAGCAGGCCATGCAGGGCACCTTCTGCACAACCGAGACAACAGACAAAGAGACCTACTGCATTTTGGTGCTGGAACTGATCCAGTTGTGGCGACTGTGAAGCAGCTCTTTTGTGGTGTAAATGCACAGAACAGTTGGAGATTAAACACCAGCTATGGAACCAGCCCCAGCAGCTTGATTTTGGAAAAGTGCTTTTGCATGACACTGTCCTTTATGCCCTGCCTATACATATTTCATACATTCACCTGTCTAATGGCTTCTCCAGCTCCACTGTAGGACTGCAGATCCTCTAAAACACTCATGGCCTCCATCAGAACCTTGTTCACCTGTTCCCATAACTCCCTCTCTGCCTCAGTGGGCTGAGCATCTGTGAAAACAGCAGCACTTGGttacaccctcacacacacacacacacgcaggcacGCACATGCATGAATGTACAGTCAGGTTCAGAAGTCTGAGTCCACTAGCAACAactggttttatttcatttcatcatgtaTACAAAATGTTACAACAGACGTTTTGCCATTTGAGATCACCCAGTATGAAACAGACATATAGCTGAATGCTCTGTTAGCACAGTGattcttttctgtttaaaaactgTTGTGATTTCATTGTAACACACTTGCTTTCAAGTTTTAATTGTTGAGATGACAGTGTCCCAACCTTGCATCGTTTTACTTTTTGGagaaatatatttgttatagtaaaataaacacactacatAAACTTACTTTCAAAGTCCAGGAAAAAGTTCCCCGCATTGTTGTCGATGTCCCTCGTCAGAACCTTGATCAGATTCCCCATGCCGTCCAATCAGAAACCTGACGAGAGGAAGAGGAGTGAATTAGTGACACATCCCACTGAGAACATAAAGATCATATTA
>TU82696
tgtgtgtgtgtgtgtgttgaggagcACATGGACGACAGAGGACGAGATTTAGCAGCGCTGCTAATTAACGCAGCCCATCGCCTGGGAAAAATGGGCAACGCAGGACGCATTTAAACACCGGGAATGCCGTCACAGGGTTGTGTTTCACGTCAGACGAGCAAAAAATGGTCATGACCTGCGGCCTGCTTCCTCCTGATGATGCGACGCGTGATGTCACCACCACCGCAAGCTCCTATTGATGAACTTTGACAAACCGGGGCCCCTAATAACTGAAGACTCGTCACCCTCATCCGCTTGATGCCATACATCTCTTACCTAAACATATGTTCACCCTAGTAGGCCGCAAGTCGCTCGTGCCTCTTGTCGCTTGTGGGTCAAGTTCCAATGAGAAATGGTAGTAGCTATGTATAGCTTCTAAAGCTCAGTAATTAAACACCTATTAAATAAAG
>TU82697
tgtgtgtgtgtgtgtgttgaggagcACATGGACGACAGAGGACGAGATTTAGCAGCGCTGCTAATTAACGCAGCCCATCGCCTGGGAAAAATGGGCAACGCAGGACGCATTTAAACACCGGGAATGCCGTCACAGGGTTGTGTTTCACGTCAGACGAGCAAAAAATGTTCTGTCATCAGGGGCCTGCTACTGGAGGAAAGCCTGCGCAGAGGATGTAGGTGTAAACAGCAGAGCTCTTGGTCTTTTCACATTTGCCATAATGctcTGAACACCTCTGCCTTTTTGACTCCGTTTTGGATGAGAGATCATACAAAGGAGCATCCTCAGGAAAAATCATGAAAACTTGTCCCACAAGGCCTGCAAGTTTTGTGCCGGAATAgcttggtatttggagctatccacaATTCCCTCTATATCGACTaaagccccagtcccagctgaagagaagcagccccattgcataatgctgccaccaccatgcttcaccatggCCTCATGTCCTCCCGATGAAGCTGTTTCGACAGGGGGTCAGGATATTGATAAAGGACACTCGAGGCTTACATTAGATGACCGACTAAGAAGAAGAAGTCACTGCAGGAGAGGAGAAGCGAGACCTTCATATCTATCTGCTTACACATACCTTGAGCTCATCGAAGCGCAGAGTGAAGTGGAGGATCTCTGCGAATTGGCGTGCCAGAGCCTGCTCCTGCTCCAAGTGCTGTGTGGGGCTGCAGCGTGCACTCGTTAGGAATCCCAGCAGGCCATGCAGGGCACCTTCTGCACAACCGAGACAACAGACAAAGAGACCTACTGCATTTTGGTGCTGGAACTGATCCAGTTGTGGCGACTGTGAAGCAGCTCTTTTGTGGTGTAAATGCACAGAACAGTTGGAGATTAAACACCAGCTATGGAACCAGCCCCAGCAGCTTGATTTTGGAAAAGTGCTTTTGCATGACACTGTCCTTTATGCCCTGCCTATACATATTTCATACATTCACCTGTCTAATGGCTTCTCCAGCTCCACTGTAGGACTGCAGATCCTCTAAAACACTCATGGCCTCCATCAGAACCTTGTTCACCTGTTCCCATAACTCCCTCTCTGCCTCAGTGGGCTGAGCATCTGTGAAAACAGCAGCACTTGGttacaccctcacacacacacacacacgcaggcacGCACATGCATGAATGTACAGTCAGGTTCAGAAGTCTGAGTCCACTAGCAACAactggttttatttcatttcatcatgtaTACAAAATGTTACAACAGACGTTTTGCCATTTGAGATCACCCAGTATGAAACAGACATATAGCTGAATGCTCTGTTAGCACAGTGattcttttctgtttaaaaactgTTGTGATTTCATTGTAACACACTTGCTTTCAAGTTTTAATTGTTGAGATGACAGTGTCCCAACCTTGCATCGTTTTACTTTTTGGagaaatatatttgttatagtaaaataaacacactacatAAACTTACTTTCAAAGTCCAGGAAAAAGTTCCCCGCATTGTTGTCGATGTCCCTCGTCAGAACCTTGATCAGATTCCCCATGCCGTCCAATCAGAAACCTGACGAGAGGAAGAGGAGTGAATTAGTGACACATCCCACTGAGAACATAAAGATCATATTA
