bcl10 (bcl10)


Basic Information

Item Value
gene id bcl10
gene name bcl10
gene type coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047598.1
NCBI id CM018544.1
chromosome length 33267568
location 99678 ~ 108094 (-)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>XM_026912108.2
GTGACGTCACTGCGCTCGATAAGGAAGTGAGGAGAGAACTTCACTTTTCAGCGTTTCTCAAGTTTGGCCTTCGTGTGTATTTAATGAAGTTTAACTGTACGCGTAAGCGCTTCATTCAGGAAGTTCATTCTCAACTTAATGAGctttaattattgttttcaATTTGCTATTTAAATCTAGGTCTAATAGTTTAGATCAGGTTGAGCAGAATGGAGATTCCTCACCTGACGGAAGACGAAATGGCCGAAGTGAAAAAGAATGCTCTGGAGACTCTTCGTCCATACCTGGTAGAGAAGCTGATTGCAGAGAGGCACTATGATTACTTGCGCTCGAAGAAGATCCTGACACGAGAGGACACGGAGGAGATCAGCTGCAGGAGCACGCGCGGAAAACGCGCCGGTAAATTACTCGACTTTATCGCTGAGAACCCGCGAGGTCTGGACACGCTAATTGAGTCAATTCAGCGCTGCCGAACTCTCAACTTTATTATCACCAAGATCACTGACGAGGTGCAGCGGTGCAAGAATGAGAAGATCGAGGCACTCAGAGcAGCAGGCATGTCTAGCTCAACTATGAAGGACACGTCGGGAGCCACTAACAACCTCTCAAAGGCAGACTTCTATGATTACGATAAGTGCTCGACTGTTTGTCTCCACCCTGATGGAGAACGAAGTCCCGCCTCTTCTGTGATGAGCAGCTCTATGAATCTCTCTTTTGCTGGGAATCGGCAGAGGGGGCAGGACTGTATGTCAGTTAGTGGTGCTGCTAGCCTAACGACGTCATCCAGCCTTCCCAAGCCTGGTGATCCTGGAGCCCCGCCTCTTCCTGATGATGTCGCTGTGGAAGACCAGGATGCAGAAGCAGGTGCTTGTGGGAGCACAGGAAGTAGTGGGGATGCTAACTTCCTGCCACTGCGCTCCCGTTCCTTAAACCTGTCTGTCGACAATGCACTCTGAGAATTAAAATACAATCGCTGTGTTTCTGTACTGTTTTTAACGTGGCCTTGTCGACTTCCCCTGTGTCTCACAATGGTACACTTCTTTagtgcaaaaacacacaactgcCATGGGTctaaaacaattttatttctcTGGAAATATAAGTTACATTCAAATGGAAGTTGTGATTTCTAGAAGACTGGGTAGatttgctgcttcacagctctaAAGTCTTGGTTCGAATGCTGTCTGTGCCGAGTTTCACCCGTTTCACACGTCCTTCCgatgtttcctccaggttctccagattggctaagctaaattgcccataggggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagcgagagagagagagtgtgtgtgtgaatgtgtgtgtgcatgatgccctgtgatggactagccTCCTGTGTGGGGCGATTTGTGCCACCTTGGGTCAGTGTTCCAGGAATGGCTCTGACTAGATGATTGGGTTTCCCCTGACCAGGAGAAAGTgctaactgaagatgaatgaatgaattaattttattgctgtttaaaCTTCAGCTTCTTCCACTGTTCTATAAAAATGGCAGTATGTTGTGTTCCTGAAGTCTGCAGCGATGGCCAAGAGAATTAGCCAAGTGGAAGTGTACGAGGGGAAGTGTACGAGGGGATGTGTTAAAAACAGGAATGAAGCATGGCTGCTGGTGACAGCATTCCTCAGGGCTCCATGTAAGGACTGGAAAATGTCCACTGACTCTCACAGTAAAGCTACATatagaataattaaaaattctGTGTTCCAACTGACCAATCCCTAGCCCAGGGATTTTCTGGGTCCTCTAATAAGTGCTTAGCAATAGTTGCTATCCACCTTTACCTCAGTCAAACTTCCATCAGTTTAACAGGCCAGTGTTTTCTGAGGGCATGTTTCTTATTTGAATCTCCAAATGTGGCTAAAAAGACGTCTGAATTATCAGCATACAAAGCCTGACAGATATTAATGACTGGAAAAACCCACACAACGTCCCATTAAGGCCACTCTTTTGCAGGATTTCTGCATTATtcagtcagtaaaaaaaaaaaaaaaaactttatacatGTGCAAACATTACTTTCCCTCAAATaatcatgttacagaaaaatatttgtatgtcagtaaaaaaaaaaaaaaagtgagtaatTAGCTGCAGAAACAAAAGCAAGTGTGCAGAAGTCAGATTCTCCAGGACGCTTATAAAAACTGCCAGTTTCCTTGTGAAACTGTGCAAAGGTGTACCTGAGACTACggatgcatttttaaaggcaaagacagtagatttttttcagttcaATACATCAGTGTATTGAAACATACATTAAACATCCTGCATAATAAAGTCGACTGTTCATCATAAAATACCTCTTATATTACATGAGATGGCaagcatttaaacttaatcaaacCCACACTCCCTCCTGTGAAAAAAGTAACTTCCTGTTTATCTCGAATGAGGAGAGGCTACAgggattaaaacaaaaatgctacTCTGAGCACTTTTCAGAAAACAGTATGCTAGCCTTATAGCATTCTAGCTAGTATGTTCAGCAGCAAGCAGGAGCTGGAAGATTCCCTAAGTCTTTAAGGTCAGCGCCGGGTTGCAGCAAAGGCCTTAATTTAAGAAAACCCTAAGTTATAAGGTTAAGGATGCCCTTAGTGAAACATGGgttgcaagaaaaaaagagtCCACTTAAGGAACCTTAAGGCTGTCATTAAGTATTTCCCGTTAATTGCTCAAGTGTTCGCTGAAGTTCTGTTATGCATTGCTACAATATTCTTCGTAACCATTTCACCCTAAAATAATTAAGGGATCAGAACAGTAAAGCATTTGCTGAACTCAAATATCAAAGTACGGAGGCACATTTTTAGTGATCAAAATGATACGCAATTATTGAGAGAATATCGGTTTGACTGTTAGTCAGTTCTTCGTCTCACTGCGATACTTGAGCCTGACAGTGAGCACCAAACTCGgcggatttttttttaatacaatatgtCCAGTCTTGTAAATCAATTTAGCTTGAATGGGGACTGAAGGGTTACAGTGGCTTTGGAGGGTGTGTTTCGTTTTTGCGTATTCTTCTAAAAGAACAGATTTTTCGTCCTCGGTCCAGTTTGGTTTACGTTTCTTGTTTTTGGTACTGTTAATATTCTCCATAACTCAAATATTGTAGTACAGCTGTATAGTTGTAGCAAAGGTTAAAGTTAAACTTGTTTAATAATCAGTGGTCCATTATGTTCTGTTGATTGTGGGAGATTTTGTAACTATAGCAACCACTTCCCCAATGCCGTGCTTTGCCAGAAACTATTACGAAATGCTTAGTATACACACTTAAGTAAGGAAGACAGTACAAACATATGGCTAATGCGgcccgcacacacacaaacactcacagcaATCTCTCTGCTGCATTCAGTCAGTCTTTCATTGCTGATTCAGATTGGACTAAAGAAAGTGCTGATTGGAAAGATCATATTCAGTAGTGGAGAACGCAGGATTTAAGAACAAACATCTAGGGCTACAGAGAGCTAGTGTTATGCACTGTGTAGCTAAGACTAATGTTAAATGCTGCTCTTATCTTGTTACAGTTACCATGCTACAAGAACTTTTGTAAGGAAATTACCGTCTCCTTAAAACCTTTCCTGATCCGGCTCCCTTAGATAGCAACAGTAACAGAGTGTGGGCAGGGCTTGGGAGTATTGCAGATTTGTCATCTGACAACTGAAACTGtagctaaagctaaagctaataTCGCAAACATGCCCTCAGGAAAACTTTAGTTAGCGTGAAACAAACTGATTCAACAGTTCTCTGTCCACAAACTTCACACAAATATGATAAAGCTAAACAGTTAAAAGTCTCATCATCATAACATAACTCCTGCATGAAATGAAAGCACAAATATTATCCAGGCTTCTCCTGTAAAAAGTAATTGATCATGTTTTACAGCCAGATGTACAGCAGTGTGTCGTTGTTCAGTGAGCTCAAGCTGGAAAGCTGCCCTCTCCATGAGGTGGCACCATGGACATGTGTAACCTAGCCTAATGATGTATCTATCTTTTCATATCTATAGCTTCGTTCAATTTAAAATATCACATGACCAataactttgttttattttcactcaaGAATATGAGACACTTTTGTTAAATGCTTGTCCATTAAAATATCATTGAGATGTATTGTTAGTACACACCCTCAGAGTGCTAagtatttgtaattattttttggACTGGggacttttttaaatgttttattatttttatgtccTATGCAGTTTGTATAGATGAAAGCAGTTAATAAGTATTTAGTATTTGCATTAATGTTtagcatttattaaataaaggttTATTGTGCATTGCTTGA
