gal3st3 (gal3st3)


Basic Information

Item Value
gene id gal3st3
gene name gal3st3
gene type misc
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047598.1
NCBI id CM018544.1
chromosome length 33267568
location 9807321 ~ 9832280 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

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Function

symbol description
gal3st3 Predicted to enable galactosylceramide sulfotransferase activity. Predicted to act upstream of or within glycolipid biosynthetic process. Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane. Orthologous to human GAL3ST3 (galactose-3-O-sulfotransferase 3).

NR:

description
PREDICTED: galactose-3-O-sulfotransferase 3

GO: NA

KEGG:

id description
K09676 GAL3ST3; galactose-3-O-sulfotransferase 3

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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Neighbor

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LOC113539763 LOC108267503,LOC108440269 coding upstream 61273 9724729 ~ 9746048 (+)
LOC113540385 klc2,LOC102775952,LOC107728029 coding upstream 83360 9712583 ~ 9723961 (+)
LOC113539871 LOC108440271 coding upstream 99385 9649304 ~ 9707936 (+)
trnas-gcu NA coding downstream 80117 9912397 ~ 9912478 (+)
nit1 nit1 coding downstream 87580 9919860 ~ 9925854 (+)
clcn3 clcn3,LOC107692822,LOC107696737 coding downstream 95041 9927321 ~ 9966832 (+)
ino80b ino80b coding downstream 160676 9992956 ~ 9997048 (+)
LOC117597106 LOC108267738,LOC108267931,LOC108267929,LOC108267937 coding downstream 391502 10223782 ~ 10224603 (+)
G61638 NA non-coding upstream 214578 9578364 ~ 9592743 (+)
G61600 NA non-coding upstream 351161 9449043 ~ 9456160 (+)
LOC113540712 NA non-coding upstream 457607 9349502 ~ 9349714 (+)
LOC117597235 NA non-coding upstream 464207 9342902 ~ 9343114 (+)
LOC117597225 NA non-coding upstream 465349 9341759 ~ 9341972 (+)
G61689 NA non-coding downstream 48788 9881068 ~ 9968900 (+)
G61696 pfdn2,LOC103133045,LOC103145934,LOC107745204 non-coding downstream 81955 9914235 ~ 9918783 (+)
LOC113540370 NA non-coding downstream 192305 10024585 ~ 10096068 (+)
G61735 NA non-coding downstream 214312 10046592 ~ 10047551 (+)
G61785 LOC108267738,LOC108267740,LOC108267935,LOC108267929 non-coding downstream 333249 10165529 ~ 10297564 (+)
rbm14b rbm14b,LOC108267504,LOC108440267,LOC107567604,LOC107728024 other upstream 33272 9758460 ~ 9774049 (+)
LOC113539869 LOC108267273,LOC108267272,LOC108267212,LOC108267213,LOC108267290,LOC108261494,LOC108267722 other upstream 436836 8724545 ~ 9370485 (+)
G61359 LOC108267272,LOC108267273 other upstream 910592 8894470 ~ 8896729 (+)
LOC117597156 NA other upstream 1082881 8695352 ~ 8724440 (+)
LOC113526345 LOC108268111,LOC103023736,LOC105899422,LOC108436874,LOC101065160 other upstream 1744482 8056056 ~ 8062839 (+)
si:ch211-168d1.3 LOC108267908,LOC108440265 other downstream 28614 9860894 ~ 9882713 (+)
G61786 LOC108267738,LOC108267931,LOC108267740,LOC108267937,LOC108267932,LOC108267739,LOC108267929,LOC108267241 other downstream 335566 10167846 ~ 10266279 (+)
trnak-cuu_13 NA other downstream 642488 10474768 ~ 10486042 (+)
trnak-cuu_14 NA other downstream 654622 10486902 ~ 10486974 (+)
trnak-cuu_15 NA other downstream 655860 10488140 ~ 10488212 (+)

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