>TU82698
tgtgtgtgtgtgtgtgttgaggagcACATGGACGACAGAGGACGAGATTTAGCAGCGCTGCTAATTAACGCAGCCCATCGCCTGGGAAAAATGGGCAACGCAGGACGCATTTAAACACCGGGAATGCCGTCACAGGGTTGTGTTTCACGTCAGACGAGCAAAAAATGAAGTTAGGCTATAATTAACCATACCACTGCTGAGAGCTTTACGAAGGATTTACAAAGCCGAGTCCTTCTGCGCAGGTCATGACCTGCGGCCTGCTTCCTCCTGATGATGCGACGCGTGATGTCACCACCACCGCAAGCTCCTATTGATGAACTTTGACAAACCGGGGCCCCTAATAACTGAAGACTCGTCACCCTCATCCGCTTGATGCCATACATCTCTTACCTAAACATATGTTCACCCTAGTAGGCCGCAAGTCGCTCGTGCCTCTTGTCGCTTGTGGGTCAAGTTCCAATGAGAAATGGTAGTAGCTATGTATAGCTTCTAAAGCTCAGTAATTAAACACCTATTAAATAAAG
>TU82699
tgtgtgtgtgtgtgtgttgaggagcACATGGACGACAGAGGACGAGATTTAGCAGCGCTGCTAATTAACGCAGCCCATCGCCTGGGAAAAATGGGCAACGCAGGACGCATTTAAACACCGGGAATGCCGTCACAGGGTTGTGTTTCACGTCAGACGAGCAAAAAATGGCCATGTTGACCTGCTCGGCTATGAAAGCATAACAAACAGAGGGAAAAGACTAAACATCTGACAGCTGCATTGCCAACGCTGGAAACTCACAACAAAGctcTGAACACCTCTGCCTTTTTGACTCCGTTTTGGATGAGAGATCATACAAAGGAGCATCCTCAGGAAAAATCATGAAAACTTGTCCCACAAGGCCTGCAAGTTTTGTGCCGGAATAgcttggtatttggagctatccacaATTCCCTCTATATCGACTaaagccccagtcccagctgaagagaagcagccccattgcataatgctgccaccaccatgcttcaccatggCCTCATGTCCTCCCGATGAAGCTGTTTCGACAGGGGGTCAGGATATTGATAAAGGACACTCGAGGCTTACATTAGATGACCGACTAAGAAGAAGAAGTCACTGCAGGAGAGGAGAAGCGAGACCTTCATATCTATCTGCTTACACATACCTTGAGCTCATCGAAGCGCAGAGTGAAGTGGAGGATCTCTGCGAATTGGCGTGCCAGAGCCTGCTCCTGCTCCAAGTGCTGTGTGGGGCTGCAGCGTGCACTCGTTAGGAATCCCAGCAGGCCATGCAGGGCACCTTCTGCACAACCGAGACAACAGACAAAGAGGtaatattacattacaattGACCCAATGGATGGAAAGAGGGGTAGATTGATGGATGGACAAATAGTTTGATGGATGGTGGTTAGTTAGAGATTTAGATGGATGAATGTGCCAGATCAATATCATAAATAGAGAATTAGTGAAAGACAAACTCAGTGGGTTGAGCAAATGAAAAAGGAACAGGATAAGGCCTTATGGCAAGAATCCAGTTGAAGGGTGTTTTCCAGAGACCTGCCTAGGGCAAAACGTATTCataatttctattttaatttagGTTCACACAGAGAATGTGCAGACAGTGTGCACTCCTCACCCAGCAAGAACTGGAGTGCATCACGGTGCAGTGAGCTGCGTAGACCTATTTATATCCACATGCATTTTTAACTGTCTAGTCAAATATTTGGCAGACACACATAAATCTTGGTTGCGAGCAGAGACATTTAGTTAGTGTAGGCCTTTGAAACCTCTTCTCCAGAGACTGCTGCAGTTGGTTGGTGATTATTTGAGATTAAGGGATGTGTCATAGTTAATTGGGACATGACCTACTAATCTACGCTGCTACCTACAGATCTGATACAAAACCCTAAACCTGTACTGCCTTTTTACTTCCTATTAAGTTTTTAGTGATTTTTTGTGATCACTGTAGATTTTATTAATCATTAGATAGAATACTGTgtggcattttgtgtgtgtatgtaaagcTTACTGTACCTTCCACAACTTGTTTATTCAgccagtaataataaatatcgGAAATTAGATTCAGCATTAAATTTAACACAATTAAATTGCACAATTTAAAGAGTGAACAGAAAGCAATATTTCACTAGATGAGGCCTCAGAGGTTTGCCTCACCCAGAAGAATATCTTAATCCAATTACAACGCATTGTTGCCTGGCTCGAGGCTAACTACCACCAGCGAGCATGAACTGCAGACATGCACTGACtattaacacaaacataatATGAACCTCATAATCCTAATAGCATTAACCTCACCACAACACTCCACCTTGGAATAGCCTTCCAGTATGACATTACATTACAGCCAGGTCTATTCACTGTTCAAGTAACATCCATTTGCGAAAGTAAATCCATGTATATGACAATACAAAGACAGTAAATAAAGCGAAGGAATTGTGCATGCAGAAAAGACATAAGAGTGATGGTGAGAGCTATAGATTGAGAGAGGAGTGAGGCAGAGGCTGGCGAAGGTTATACAACTCCTTTATCTGGTTGCCGATGCAAGCTTTGCTGAGTCAAACTCTGATCATCACATCGTCTGACGTGAGCGGCAATCAATACACAAAGTGTGTTTGTGAAGCTTAGATTCTTGAGAGTTCAAAAACACAGCTTAAGTTCAGTCTAGGCTTGATACTGATTTTTCCCTGCTCACAATTTGCCGttaaaaaaggacaaataaTCGTCTAGAATGTTCACCGTTTAAGGAAAGTACAGAaggctgtaataataataataataataatatcagctgtgcagtcgggaactgcttgctggcagtggcaatcGCAAAAGATCAGGTGTATTTTAGGTGATTCTGCAAcatgtgcagtaaacagtaaaataaataaataaataaatatttattgtatgttttctttataaacattttcatttcatttggtcCGCTACTGCTGAGTTTTTTAACGCATCTGAGCTCTGACTGGAGCAGgagagcaacaaaaaaaatcaataattttcattacaaataataatggaaaaaggggtatatttaacatttcattgTTGGTGAAAGAATCTTTTTAAGGTCAAAATCTTTCAGCCTTTTCTCTAGAAAACCGGAAGTGACATTTCTGGCCAAAATTATCTGGCGACATCCttaataaatacagttaacCAGTGTTCATTATATACTTGTCTCTATTAGCTACGTTGAACACAGgctgatattttatttcacactaaTGAActaaaaacattctccattctCTTAGTTTGACAGAAAGTTTAGCCGAGAGCCGGGGTGTGAGATGGGGGAATGGGGCAGGGCTGATTAATATTGGAGAGCTCAAATCAACTACACAAATCATTGCAGATTAAAATGACGACTGGCTGTTTTATTGGGAAGgaaaagactgctcttttggtgtatttttgagcGATAACTCTTACTAGTGTACTCCATTGCTGAACTCCTGCTCAAAATGAAGCCatgttggcaggtctggtaatttaatataataatcagACTAAATGTCACTGGATATTGTAGTAATGTAGTATTGGGTAGAGACGATTTAACTgttatatcgcacaagcctagttTACACGCATTCTACAGTCCCTTTTTCTGCACAAGATTAAATGTtagtatgcatgtgtgtgtaacaaaGCCACAGTGAAGTCTCATACCCAGCTTTAGAGAGAACTCGTAAAACTTCTTTAGTTTGCCCACTAGCGGCACCACAGCAGTCCAGGCTTTCTCTTGCACACTTTCATTAGACGGCTGCTGGATGGCctggaaacacaaaacacactccatAAACATTTGCCTGCTGAACAGAATAACTTTCACATGAACTCAAACTGACAGCATTTCCCAAGCACAGCTCCTTTTTAGCTTGCTCTGAACACTTGTCTCAGCACTATGGCATTAAACTGCACTCCTCCAACACTCTGTATGTGAGTCACCTTCGCAAAGACTCGATAAATAGATGACGTGTTTATTCAGGTGTGATAAAGCAGCTTAAACACCTCAGTGACACAGTGTTTCAGGAATGCAGTTTGATTCAGATGGATTTCAGGAATGTGTTTTAATTCTGTATCTGGTTCATCTTTCCTCATGGACAGGGTGCTGGGCTCATGTTGGTTCAGGCAACCAGCAAAGTTTAAGAACAGCCCATTGTTTCCACTGGTTTAAGAGCCAAACCATTAAATAATCCATTGTGAGTTTATGAGCAGTATAAAACTAATAAGAACTGAGAAAGATTTTACAAGTTTTACCTCTGAGAACACCTTTTATCATCTAATCATCGTCAAAGAATTCACAGCACAAAAAAAGACTTGATACATTTTTATAGCttttagttgtttttgtttacattagCATTAGAAATGGaacttttacttatttaattgcAATTTCCACTAAAGAGGTTCATTTTTCGTCAGATAATTTATTCATCTACAATATTAATTTAGTtaggggtgttttttttgttgtttcttaaAGAGATGTTTCTGAGAATTACTTGtccataaaatctcttacaTTGTCAATATTTATCGAGTTGTCTCTATAAGCTGGCAGGGAGAGTGGCTATGCGGAAagaccaaaataataataataataataataataataataaataaatatctatctAGAGGGGCAGTATGCAATGCTGTTTAGCCAATAATAGCTGGTTGGTT
>TU82700
tgtgtgtgtgtgtgtgttgaggagcACATGGACGACAGAGGACGAGATTTAGCAGCGCTGCTAATTAACGCAGCCCATCGCCTGGGAAAAATGGGCAACGCAGGACGCATTTAAACACCGGGAATGCCGTCACAGGGTTGTGTTTCACGTCAGACGAGCAAAAAATGtgAGCTGCCTTCAAGGTAAATCATTTTCAGAAATGCCTATGATTGGCACTGACGCGCACCCtgagggtccctggtttgatcctgagctcaggttactgtctgaggagtttcacatgttctcgcTGGGTACatgtggtttcctcccactgtccaaaagcatgcagctcTGAACACCTCTGCCTTTTTGACTCCGTTTTGGATGAGAGATCATACAAAGGAGCATCCTCAGGAAAAATCATGAAAACTTGTCCCACAAGGCCTGCAAGTTTTGTGCCGGAATAgcttggtatttggagctatccacaATTCCCTCTATATCGACTaaagccccagtcccagctgaagagaagcagccccattgcataatgctgccaccaccatgcttcaccatggCCTCATGTCCTCCCGATGAAGCTGTTTCGACAGGGGGTCAGGATATTGATAAAGGACACTCGAGGCTTACATTAGATGACCGACTAAGAAGAAGAAGTCACTGCAGGAGAGGAGAAGCGAGACCTTCATATCTATCTGCTTACACATACCTTGAGCTCATCGAAGCGCAGAGTGAAGTGGAGGATCTCTGCGAATTGGCGTGCCAGAGCCTGCTCCTGCTCCAAGTGCTGTGTGGGGCTGCAGCGTGCACTCGTTAGGAATCCCAGCAGGCCATGCAGGGCACCTTCTGCACAACCGAGACAACAGACAAAGAGGtaatattacattacaattGACCCAATGGATGGAAAGAGGGGTAGATTGATGGATGGACAAATAGTTTGATGGATGGTGGTTAGTTAGAGATTTAGATGGATGAATGTGCCAGATCAATATCATAAATAGAGAATTAGTGAAAGACAAACTCAGTGGGTTGAGCAAATGAAAAAGGAACAGGATAAGGCCTTATGGCAAGAATCCAGTTGAAGGGTGTTTTCCAGAGACCTGCCTAGGGCAAAACGTATTCataatttctattttaatttagGTTCACACAGAGAATGTGCAGACAGTGTGCACTCCTCACCCAGCAAGAACTGGAGTGCATCACGGTGCAGTGAGCTGCGTAGACCTATTTATATCCACATGCATTTTTAACTGTCTAGTCAAATATTTGGCAGACACACATAAATCTTGGTTGCGAGCAGAGACATTTAGTTAGTGTAGGCCTTTGAAACCTCTTCTCCAGAGACTGCTGCAGTTGGTTGGTGATTATTTGAGATTAAGGGATGTGTCATAGTTAATTGGGACATGACCTACTAATCTACGCTGCTACCTACAGATCTGATACAAAACCCTAAACCTGTACTGCCTTTTTACTTCCTATTAAGTTTTTAGTGATTTTTTGTGATCACTGTAGATTTTATTAATCATTAGATAGAATACTGTgtggcattttgtgtgtgtatgtaaagcTTACTGTACCTTCCACAACTTGTTTATTCAgccagtaataataaatatcgGAAATTAGATTCAGCATTAAATTTAACACAATTAAATTGCACAATTTAAAGAGTGAACAGAAAGCAATATTTCACTAGATGAGGCCTCAGAGGTTTGCCTCACCCAGAAGAATATCTTAATCCAATTACAACGCATTGTTGCCTGGCTCGAGGCTAACTACCACCAGCGAGCATGAACTGCAGACATGCACTGACtattaacacaaacataatATGAACCTCATAATCCTAATAGCATTAACCTCACCACAACACTCCACCTTGGAATAGCCTTCCAGTATGACATTACATTACAGCCAGGTCTATTCACTGTTCAAGTAACATCCATTTGCGAAAGTAAATCCATGTATATGACAATACAAAGACAGTAAATAAAGCGAAGGAATTGTGCATGCAGAAAAGACATAAGAGTGATGGTGAGAGCTATAGATTGAGAGAGGAGTGAGGCAGAGGCTGGCGAAGGTTATACAACTCCTTTATCTGGTTGCCGATGCAAGCTTTGCTGAGTCAAACTCTGATCATCACATCGTCTGACGTGAGCGGCAATCAATACACAAAGTGTGTTTGTGAAGCTTAGATTCTTGAGAGTTCAAAAACACAGCTTAAGTTCAGTCTAGGCTTGATACTGATTTTTCCCTGCTCACAATTTGCCGttaaaaaaggacaaataaTCGTCTAGAATGTTCACCGTTTAAGGAAAGTACAGAaggctgtaataataataataataataatatcagctgtgcagtcgggaactgcttgctggcagtggcaatcGCAAAAGATCAGGTGTATTTTAGGTGATTCTGCAAcatgtgcagtaaacagtaaaataaataaataaataaatatttattgtatgttttctttataaacattttcatttcatttggtcCGCTACTGCTGAGTTTTTTAACGCATCTGAGCTCTGACTGGAGCAGgagagcaacaaaaaaaatcaataattttcattacaaataataatggaaaaaggggtatatttaacatttcattgTTGGTGAAAGAATCTTTTTAAGGTCAAAATCTTTCAGCCTTTTCTCTAGAAAACCGGAAGTGACATTTCTGGCCAAAATTATCTGGCGACATCCttaataaatacagttaacCAGTGTTCATTATATACTTGTCTCTATTAGCTACGTTGAACACAGgctgatattttatttcacactaaTGAActaaaaacattctccattctCTTAGTTTGACAGAAAGTTTAGCCGAGAGCCGGGGTGTGAGATGGGGGAATGGGGCAGGGCTGATTAATATTGGAGAGCTCAAATCAACTACACAAATCATTGCAGATTAAAATGACGACTGGCTGTTTTATTGGGAAGgaaaagactgctcttttggtgtatttttgagcGATAACTCTTACTAGTGTACTCCATTGCTGAACTCCTGCTCAAAATGAAGCCatgttggcaggtctggtaatttaatataataatcagACTAAATGTCACTGGATATTGTAGTAATGTAGTATTGGGTAGAGACGATTTAACTgttatatcgcacaagcctagttTACACGCATTCTACAGTCCCTTTTTCTGCACAAGATTAAATGTtagtatgcatgtgtgtgtaacaaaGCCACAGTGAAGTCTCATACCCAGCTTTAGAGAGAACTCGTAAAACTTCTTTAGTTTGCCCACTAGCGGCACCACAGCAGTCCAGGCTTTCTCTTGCACACTTTCATTAGACGGCTGCTGGATGGCctggaaacacaaaacacactccatAAACATTTGCCTGCTGAACAGAATAACTTTCACATGAACTCAAACTGACAGCATTTCCCAAGCACAGCTCCTTTTTAGCTTGCTCTGAACACTTGTCTCAGCACTATGGCATTAAACTGCACTCCTCCAACACTCTGTATGTGAGTCACCTTCGCAAAGACTCGATAAATAGATGACGTGTTTATTCAGGTGTGATAAAGCAGCTTAAACACCTCAGTGACACAGTGTTTCAGGAATGCAGTTTGATTCAGATGGATTTCAGGAATGTGTTTTAATTCTGTATCTGGTTCATCTTTCCTCATGGACAGGGTGCTGGGCTCATGTTGGTTCAGGCAACCAGCAAAGTTTAAGAACAGCCCATTGTTTCCACTGGTTTAAGAGCCAAACCATTAAATAATCCATTGTGAGTTTATGAGCAGTATAAAACTAATAAGAACTGAGAAAGATTTTACAAGTTTTACCTCTGAGAACACCTTTTATCATCTAATCATCGTCAAAGAATTCACAGCACAAAAAAAGACTTGATACATTTTTATAGCttttagttgtttttgtttacattagCATTAGAAATGGaacttttacttatttaattgcAATTTCCACTAAAGAGGTTCATTTTTCGTCAGATAATTTATTCATCTACAATATTAATTTAGTtaggggtgttttttttgttgtttcttaaAGAGATGTTTCTGAGAATTACTTGtccataaaatctcttacaTTGTCAATATTTATCGAGTTGTCTCTATAAGCTGGCAGGGAGAGTGGCTATGCGGAAagaccaaaataataataataataataataataataataaataaatatctatctAGAGGGGCAGTATGCAATGCTGTTTAGCCAATAATAGCTGGTTGGTT
>XR_004578008.1
gcgcgtgcgcgcgcgtgtgtgtgtgtgtgtgttgaggagcACATGGACGACAGAGGACGAGATTTAGCAGCGCTGCTAATTAACGCAGCCCATCGCCTGGGAAAAATGGGCAACGCAGGACGCATTTAAACACCGGGAATGCCGTCACAGGGTTGTGTTTCACGTCAGACGAGCAAAAAATGctcTGAACACCTCTGCCTTTTTGACTCCGTTTTGGATGAGAGATCATACAAAGGAGCATCCTCAGGAAAAATCATGAAAACTTGTCCCACAAGGCCTGCAAGTTTTGTGCCGGAATAgcttggtatttggagctatccacaATTCCCTCTATATCGACTaaagccccagtcccagctgaagagaagcagccccattgcataatgctgccaccaccatgcttcaccatggCCTCATGTCCTCCCGATGAAGCTGTTTCGACAGGGGGTCAGGATATTGATAAAGGACACTCGAGGCTTACATTAGATGACCGACTAAGAAGAAGAAGTCACTGCAGGAGAGGAGAAGCGAGACCTTCATATCTATCTGCTTACACATACCTTGAGCTCATCGAAGCGCAGAGTGAAGTGGAGGATCTCTGCGAATTGGCGTGCCAGAGCCTGCTCCTGCTCCAAGTGCTGTGTGGGGCTGCAGCGTGCACTCGTTAGGAATCCCAGCAGGCCATGCAGGGCACCTTCTGCACAACCGAGACAACAGACAAAGAGACCTACTGCATTTTGGTGCTGGAACTGATCCAGTTGTGGCGACTGTGAAGCAGCTCTTTTGTGGTGTAAATGCACAGAACAGTTGGAGATTAAACACCAGCTATGGAACCAGCCCCAGCAGCTTGATTTTGGAAAAGTGCTTTTGCATGACACTGTCCTTTATGCCCTGCCTATACATATTTCATACATTCACCTGTCTAATGGCTTCTCCAGCTCCACTGTAGGACTGCAGATCCTCTAAAACACTCATGGCCTCCATCAGAACCTTGTTCACCTGTTCCCATAACTCCCTCTCTGCCTCAGTGGGCTGAGCATCTGTGAAAACAGCAGCACTTGGttacaccctcacacacacacacacacgcaggcacGCACATGCATGAATGTACAGTCAGGTTCAGAAGTCTGAGTCCACTAGCAACAactggttttatttcatttcatcatgtaTACAAAATGTTACAACAGACGTTTTGCCATTTGAGATCACCCAGTATGAAACAGACATATAGCTGAATGCTCTGTTAGCACAGTGattcttttctgtttaaaaactgTTGTGATTTCATTGTAACACACTTGCTTTCAAGTTTTAATTGTTGAGATGACAGTGTCCCAACCTTGCATCGTTTTACTTTTTGGagaaatatatttgttatagtaaaataaacacactacatAAACTTACTTTCAAAGTCCAGGAAAAAGTTCCCCGCATTGTTGTCGATGTCCCTCGTCAGAACCTTGATCAGATTCCCCATGCCGTCCAATCAGAAACCTGACGAGAGGAAGAGGAGTGAATTAGTGACACATCCCACTGAGAACATAAAGATCATATTAATGTATCAtgctgtgtaactgtgtgtggtCCAATAAATCAGCGAATGTCAA