>XM_026912109.2
TGTGACGTCACTGCGCTCGATAAGGAAGTGAGGAGAGAACTTCACTTTTCAGCGTTTCTCAAGTTTGGCCTTCGTGTGTATTTAATGAAGTTTAACTGTACGCGTAAGCGCTTCATTCAGGAAGTTCATTCTCAACTTAATGAGctttaattattgttttcaATTTGCTATTTAAATCTAGGTCTAATAGTTTAGATCAGGTTGAGCAGAATGGAGATTCCTCACCTGACGGAAGACGAAATGGCCGAAGTGAAAAAGAATGCTCTGGAGACTCTTCGTCCATACCTGGTAGAGAAGCTGATTGCAGAGAGGCACTATGATTACTTGCGCTCGAAGAAGATCCTGACACGAGAGGACACGGAGGAGATCAGCTGCAGGAGCACGCGCGGAAAACGCGCCGGTAAATTACTCGACTTTATCGCTGAGAACCCGCGAGGTCTGGACACGCTAATTGAGTCAATTCAGCGCTGCCGAACTCTCAACTTTATTATCACCAAGATCACTGACGAGGTGCAGCGGTGCAAGAATGAGAAGATCGAGGCACTCAGAGCAGGCATGTCTAGCTCAACTATGAAGGACACGTCGGGAGCCACTAACAACCTCTCAAAGGCAGACTTCTATGATTACGATAAGTGCTCGACTGTTTGTCTCCACCCTGATGGAGAACGAAGTCCCGCCTCTTCTGTGATGAGCAGCTCTATGAATCTCTCTTTTGCTGGGAATCGGCAGAGGGGGCAGGACTGTATGTCAGTTAGTGGTGCTGCTAGCCTAACGACGTCATCCAGCCTTCCCAAGCCTGGTGATCCTGGAGCCCCGCCTCTTCCTGATGATGTCGCTGTGGAAGACCAGGATGCAGAAGCAGGTGCTTGTGGGAGCACAGGAAGTAGTGGGGATGCTAACTTCCTGCCACTGCGCTCCCGTTCCTTAAACCTGTCTGTCGACAATGCACTCTGAGAATTAAAATACAATCGCTGTGTTTCTGTACTGTTTTTAACGTGGCCTTGTCGACTTCCCCTGTGTCTCACAATGGTACACTTCTTTagtgcaaaaacacacaactgcCATGGGTctaaaacaattttatttctcTGGAAATATAAGTTACATTCAAATGGAAGTTGTGATTTCTAGAAGACTGGGTAGatttgctgcttcacagctctaAAGTCTTGGTTCGAATGCTGTCTGTGCCGAGTTTCACCCGTTTCACACGTCCTTCCgatgtttcctccaggttctccagattggctaagctaaattgcccataggggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagcgagagagagagagtgtgtgtgtgaatgtgtgtgtgcatgatgccctgtgatggactagccTCCTGTGTGGGGCGATTTGTGCCACCTTGGGTCAGTGTTCCAGGAATGGCTCTGACTAGATGATTGGGTTTCCCCTGACCAGGAGAAAGTgctaactgaagatgaatgaatgaattaattttattgctgtttaaaCTTCAGCTTCTTCCACTGTTCTATAAAAATGGCAGTATGTTGTGTTCCTGAAGTCTGCAGCGATGGCCAAGAGAATTAGCCAAGTGGAAGTGTACGAGGGGAAGTGTACGAGGGGATGTGTTAAAAACAGGAATGAAGCATGGCTGCTGGTGACAGCATTCCTCAGGGCTCCATGTAAGGACTGGAAAATGTCCACTGACTCTCACAGTAAAGCTACATatagaataattaaaaattctGTGTTCCAACTGACCAATCCCTAGCCCAGGGATTTTCTGGGTCCTCTAATAAGTGCTTAGCAATAGTTGCTATCCACCTTTACCTCAGTCAAACTTCCATCAGTTTAACAGGCCAGTGTTTTCTGAGGGCATGTTTCTTATTTGAATCTCCAAATGTGGCTAAAAAGACGTCTGAATTATCAGCATACAAAGCCTGACAGATATTAATGACTGGAAAAACCCACACAACGTCCCATTAAGGCCACTCTTTTGCAGGATTTCTGCATTATtcagtcagtaaaaaaaaaaaaaaaaactttatacatGTGCAAACATTACTTTCCCTCAAATaatcatgttacagaaaaatatttgtatgtcagtaaaaaaaaaaaaaaagtgagtaatTAGCTGCAGAAACAAAAGCAAGTGTGCAGAAGTCAGATTCTCCAGGACGCTTATAAAAACTGCCAGTTTCCTTGTGAAACTGTGCAAAGGTGTACCTGAGACTACggatgcatttttaaaggcaaagacagtagatttttttcagttcaATACATCAGTGTATTGAAACATACATTAAACATCCTGCATAATAAAGTCGACTGTTCATCATAAAATACCTCTTATATTACATGAGATGGCaagcatttaaacttaatcaaacCCACACTCCCTCCTGTGAAAAAAGTAACTTCCTGTTTATCTCGAATGAGGAGAGGCTACAgggattaaaacaaaaatgctacTCTGAGCACTTTTCAGAAAACAGTATGCTAGCCTTATAGCATTCTAGCTAGTATGTTCAGCAGCAAGCAGGAGCTGGAAGATTCCCTAAGTCTTTAAGGTCAGCGCCGGGTTGCAGCAAAGGCCTTAATTTAAGAAAACCCTAAGTTATAAGGTTAAGGATGCCCTTAGTGAAACATGGgttgcaagaaaaaaagagtCCACTTAAGGAACCTTAAGGCTGTCATTAAGTATTTCCCGTTAATTGCTCAAGTGTTCGCTGAAGTTCTGTTATGCATTGCTACAATATTCTTCGTAACCATTTCACCCTAAAATAATTAAGGGATCAGAACAGTAAAGCATTTGCTGAACTCAAATATCAAAGTACGGAGGCACATTTTTAGTGATCAAAATGATACGCAATTATTGAGAGAATATCGGTTTGACTGTTAGTCAGTTCTTCGTCTCACTGCGATACTTGAGCCTGACAGTGAGCACCAAACTCGgcggatttttttttaatacaatatgtCCAGTCTTGTAAATCAATTTAGCTTGAATGGGGACTGAAGGGTTACAGTGGCTTTGGAGGGTGTGTTTCGTTTTTGCGTATTCTTCTAAAAGAACAGATTTTTCGTCCTCGGTCCAGTTTGGTTTACGTTTCTTGTTTTTGGTACTGTTAATATTCTCCATAACTCAAATATTGTAGTACAGCTGTATAGTTGTAGCAAAGGTTAAAGTTAAACTTGTTTAATAATCAGTGGTCCATTATGTTCTGTTGATTGTGGGAGATTTTGTAACTATAGCAACCACTTCCCCAATGCCGTGCTTTGCCAGAAACTATTACGAAATGCTTAGTATACACACTTAAGTAAGGAAGACAGTACAAACATATGGCTAATGCGgcccgcacacacacaaacactcacagcaATCTCTCTGCTGCATTCAGTCAGTCTTTCATTGCTGATTCAGATTGGACTAAAGAAAGTGCTGATTGGAAAGATCATATTCAGTAGTGGAGAACGCAGGATTTAAGAACAAACATCTAGGGCTACAGAGAGCTAGTGTTATGCACTGTGTAGCTAAGACTAATGTTAAATGCTGCTCTTATCTTGTTACAGTTACCATGCTACAAGAACTTTTGTAAGGAAATTACCGTCTCCTTAAAACCTTTCCTGATCCGGCTCCCTTAGATAGCAACAGTAACAGAGTGTGGGCAGGGCTTGGGAGTATTGCAGATTTGTCATCTGACAACTGAAACTGtagctaaagctaaagctaataTCGCAAACATGCCCTCAGGAAAACTTTAGTTAGCGTGAAACAAACTGATTCAACAGTTCTCTGTCCACAAACTTCACACAAATATGATAAAGCTAAACAGTTAAAAGTCTCATCATCATAACATAACTCCTGCATGAAATGAAAGCACAAATATTATCCAGGCTTCTCCTGTAAAAAGTAATTGATCATGTTTTACAGCCAGATGTACAGCAGTGTGTCGTTGTTCAGTGAGCTCAAGCTGGAAAGCTGCCCTCTCCATGAGGTGGCACCATGGACATGTGTAACCTAGCCTAATGATGTATCTATCTTTTCATATCTATAGCTTCGTTCAATTTAAAATATCACATGACCAataactttgttttattttcactcaaGAATATGAGACACTTTTGTTAAATGCTTGTCCATTAAAATATCATTGAGATGTATTGTTAGTACACACCCTCAGAGTGCTAagtatttgtaattattttttggACTGGggacttttttaaatgttttattatttttatgtccTATGCAGTTTGTATAGATGAAAGCAGTTAATAAGTATTTAGTATTTGCATTAATGTTtagcatttattaaataaaggttTATTGTGCATTGCTTGA

Function

symbol description
bcl10 Acts upstream of or within positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity. Located in cytoplasm. Part of CBM complex. Is expressed in gill; intestine; male organism; and spleen. Human ortholog(s) of this gene implicated in MALT lymphoma; immunodeficiency 37; malignant mesothelioma; and non-Hodgkin lymphoma. Orthologous to human BCL10 (BCL10 immune signaling adaptor).

NR:

description
PREDICTED: B-cell lymphoma/leukemia 10

GO: NA

KEGG:

id description
K07368 BCL10; B-cell CLL/lymphoma 10

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_026912108.2 True 4354 mRNA 0.41 3 99678 108093
XM_026912109.2 False 4352 mRNA 0.41 3 99678 108094

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
ssx2ipa ssx2ip coding downstream 15214 65830 ~ 84464 (-)
LOC113525290 NA coding upstream 69777 177871 ~ 184973 (-)
LOC113525282 LOC108267103 coding upstream 154352 262446 ~ 272620 (-)
LOC117597016 NA coding upstream 195589 303683 ~ 321689 (-)
LOC117597018 NA coding upstream 591955 700049 ~ 704378 (-)
LOC117597015 NA coding upstream 602265 710359 ~ 719607 (-)
G57488 LOC108268216 non-coding downstream 61725 32764 ~ 37953 (-)
G57502 NA non-coding upstream 49819 157913 ~ 158767 (-)
G57526 NA non-coding upstream 69224 177318 ~ 177548 (-)
G57706 NA non-coding upstream 74962 183056 ~ 183265 (-)
G57711 NA non-coding upstream 84593 192687 ~ 197666 (-)
G57716 NA non-coding upstream 95879 203973 ~ 207155 (-)
LOC117596995 LOC108268238 other downstream 1561 84815 ~ 98117 (-)
eif2b5 eif2b5,LOC107671691,LOC107567864,LOC107660395 other upstream 171888 279982 ~ 300017 (-)
G57733 NA other upstream 192886 300980 ~ 856952 (-)
LOC117597012 NA other upstream 238965 347059 ~ 497563 (-)
LOC117597013 NA other upstream 267149 375243 ~ 451693 (-)
G57830 NA other upstream 504149 612243 ~ 614243 (-)

Expression


Co-expression Network