>XR_004578009.1
gcgcgtgcgcgcgcgtgtgtgtgtgtgtgtgttgaggagcACATGGACGACAGAGGACGAGATTTAGCAGCGCTGCTAATTAACGCAGCCCATCGCCTGGGAAAAATGGGCAACGCAGGACGCATTTAAACACCGGGAATGCCGTCACAGGGTTGTGTTTCACGTCAGACGAGCAAAAAATGTTCTGTCATCAGGGGCCTGCTACTGGAGGAAAGCCTGCGCAGAGGATGTAGGTGTAAACAGCAGAGCTCTTGGTCTTTTCACATTTGCCATAATGctcTGAACACCTCTGCCTTTTTGACTCCGTTTTGGATGAGAGATCATACAAAGGAGCATCCTCAGGAAAAATCATGAAAACTTGTCCCACAAGGCCTGCAAGTTTTGTGCCGGAATAgcttggtatttggagctatccacaATTCCCTCTATATCGACTaaagccccagtcccagctgaagagaagcagccccattgcataatgctgccaccaccatgcttcaccatggCCTCATGTCCTCCCGATGAAGCTGTTTCGACAGGGGGTCAGGATATTGATAAAGGACACTCGAGGCTTACATTAGATGACCGACTAAGAAGAAGAAGTCACTGCAGGAGAGGAGAAGCGAGACCTTCATATCTATCTGCTTACACATACCTTGAGCTCATCGAAGCGCAGAGTGAAGTGGAGGATCTCTGCGAATTGGCGTGCCAGAGCCTGCTCCTGCTCCAAGTGCTGTGTGGGGCTGCAGCGTGCACTCGTTAGGAATCCCAGCAGGCCATGCAGGGCACCTTCTGCACAACCGAGACAACAGACAAAGAGACCTACTGCATTTTGGTGCTGGAACTGATCCAGTTGTGGCGACTGTGAAGCAGCTCTTTTGTGGTGTAAATGCACAGAACAGTTGGAGATTAAACACCAGCTATGGAACCAGCCCCAGCAGCTTGATTTTGGAAAAGTGCTTTTGCATGACACTGTCCTTTATGCCCTGCCTATACATATTTCATACATTCACCTGTCTAATGGCTTCTCCAGCTCCACTGTAGGACTGCAGATCCTCTAAAACACTCATGGCCTCCATCAGAACCTTGTTCACCTGTTCCCATAACTCCCTCTCTGCCTCAGTGGGCTGAGCATCTGTGAAAACAGCAGCACTTGGttacaccctcacacacacacacacacgcaggcacGCACATGCATGAATGTACAGTCAGGTTCAGAAGTCTGAGTCCACTAGCAACAactggttttatttcatttcatcatgtaTACAAAATGTTACAACAGACGTTTTGCCATTTGAGATCACCCAGTATGAAACAGACATATAGCTGAATGCTCTGTTAGCACAGTGattcttttctgtttaaaaactgTTGTGATTTCATTGTAACACACTTGCTTTCAAGTTTTAATTGTTGAGATGACAGTGTCCCAACCTTGCATCGTTTTACTTTTTGGagaaatatatttgttatagtaaaataaacacactacatAAACTTACTTTCAAAGTCCAGGAAAAAGTTCCCCGCATTGTTGTCGATGTCCCTCGTCAGAACCTTGATCAGATTCCCCATGCCGTCCAATCAGAAACCTGACGAGAGGAAGAGGAGTGAATTAGTGACACATCCCACTGAGAACATAAAGATCATATTAATGTATCAtgctgtgtaactgtgtgtggtCCAATAAATCAGCGAATGTCAA
>XR_004578010.1
CAGCAGATGGTCATTGTGTTATACCCAGAGAGATGTGTGTTTCTCTAGCAGCTGATTTACCTCTGGGGAGAGGTAGCTCCTGCCAGAGTACTTGGACTTTTCCTGAAGCGTGGTGTTACACAGGattcttggtgccagatggcACATGACTTTGGCTTGTTCTGTCATCAGGGGCCTGCTACTGGAGGAAAGCCTGCGCAGAGGATGTAGGTGTAAACAGCAGAGCTCTTGGTCTTTTCACATTTGCCATAATGctcTGAACACCTCTGCCTTTTTGACTCCGTTTTGGATGAGAGATCATACAAAGGAGCATCCTCAGGAAAAATCATGAAAACTTGTCCCACAAGGCCTGCAAGTTTTGTGCCGGAATAgcttggtatttggagctatccacaATTCCCTCTATATCGACTaaagccccagtcccagctgaagagaagcagccccattgcataatgctgccaccaccatgcttcaccatggCCTCATGTCCTCCCGATGAAGCTGTTTCGACAGGGGGTCAGGATATTGATAAAGGACACTCGAGGCTTACATTAGATGACCGACTAAGAAGAAGAAGTCACTGCAGGAGAGGAGAAGCGAGACCTTCATATCTATCTGCTTACACATACCTTGAGCTCATCGAAGCGCAGAGTGAAGTGGAGGATCTCTGCGAATTGGCGTGCCAGAGCCTGCTCCTGCTCCAAGTGCTGTGTGGGGCTGCAGCGTGCACTCGTTAGGAATCCCAGCAGGCCATGCAGGGCACCTTCTGCACAACCGAGACAACAGACAAAGAGACCTACTGCATTTTGGTGCTGGAACTGATCCAGTTGTGGCGACTGTGAAGCAGCTCTTTTGTGGTGTAAATGCACAGAACAGTTGGAGATTAAACACCAGCTATGGAACCAGCCCCAGCAGCTTGATTTTGGAAAAGTGCTTTTGCATGACACTGTCCTTTATGCCCTGCCTATACATATTTCATACATTCACCTGTCTAATGGCTTCTCCAGCTCCACTGTAGGACTGCAGATCCTCTAAAACACTCATGGCCTCCATCAGAACCTTGTTCACCTGTTCCCATAACTCCCTCTCTGCCTCAGTGGGCTGAGCATCTGTGAAAACAGCAGCACTTGGttacaccctcacacacacacacacacgcaggcacGCACATGCATGAATGTACAGTCAGGTTCAGAAGTCTGAGTCCACTAGCAACAactggttttatttcatttcatcatgtaTACAAAATGTTACAACAGACGTTTTGCCATTTGAGATCACCCAGTATGAAACAGACATATAGCTGAATGCTCTGTTAGCACAGTGattcttttctgtttaaaaactgTTGTGATTTCATTGTAACACACTTGCTTTCAAGTTTTAATTGTTGAGATGACAGTGTCCCAACCTTGCATCGTTTTACTTTTTGGagaaatatatttgttatagtaaaataaacacactacatAAACTTACTTTCAAAGTCCAGGAAAAAGTTCCCCGCATTGTTGTCGATGTCCCTCGTCAGAACCTTGATCAGATTCCCCATGCCGTCCAATCAGAAACCTGACGAGAGGAAGAGGAGTGAATTAGTGACACATCCCACTGAGAACATAAAGATCATATTAATGTATCAtgctgtgtaactgtgtgtggtCCAATAAATCAGCGAATGTCAA
>XR_004578011.1
gcgcgtgcgcgcgcgtgtgtgtgtgtgtgtgttgaggagcACATGGACGACAGAGGACGAGATTTAGCAGCGCTGCTAATTAACGCAGCCCATCGCCTGGGAAAAATGGGCAACGCAGGACGCATTTAAACACCGGGAATGCCGTCACAGGGTTGTGTTTCACGTCAGACGAGCAAAAAATGTTCTGTCATCAGGGGCCTGCTACTGGAGGAAAGCCTGCGCAGAGGATGTAGGTGTAAACAGCAGAGCTCTTGGTCTTTTCACATTTGCCATAATGGCCATGTTGACCTGCTCGGCTATGAAAGCATAACAAACAGAGGGAAAAGACTAAACATCTGACAGCTGCATTGCCAACGCTGGAAACTCACAACAAAGctcTGAACACCTCTGCCTTTTTGACTCCGTTTTGGATGAGAGATCATACAAAGGAGCATCCTCAGGAAAAATCATGAAAACTTGTCCCACAAGGCCTGCAAGTTTTGTGCCGGAATAgcttggtatttggagctatccacaATTCCCTCTATATCGACTaaagccccagtcccagctgaagagaagcagccccattgcataatgctgccaccaccatgcttcaccatggCCTCATGTCCTCCCGATGAAGCTGTTTCGACAGGGGGTCAGGATATTGATAAAGGACACTCGAGGCTTACATTAGATGACCGACTAAGAAGAAGAAGTCACTGCAGGAGAGGAGAAGCGAGACCTTCATATCTATCTGCTTACACATACCTTGAGCTCATCGAAGCGCAGAGTGAAGTGGAGGATCTCTGCGAATTGGCGTGCCAGAGCCTGCTCCTGCTCCAAGTGCTGTGTGGGGCTGCAGCGTGCACTCGTTAGGAATCCCAGCAGGCCATGCAGGGCACCTTCTGCACAACCGAGACAACAGACAAAGAGACCTACTGCATTTTGGTGCTGGAACTGATCCAGTTGTGGCGACTGTGAAGCAGCTCTTTTGTGGTGTAAATGCACAGAACAGTTGGAGATTAAACACCAGCTATGGAACCAGCCCCAGCAGCTTGATTTTGGAAAAGTGCTTTTGCATGACACTGTCCTTTATGCCCTGCCTATACATATTTCATACATTCACCTGTCTAATGGCTTCTCCAGCTCCACTGTAGGACTGCAGATCCTCTAAAACACTCATGGCCTCCATCAGAACCTTGTTCACCTGTTCCCATAACTCCCTCTCTGCCTCAGTGGGCTGAGCATCTGTGAAAACAGCAGCACTTGGttacaccctcacacacacacacacacgcaggcacGCACATGCATGAATGTACAGTCAGGTTCAGAAGTCTGAGTCCACTAGCAACAactggttttatttcatttcatcatgtaTACAAAATGTTACAACAGACGTTTTGCCATTTGAGATCACCCAGTATGAAACAGACATATAGCTGAATGCTCTGTTAGCACAGTGattcttttctgtttaaaaactgTTGTGATTTCATTGTAACACACTTGCTTTCAAGTTTTAATTGTTGAGATGACAGTGTCCCAACCTTGCATCGTTTTACTTTTTGGagaaatatatttgttatagtaaaataaacacactacatAAACTTACTTTCAAAGTCCAGGAAAAAGTTCCCCGCATTGTTGTCGATGTCCCTCGTCAGAACCTTGATCAGATTCCCCATGCCGTCCAATCAGAAACCTGACGAGAGGAAGAGGAGTGAATTAGTGACACATCCCACTGAGAACATAAAGATCATATTAATGTATCAtgctgtgtaactgtgtgtggtCCAATAAATCAGCGAATGTCAA

Function


GO:

id name namespace
GO:0031514 motile cilium cellular_component

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU82695 False 1550 lncRNA 0.46 5 23654937 23767812
TU82696 False 449 lncRNA 0.49 2 23654937 23656038
TU82697 False 1645 lncRNA 0.46 6 23654937 23767812
TU82698 False 524 lncRNA 0.48 2 23654937 23656038
TU82699 False 4217 lncRNA 0.40 5 23654937 23766530
TU82700 True 4283 lncRNA 0.40 5 23654937 23766530
XR_004578008.1 False 1616 lncRNA 0.46 5 23654922 23767863
XR_004578009.1 False 1711 lncRNA 0.47 6 23654922 23767863
XR_004578010.1 False 1688 lncRNA 0.46 6 23664855 23767863
XR_004578011.1 False 1809 lncRNA 0.47 7 23654922 23767863

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
mycb LOC108268289 coding upstream 4289 23648271 ~ 23650633 (+)
ankhb ankh,ankhb,LOC108437249,LOC107657429,LOC107713990 coding upstream 13453 23614440 ~ 23641469 (+)
otulinb LOC108268091 coding upstream 46721 23594961 ~ 23608201 (+)
stard3nl stard3nl,LOC107713985 coding upstream 253192 23392658 ~ 23401730 (+)
epdr1 LOC108267170,LOC107664036,LOC107558964,LOC108437243,LOC107713986 coding upstream 263921 23387009 ~ 23391001 (+)
LOC113540051 NA coding downstream 245993 24013856 ~ 24016743 (+)
LOC113540619 NA coding downstream 253202 24021065 ~ 24024165 (+)
zgc:136930 LOC108267402,LOC107599883,LOC107733879,LOC108430265,LOC107657418,LOC107559002 coding downstream 353690 24121553 ~ 24127236 (+)
ccr9a LOC108267400 coding downstream 366813 24134676 ~ 24136808 (+)
LOC113540392 NA coding downstream 377219 24145082 ~ 24148968 (+)
G69641 NA non-coding upstream 43765 23610953 ~ 23611157 (+)
G69570 NA non-coding upstream 197716 23447463 ~ 23457206 (+)
G69522 NA non-coding upstream 286245 23367661 ~ 23368677 (+)
G69514 NA non-coding upstream 323393 23331033 ~ 23331529 (+)
G69449 NA non-coding upstream 362924 23291410 ~ 23291998 (+)
G69735 NA non-coding downstream 78782 23846645 ~ 23849514 (+)
G69736 NA non-coding downstream 87212 23855075 ~ 23857571 (+)
G69870 NA non-coding downstream 153937 23921800 ~ 23922696 (+)
G69878 abcf2,abcf2a,LOC107599875,LOC107657436,LOC107709809 non-coding downstream 172378 23940241 ~ 23943072 (+)
G69946 NA non-coding downstream 239840 24007703 ~ 24009860 (+)
G69509 LOC108267411 other upstream 334579 23318504 ~ 23320343 (+)
LOC113540463 NA other upstream 1002475 22649810 ~ 22652447 (+)
LOC113540377 NA other upstream 1892621 21752416 ~ 21762301 (+)
mettl4 mettl4 other upstream 2014765 21629076 ~ 21640157 (+)
plag1 plag1,LOC107570635 other upstream 2330955 21314218 ~ 21323967 (+)
klhl18 klhl18,LOC107657445,LOC107701005,LOC107733883,LOC107730797 other downstream 260243 24028106 ~ 24106223 (+)
G69971 NA other downstream 340932 24108795 ~ 24109889 (+)
kif2c kif2c other downstream 1091163 24859026 ~ 24871263 (+)
tnr tnr other downstream 1939964 25707827 ~ 25881110 (+)
LOC113539772 kiaa0040 other downstream 2129154 25897017 ~ 25902006 (+)

Expression



Co-expression Network