LOC113540079 (sh3tc1)


Basic Information

Item Value
gene id LOC113540079
gene name sh3tc1
gene type misc
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047598.1
NCBI id CM018544.1
chromosome length 33267568
location 16023194 ~ 16039984 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>XM_026936288.2
attttctttacagcacTTTGCCACTCACTGAGGCAGCTTTATATAATCCCGAATCAGAcatatttctttgtttcatgtgtgtatatgacTCTTAACGGGacagtaaagtgtaaagtgtaaagtatcCTCTAGTTTCGAGTTGCGCTTTTATCTGAGGATCCCGGAGCAGCGCGCGTGACCTGGGCTCCGTCCCAAACAGCACACTAATATAACTGTAAGTGGTAGCCTACTATTTCGACATACGGTTTGGGGCATAGCCCGTGTCACACGGCTATTTACCAGAGCACTTAGGATTCGTACTATTTAGCAAGGTAGGTAGGATGATGGTTTGGACGCAGCCACAGTCACACGGCTCTCCGCGTAAAGGCGGTGTTCTGTTTTGATATATAATTTCATCagtagtgtgtgatttgggacgtAGCCAGTCGCAGGGGGCTTTGATGAAGGCTACTTTGATGTTGATTATGGATCAGCAAAACACGGCGAGTTTCAGGGTGAAATCCGGCTCCCAAAGATTTGAAGAGTACCGCCAGGAGTTGTATGTGGAGTACTCCAGCAATGATGTGGATAATAAAGACACTTCTAAAACCGTGGACATGGAACATAAGCCGTTAAGAGCAACAGGGAGTATAAAAGGGacctcagcagtttctgaagacAAGATCCCCACAGTGTTGGCTCTTCAGCTGGCTATAGCAGAAGGTCCAGACCGGCTTCCTGCTGACAAGGACACACAGGAAGTTCTGTGCGGGAAGCTGCGTGTACTGGAGACTGACCTCAGCAATATTTCATCCTTGATCTCTGAATTCTCTGCTCATCTGGTGTCCATCAACAGTGAGGAAAGAACCATATTTATCacttttaaatcatttgaagAAATATGGAAGTTCAGCACATACCACAGAATGGGTTTCCTGCGTCAGTGTTTGGGGAACCTTCTTTTGGACCAAGAATTCTGGCTTAATGCTTTAGACCAGGAGGACTCAGGAATTGAGGTCTCAATTAAAGAGGAGGTTCTTAATCAGATGTACAAAGGCTTTCTGATGCAAGAAGGCTCATTTTTTGGGAGTTGCACAGTGAATCAGATGTTTGACAGCTGCACATCAGGCAGTGATCTTTATCTTGAGAAGGGCGATATTGCTCTGTTTGAGCCTCCATTCCTGGGCTCGGGTTGGACTGTGCTATCCTTGGCAGATGGATCAAGAGGGACTAAAGCACAGCCAGCCCTGGAACCTGTCATTCCATTTCATGAGTGGTTTCTAAAGTCCTGTCCTGAGTGGGTTTTGGTAggcagtggaaaaaaatgctGTGATCTCCCGTATCAAATTGCTGTAGGTATCTGTGAGGCTACAGAGGTGTATGATGGTAATGGACCCGATGAGCTCAGCTTTGAGGCTGGTGATCGCATCATCATCGAGGGCCTGCTGGTGACCTGTTTTGAGTGGTTCATGGGCAAGCTGGAGAGGACTGGTGATATGGGACTTGTCAAAACCAGCCTTGTAAAAGAAACCGATTCTCTTTGTGAATCTAATGAAATCTTTATGAAACAAGAAGACAGAAAAATCTTCAACTTGGAACAAGAGACGATTAAAAAGGAAGCTAttgcttttttaaagaaaacctgCCAAAGCAATGTTGCTACAGTCTACAAACTTGATTCAGCAAGTCCAAGATCAATTCAAAATGGACCCACCAACAGTGAACATGTATGCATGAAAAGAAATATTGCCAATATTTTGAATGAAATAAGGGAACCTCTTCAGAATgagcagacacagacacaagaCAGTGTGAAGCTCCAAACCGACGAGCCCACAGGATCCACAGAGTCACCGCAAGAAATCCCACACTTTACTGTATGTTCAGAGCAGGATGGTCCCAATCCAGATGGATACCATTCCCTCCTGTCCTTCCTAGGCAGCCGTGATCACCGGCCTGAGTTTCAGCCTCTCTATGCTGCCTACCCAGAATTCCTCCTGTTGCATTTCCAGGGCCACAGCGATGAGGAGGAGCTGGTAGCGTATTTAGGTGTTGCTCGGGAAGCTGCAAGAAAAAAGCGGATGTCATGGGCACAGAGCAGAATCTGTTTCCTCTTGGGACAGCTGTGTGCGGGAAGGTCAAAGTTCTCCCAGGCACGCGTCTATTATGAAGAAGCCTTAAGCGTACCCAGAGACTATTTCACAGACATGTACCTTCTCTCAGCTATCTACTCTAACCTGGCCCTCATCTATctcacacaaaaaaatgcagagaaGTATCTTGCTCTATCTGAACGTTTTGCTGCTTTATTGATGGCAGTCTGTGACTATTTATCTGGCACAGAAGACCCAGAGGTGTTGAAGTTTGCATTGAAAAAGGCAGTTCTGTCCCAGAACAAACCTGCAGAAGCCAGGGTCTGCTTCCTGCTAGCCAAGTTTTATCTGAAGCTTGGAGAAGGGACGAATGCAGTGCCTTTCATTGAACGGCTACAGATTTTGGCTGATGAGATGCCTGGAGCTTGTGACAAGTTGCGGAGTCATGGTTTTTTACTGTTAGCAAGGCTTTATAGTGACTATGGTCTTCTTCATCTAGCTGAAAGCTCAGCATGGCAAGCATGTCTGCAGGTGTCTTCCTCAGTCACTGATTGTTTCTGCAGCGTCTCTTTGCTGTTAGAGAATGGCCGAGAACTGTATGGTGTGGACATCCCAGCACAAGTGGCTCCATGTTTGACTCGAGCTGCTGCTATGGAATCTGCTGACATGGAGCCCAGCCTTTCACATGCCTATGCCCTGTGTCTGTCTTGGCTTTTCCACAAGCATGGCATGCCTAAAAGGGCAATTCAGTACATGTGTAGCTTCCTCAACCATTCCTCTGCTACCACACTGAGCCGTTCTGATGCCAGTGCTGCTCTTATCTGGCTAGCGTGGTTATATATCTGTGACTTGCAGCACCACAGTGCTCTGGATGTGCTGGACTCAGTCCTGTCCTCCCTCCCCGAGCACCGCACAACCCAGCTGGAGGGTGTCATCTATAATATGCGTGGCATCACTTTGAGACATGCTGGTGATGTAAAACAAGCTGCAGAGAACTTCCATGCTGCGGTTGATGTCTGTGAGGAGTTTGAAGATAAGCACAACTGGGCCACAGCACTGGCCAACTTTGGCTTCTTGAGTCTGCAGGTCAATGCGAAGAGGGTAGCGGAGGAGCAGCTCACCCAGGCAGTAGAGCTGTTCTCTGAGCTAGAGGATAAAGATCTAGAGATAAAGCTGAACTTTGTTGTTGTGCTTCTGGAGCTTGGGAAGCTTTATGTCTCACAGGGTTTTTATGAGAAAGGAAAGGTCTGCTATGAGTGGGCCCTGCTGATTTCCATCGTCTATGATAACTCAGAGCGCCAACTGCAAGCCACCCGTCACCTGTGCCAGCTGTATAGTGAAGCATGTCCTGATGAAGTTCAGTGTATCATCTATAATGAACACCAGCTGAACCTGCTGCACCAGACAGGAGACAGAACCCTGGAGGCAGAGATATTGGAGAAGATCAGCCAGCTGTACCTCAGCCTGGGCACCAAAAAAGCAAATAGATATGCTCTGGACTACACCAAAAGAAGTATAGGGATCTACATCGACATggggaggaagaggaaagaGGCTCACGGCTGGCTCCAGGCAGGAAAAATCTACCACATCCTCAAACAGACTGAGCTGGTGGATCTCTATGTGCAGGTAGCGCAAGACATTGCTTTAAGCACAGGAGACACACTATTCATTCTGGAGCTGCTGGAGGCCGCAGGGGACGCATTCTTTAACAGCACACTGGACAGAGAGAAAGCTGTCTGCTTCTACAGGGACCGAGCCCTCCCGATTGCAGTGAAATCAAGCAGTGTGCGTTGTCAGCTCAGATTGTGCAATAAGCTAGCAGAGTTGCTGCTACAGCTGGGACAGTATGGAGAAGCTCTGGAGTATGCGCAGACTGCATTAGAGATCAGCGTCAGTCTGGCTGACCGTTTGAACGAGCGTGTGGCGTTCCATCGTCTGGCTACGCTCTACCACTGCCTGAGTCAGTTTGAGCTTGCTGAGCACCACTTCCTAAAGGCCCTCTCGCTCTGTCCCTCGCCCTTGCAGTTTGATGAGGAAGCCCTGTACTATGTCAAGGTCTATCAGACACTAGGTGACATTACCTTCTATGATCTAAAGgATCCATTTGATGCAGCAGGTTATTACCACCTCGCCCTGGCAGCTGCCATGGACCTGGGCAATAAGAAGTCTCAGCTTGAGCTGTGCACTCGCCTGGCCACAGTCTACCACAACTTCCTCATGGATCGTGAGCTCTCCCTGCACTTCTACCAACGTGCCCGAGCCTTCGCTGCTGATCTTAATATCCGCCGCATCAACCTATCACCAAATCAGAGTTTCCGCACCACATCCCAATACAGAATCACAGCCTTGCAGGAGACAACCTAGACAGTCAAAGTgtactgagaaaacagaaaccTAAACTGCACTGAAGCACACCACTGTAATTTTTACAGACCAGATGCTTTGTGTAGTGGTTCATTTGCTTTCATTTGTGTTGACTGGCTTGCTGATATTTGAGGTCAGAAAACCTGACTGATTCAACATTTGCCCTCATCTGATTACTCGTGTTGCTCCAGCAGTCAGATTTAGCAAGAGTGTCAACTAAAGGACAAAATGTAAGTGTATGTAATACATGActgacagattaaaaaaaaagtatgaatcCACattaagtgtaataataataataataataataataataataataataataataataataataacaataatagagTCTTTGTTTATGTACATGTCCATGCCACTAATTAGCTATTATTTAATTCAGCATTTAGCATTAAGCCATTGCATTGCAACTttattgcaaaatattttttttgctagatCTCTTTGCCTGTAATggatccagggtgtattcctgcttcatttccagtattcctgggatggGCGCCAGACTCACTTCAACCTTGAACAGGATAAAGCGATTACTGAAAAATACCACATCCACAAatagatggaaagaaagaataaaccAATGAATATTAATAGAAACTAGATAATTAAAGGCAAGCCTTTAAATTTAAGTGTAACCTACATATGACTGGAGTAATATGCTCTGGTTAACATACATCTGGTTCTGACCTTTAAATGATAACACAGTTTTACAGATGGTACTTATGTAACACCCAAATGAAAGACCAGCATCAAGAGCAACTCCTAGGACCTTAGGAGTAGTTTGGAACATTttgtttgcacaaaaaaaaaaaacccatatgAAAACAAACACCATCTTTGTTTCTAGCAGACTTAGTATCAAATGTAAATCCTTACATTttaacagtatttaaaaaactcattataaacctttaaataaaaaaggttcGAAATGGACATTCAACTCTTCATATAATGTCAGAAAATCATGCACAGCTGctaaatattgttaaataattaatgtaGACTCCCTATCCTAAGTTGTCCTGCAGAATTACATGATTTTAAGCAATGGTTTAACTCCTGGAATCAAGTGAAAACAAAGAGATGCTCTGTTTTCACTAAGTGCTGAAAATGACTAGTGTTACggtttcaaataaatattttcatggcTGGTGTGATCCCA
>XM_026936290.2
cattttctttacagcacTTTGCCACTCACTGAGGCAGCTTTATATAATCCCGAATCAGAcatatttctttgtttcatgtgtgtatatgacTCTTAACGGGacagtaaagtgtaaagtgtaaagtatcCTCTAGTTTCGAGTTGCGCTTTTATCTGAGGATCCCGGAGCAGCGCGCGTGACCTGGGCTCCGTCCCAAACAGCACACTAATATAACTGTAAGTGGTAGCCTACTATTTCGACATACGGTTTGGGGCATAGCCCGTGTCACACGGCTATTTACCAGAGCACTTAGGATTCGTACTATTTAGCAAGGTAGGTAGGATGATGGTTTGGACGCAGCCACAGTCACACGGCTCTCCGCGTAAAGGCGGTGTTCTGTTTTGATATATAATTTCATCagtagtgtgtgatttgggacgtAGCCAGTCGCAGGGGGCTTTGATGAAGGCTACTTTGATGTTGATTATGGATCAGCAAAACACGGCGAGTTTCAGGGTGAAATCCGGCTCCCAAAGATTTGAAGAGTACCGCCAGGAGTTGTATGTGGAGTACTCCAGCAATGATGTGGATAATAAAGACACTTCTAAAACCGTGGACATGGAACATAAGCCGTTAAGAGCAACAGGGAGTATAAAAGGGacctcagcagtttctgaagacAAGATCCCCACAGTGTTGGCTCTTCAGCTGGCTATAGCAGAAGGTCCAGACCGGCTTCCTGCTGACAAGGACACACAGGAAGTTCTGTGCGGGAAGCTGCGTGTACTGGAGACTGACCTCAGCAATATTTCATCCTTGATCTCTGAATTCTCTGCTCATCTGGTGTCCATCAACAGTGAGGAAAGAACCATATTTATCacttttaaatcatttgaagAAATATGGAAGTTCAGCACATACCACAGAATGGGTTTCCTGCGTCAGTGTTTGGGGAACCTTCTTTTGGACCAAGAATTCTGGCTTAATGCTTTAGACCAGGAGGACTCAGGAATTGAGGTCTCAATTAAAGAGGAGGTTCTTAATCAGATGTACAAAGGCTTTCTGATGCAAGAAGGCTCATTTTTTGGGAGTTGCACAGTGAATCAGATGTTTGACAGCTGCACATCAGGCAGTGATCTTTATCTTGAGAAGGGCGATATTGCTCTGTTTGAGCCTCCATTCCTGGGCTCGGGTTGGACTGTGCTATCCTTGGCAGATGGATCAAGAGGGACTAAAGCACAGCCAGCCCTGGAACCTGTCATTCCATTTCATGAGTGGTTTCTAAAGTCCTGTCCTGAGTGGGTTTTGGTAggcagtggaaaaaaatgctGTGATCTCCCGTATCAAATTGCTGTAGGTATCTGTGAGGCTACAGAGGTGTATGATGGTAATGGACCCGATGAGCTCAGCTTTGAGGCTGGTGATCGCATCATCATCGAGGGCCTGCTGGTGACCTGTTTTGAGTGGTTCATGGGCAAGCTGGAGAGGACTGGTGATATGGGACTTGTCAAAACCAGCCTTGTAAAAGAAACCGATTCTCTTTGTGAATCTAATGAAATCTTTATGAAACAAGAAGACAGAAAAATCTTCAACTTGGAACAAGAGACGATTAAAAAGGAAGCTAttgcttttttaaagaaaacctgCCAAAGCAATGTTGCTACAGTCTACAAACTTGATTCAGCAAGTCCAAGATCAATTCAAAATGGACCCACCAACAGTGAACATGTATGCATGAAAAGAAATATTGCCAATATTTTGAATGAAATAAGGGAACCTCTTCAGAATgagcagacacagacacaagaCAGTGTGAAGCTCCAAACCGACGAGCCCACAGGATCCACAGAGTCACCGCAAGAAATCCCACACTTTACTGTATGTTCAGAGCAGGATGGTCCCAATCCAGATGGATACCATTCCCTCCTGTCCTTCCTAGGCAGCCGTGATCACCGGCCTGAGTTTCAGCCTCTCTATGCTGCCTACCCAGAATTCCTCCTGTTGCATTTCCAGGGCCACAGCGATGAGGAGGAGCTGGTAGCGTATTTAGGTGTTGCTCGGGAAGCTGCAAGAAAAAAGCGGATGTCATGGGCACAGAGCAGAATCTGTTTCCTCTTGGGACAGCTGTGTGCGGGAAGGTCAAAGTTCTCCCAGGCACGCGTCTATTATGAAGAAGCCTTAAGCGTACCCAGAGACTATTTCACAGACATGTACCTTCTCTCAGCTATCTACTCTAACCTGGCCCTCATCTATctcacacaaaaaaatgcagagaaGTATCTTGCTCTATCTGAACGTTTTGCTGCTTTATTGATGGCAGTCTGTGACTATTTATCTGGCACAGAAGACCCAGAGGTGTTGAAGTTTGCATTGAAAAAGGCAGTTCTGTCCCAGAACAAACCTGCAGAAGCCAGGGTCTGCTTCCTGCTAGCCAAGTTTTATCTGAAGCTTGGAGAAGGGACGAATGCAGTGCCTTTCATTGAACGGCTACAGATTTTGGCTGATGAGATGCCTGGAGCTTGTGACAAGTTGCGGAGTCATGGTTTTTTACTGTTAGCAAGGCTTTATAGTGACTATGGTCTTCTTCATCTAGCTGAAAGCTCAGCATGGCAAGCATGTCTGCAGGTGTCTTCCTCAGTCACTGATTGTTTCTGCAGCGTCTCTTTGCTGTTAGAGAATGGCCGAGAACTGTATGGTGTGGACATCCCAGCACAAGTGGCTCCATGTTTGACTCGAGCTGCTGCTATGGAATCTGCTGACATGGAGCCCAGCCTTTCACATGCCTATGCCCTGTGTCTGTCTTGGCTTTTCCACAAGCATGGCATGCCTAAAAGGGCAATTCAGTACATGTGTAGCTTCCTCAACCATTCCTCTGCTACCACACTGAGCCGTTCTGATGCCAGTGCTGCTCTTATCTGGCTAGCGTGGTTATATATCTGTGACTTGCAGCACCACAGTGCTCTGGATGTGCTGGACTCAGTCCTGTCCTCCCTCCCCGAGCACCGCACAACCCAGCTGGAGGGTGTCATCTATAATATGCGTGGCATCACTTTGAGACATGCTGGTGATGTAAAACAAGCTGCAGAGAACTTCCATGCTGCGGTTGATGTCTGTGAGGAGTTTGAAGATAAGCACAACTGGGCCACAGCACTGGCCAACTTTGGCTTCTTGAGTCTGCAGGTCAATGCGAAGAGGGTAGCGGAGGAGCAGCTCACCCAGGCAGTAGAGCTGTTCTCTGAGCTAGAGGATAAAGATCTAGAGATAAAGCTGAACTTTGTTGTTGTGCTTCTGGAGCTTGGGAAGCTTTATGTCTCACAGGGTTTTTATGAGAAAGGAAAGGTCTGCTATGAGTGGGCCCTGCTGATTTCCATCGTCTATGATAACTCAGAGCGCCAACTGCAAGCCACCCGTCACCTGTGCCAGCTGTATAGTGAAGCATGTCCTGATGAAGTTCAGTGTATCATCTATAATGAACACCAGCTGAACCTGCTGCACCAGACAGGAGACAGAACCCTGGAGGCAGAGATATTGGAGAAGATCAGCCAGCTGTACCTCAGCCTGGGCACCAAAAAAGCAAATAGATATGCTCTGGACTACACCAAAAGAAGTATAGGGATCTACATCGACATggggaggaagaggaaagaGGCTCACGGCTGGCTCCAGGCAGGAAAAATCTACCACATCCTCAAACAGACTGAGCTGGTGGATCTCTATGTGCAGTGACAGGTAGCGCAAGACATTGCTTTAAGCACAGGAGACACACTATTCATTCTGGAGCTGCTGGAGGCCGCAGGGGAC
>XM_034303656.1
attttctttacagcacTTTGCCACTCACTGAGGCAGCTTTATATAATCCCGAATCAGAcatatttctttgtttcatgtgtgtatatgacTCTTAACGGGacagtaaagtgtaaagtgtaaagtatcCTCTAGTTTCGAGTTGCGCTTTTATCTGAGGATCCCGGAGCAGCGCGCGTGACCTGGGCTCCGTCCCAAACAGCACACTAATATAACTGTAAGTGGTAGCCTACTATTTCGACATACGGTTTGGGGCATAGCCCGTGTCACACGGCTATTTACCAGAGCACTTAGGATTCGTACTATTTAGCAAGtagtgtgtgatttgggacgtAGCCAGTCGCAGGGGGCTTTGATGAAGGCTACTTTGATGTTGATTATGGATCAGCAAAACACGGCGAGTTTCAGGGTGAAATCCGGCTCCCAAAGATTTGAAGAGTACCGCCAGGAGTTGTATGTGGAGTACTCCAGCAATGATGTGGATAATAAAGACACTTCTAAAACCGTGGACATGGAACATAAGCCGTTAAGAGCAACAGGGAGTATAAAAGGGacctcagcagtttctgaagacAAGATCCCCACAGTGTTGGCTCTTCAGCTGGCTATAGCAGAAGGTCCAGACCGGCTTCCTGCTGACAAGGACACACAGGAAGTTCTGTGCGGGAAGCTGCGTGTACTGGAGACTGACCTCAGCAATATTTCATCCTTGATCTCTGAATTCTCTGCTCATCTGGTGTCCATCAACAGTGAGGAAAGAACCATATTTATCacttttaaatcatttgaagAAATATGGAAGTTCAGCACATACCACAGAATGGGTTTCCTGCGTCAGTGTTTGGGGAACCTTCTTTTGGACCAAGAATTCTGGCTTAATGCTTTAGACCAGGAGGACTCAGGAATTGAGGTCTCAATTAAAGAGGAGGTTCTTAATCAGATGTACAAAGGCTTTCTGATGCAAGAAGGCTCATTTTTTGGGAGTTGCACAGTGAATCAGATGTTTGACAGCTGCACATCAGGCAGTGATCTTTATCTTGAGAAGGGCGATATTGCTCTGTTTGAGCCTCCATTCCTGGGCTCGGGTTGGACTGTGCTATCCTTGGCAGATGGATCAAGAGGGACTAAAGCACAGCCAGCCCTGGAACCTGTCATTCCATTTCATGAGTGGTTTCTAAAGTCCTGTCCTGAGTGGGTTTTGGTAggcagtggaaaaaaatgctGTGATCTCCCGTATCAAATTGCTGTAGGTATCTGTGAGGCTACAGAGGTGTATGATGGTAATGGACCCGATGAGCTCAGCTTTGAGGCTGGTGATCGCATCATCATCGAGGGCCTGCTGGTGACCTGTTTTGAGTGGTTCATGGGCAAGCTGGAGAGGACTGGTGATATGGGACTTGTCAAAACCAGCCTTGTAAAAGAAACCGATTCTCTTTGTGAATCTAATGAAATCTTTATGAAACAAGAAGACAGAAAAATCTTCAACTTGGAACAAGAGACGATTAAAAAGGAAGCTAttgcttttttaaagaaaacctgCCAAAGCAATGTTGCTACAGTCTACAAACTTGATTCAGCAAGTCCAAGATCAATTCAAAATGGACCCACCAACAGTGAACATGTATGCATGAAAAGAAATATTGCCAATATTTTGAATGAAATAAGGGAACCTCTTCAGAATgagcagacacagacacaagaCAGTGTGAAGCTCCAAACCGACGAGCCCACAGGATCCACAGAGTCACCGCAAGAAATCCCACACTTTACTGTATGTTCAGAGCAGGATGGTCCCAATCCAGATGGATACCATTCCCTCCTGTCCTTCCTAGGCAGCCGTGATCACCGGCCTGAGTTTCAGCCTCTCTATGCTGCCTACCCAGAATTCCTCCTGTTGCATTTCCAGGGCCACAGCGATGAGGAGGAGCTGGTAGCGTATTTAGGTGTTGCTCGGGAAGCTGCAAGAAAAAAGCGGATGTCATGGGCACAGAGCAGAATCTGTTTCCTCTTGGGACAGCTGTGTGCGGGAAGGTCAAAGTTCTCCCAGGCACGCGTCTATTATGAAGAAGCCTTAAGCGTACCCAGAGACTATTTCACAGACATGTACCTTCTCTCAGCTATCTACTCTAACCTGGCCCTCATCTATctcacacaaaaaaatgcagagaaGTATCTTGCTCTATCTGAACGTTTTGCTGCTTTATTGATGGCAGTCTGTGACTATTTATCTGGCACAGAAGACCCAGAGGTGTTGAAGTTTGCATTGAAAAAGGCAGTTCTGTCCCAGAACAAACCTGCAGAAGCCAGGGTCTGCTTCCTGCTAGCCAAGTTTTATCTGAAGCTTGGAGAAGGGACGAATGCAGTGCCTTTCATTGAACGGCTACAGATTTTGGCTGATGAGATGCCTGGAGCTTGTGACAAGTTGCGGAGTCATGGTTTTTTACTGTTAGCAAGGCTTTATAGTGACTATGGTCTTCTTCATCTAGCTGAAAGCTCAGCATGGCAAGCATGTCTGCAGGTGTCTTCCTCAGTCACTGATTGTTTCTGCAGCGTCTCTTTGCTGTTAGAGAATGGCCGAGAACTGTATGGTGTGGACATCCCAGCACAAGTGGCTCCATGTTTGACTCGAGCTGCTGCTATGGAATCTGCTGACATGGAGCCCAGCCTTTCACATGCCTATGCCCTGTGTCTGTCTTGGCTTTTCCACAAGCATGGCATGCCTAAAAGGGCAATTCAGTACATGTGTAGCTTCCTCAACCATTCCTCTGCTACCACACTGAGCCGTTCTGATGCCAGTGCTGCTCTTATCTGGCTAGCGTGGTTATATATCTGTGACTTGCAGCACCACAGTGCTCTGGATGTGCTGGACTCAGTCCTGTCCTCCCTCCCCGAGCACCGCACAACCCAGCTGGAGGGTGTCATCTATAATATGCGTGGCATCACTTTGAGACATGCTGGTGATGTAAAACAAGCTGCAGAGAACTTCCATGCTGCGGTTGATGTCTGTGAGGAGTTTGAAGATAAGCACAACTGGGCCACAGCACTGGCCAACTTTGGCTTCTTGAGTCTGCAGGTCAATGCGAAGAGGGTAGCGGAGGAGCAGCTCACCCAGGCAGTAGAGCTGTTCTCTGAGCTAGAGGATAAAGATCTAGAGATAAAGCTGAACTTTGTTGTTGTGCTTCTGGAGCTTGGGAAGCTTTATGTCTCACAGGGTTTTTATGAGAAAGGAAAGGTCTGCTATGAGTGGGCCCTGCTGATTTCCATCGTCTATGATAACTCAGAGCGCCAACTGCAAGCCACCCGTCACCTGTGCCAGCTGTATAGTGAAGCATGTCCTGATGAAGTTCAGTGTATCATCTATAATGAACACCAGCTGAACCTGCTGCACCAGACAGGAGACAGAACCCTGGAGGCAGAGATATTGGAGAAGATCAGCCAGCTGTACCTCAGCCTGGGCACCAAAAAAGCAAATAGATATGCTCTGGACTACACCAAAAGAAGTATAGGGATCTACATCGACATggggaggaagaggaaagaGGCTCACGGCTGGCTCCAGGCAGGAAAAATCTACCACATCCTCAAACAGACTGAGCTGGTGGATCTCTATGTGCAGGTAGCGCAAGACATTGCTTTAAGCACAGGAGACACACTATTCATTCTGGAGCTGCTGGAGGCCGCAGGGGACGCATTCTTTAACAGCACACTGGACAGAGAGAAAGCTGTCTGCTTCTACAGGGACCGAGCCCTCCCGATTGCAGTGAAATCAAGCAGTGTGCGTTGTCAGCTCAGATTGTGCAATAAGCTAGCAGAGTTGCTGCTACAGCTGGGACAGTATGGAGAAGCTCTGGAGTATGCGCAGACTGCATTAGAGATCAGCGTCAGTCTGGCTGACCGTTTGAACGAGCGTGTGGCGTTCCATCGTCTGGCTACGCTCTACCACTGCCTGAGTCAGTTTGAGCTTGCTGAGCACCACTTCCTAAAGGCCCTCTCGCTCTGTCCCTCGCCCTTGCAGTTTGATGAGGAAGCCCTGTACTATGTCAAGGTCTATCAGACACTAGGTGACATTACCTTCTATGATCTAAAGgATCCATTTGATGCAGCAGGTTATTACCACCTCGCCCTGGCAGCTGCCATGGACCTGGGCAATAAGAAGTCTCAGCTTGAGCTGTGCACTCGCCTGGCCACAGTCTACCACAACTTCCTCATGGATCGTGAGCTCTCCCTGCACTTCTACCAACGTGCCCGAGCCTTCGCTGCTGATCTTAATATCCGCCGCATCAACCTATCACCAAATCAGAGTTTCCGCACCACATCCCAATACAGAATCACAGCCTTGCAGGAGACAACCTAGACAGTCAAAGTgtactgagaaaacagaaaccTAAACTGCACTGAAGCACACCACTGTAATTTTTACAGACCAGATGCTTTGTGTAGTGGTTCATTTGCTTTCATTTGTGTTGACTGGCTTGCTGATATTTGAGGTCAGAAAACCTGACTGATTCAACATTTGCCCTCATCTGATTACTCGTGTTGCTCCAGCAGTCAGATTTAGCAAGAGTGTCAACTAAAGGACAAAATGTAAGTGTATGTAATACATGActgacagattaaaaaaaaagtatgaatcCACattaagtgtaataataataataataataataataataataataataataataataataataacaataatagagTCTTTGTTTATGTACATGTCCATGCCACTAATTAGCTATTATTTAATTCAGCATTTAGCATTAAGCCATTGCATTGCAACTttattgcaaaatattttttttgctagatCTCTTTGCCTGTAATggatccagggtgtattcctgcttcatttccagtattcctgggatggGCGCCAGACTCACTTCAACCTTGAACAGGATAAAGCGATTACTGAAAAATACCACATCCACAAatagatggaaagaaagaataaaccAATGAATATTAATAGAAACTAGATAATTAAAGGCAAGCCTTTAAATTTAAGTGTAACCTACATATGACTGGAGTAATATGCTCTGGTTAACATACATCTGGTTCTGACCTTTAAATGATAACACAGTTTTACAGATGGTACTTATGTAACACCCAAATGAAAGACCAGCATCAAGAGCAACTCCTAGGACCTTAGGAGTAGTTTGGAACATTttgtttgcacaaaaaaaaaaaacccatatgAAAACAAACACCATCTTTGTTTCTAGCAGACTTAGTATCAAATGTAAATCCTTACATTttaacagtatttaaaaaactcattataaacctttaaataaaaaaggttcGAAATGGACATTCAACTCTTCATATAATGTCAGAAAATCATGCACAGCTGctaaatattgttaaataattaatgtaGACTCCCTATCCTAAGTTGTCCTGCAGAATTACATGATTTTAAGCAATGGTTTAACTCCTGGAATCAAGTGAAAACAAAGAGATGCTCTGTTTTCACTAAGTGCTGAAAATGACTAGTGTTACggtttcaaataaatattttcatggcTGGTGTGATCCCA
>XR_003403994.2
attttctttacagcacTTTGCCACTCACTGAGGCAGCTTTATATAATCCCGAATCAGAcatatttctttgtttcatgtgtgtatatgacTCTTAACGGGacagtaaagtgtaaagtgtaaagtatcCTCTAGTTTCGAGTTGCGCTTTTATCTGAGGATCCCGGAGCAGCGCGCGTGACCTGGGCTCCGTCCCAAACAGCACACTAATATAACTGTAAGTGGTAGCCTACTATTTCGACATACGGTTTGGGGCATAGCCCGTGTCACACGGCTATTTACCAGAGCACTTAGGATTCGTACTATTTAGCAAGGTAGGTAGGATGATGGTTTGGACGCAGCCACAGTCACACGGCTCTCCGCGTAAAGGCGGTGTTCTGTTTTGATATATAATTTCATCagtagtgtgtgatttgggacgtAGCCAGTCGCAGGGGGCTTTGATGAAGGCTACTTTGATGTTGATTATGGATCAGCAAAACACGGCGAGTTTCAGGGTGAAATCCGGCTCCCAAAGATTTGAAGAGTACCGCCAGGAGTTGTATGTGGAGTACTCCAGCAATGATGTGGATAATAAAGACACTTCTAAAACCGTGGACATGGAACATAAGCCGTTAAGAGCAACAGGGAGTATAAAAGGGacctcagcagtttctgaagacAAGATCCCCACAGTGTTGGCTCTTCAGCTGGCTATAGCAGAAGGTCCAGACCGGCTTCCTGCTGACAAGGACACACAGGAAGTTCTGTGCGGGAAGCTGCGTGTACTGGAGACTGACCTCAGCAATATTTCATCCTTGATCTCTGAATTCTCTGCTCATCTGGTGTCCATCAACAGTGAGGAAAGAACCATATTTATCacttttaaatcatttgaagAAATATGGAAGTTCAGCACATACCACAGAATGGGTTTCCTGCGTCAGTGTTTGGGGAACCTTCTTTTGGACCAAGAATTCTGGCTTAATGCTTTAGACCAGGAGGACTCAGGAATTGAGGTCTCAATTAAAGAGGAGGTTCTTAATCAGATGTACAAAGGCTTTCTGATGCAAGAAGGCTCATTTTTTGGGAGTTGCACAGTGAATCAGATGTTTGACAGCTGCACATCAGGCAGTGATCTTTATCTTGAGAAGGGCGATATTGCTCTGTTTGAGCCTCCATTCCTGGGCTCGGGTTGGACTGTGCTATCCTTGGCAGATGGATCAAGAGGGACTAAAGCACAGCCAGCCCTGGAACCTGTCATTCCATTTCATGAGTGGTTTCTAAAGTCCTGTCCTGAGTGGGTTTTGGTAggcagtggaaaaaaatgctGTGATCTCCCGTATCAAATTGCTGTAGGTATCTGTGAGGCTACAGAGGTGTATGATGGTAATGGACCCGATGAGCTCAGCTTTGAGGCTGGTGATCGCATCATCATCGAGGGCCTGCTGGTGACCTGTTTTGAGTGGTTCATGGGCAAGCTGGAGAGGACTGGTGATATGGGACTTGTCAAAACCAGCCTTGTAAAAGAAACCGATTCTCTTTGTGAATCTAATGAAATCTTTATGAAACAAGAAGACAGAAAAATCTTCAACTTGGAACAAGAGACGATTAAAAAGGAAGCTAttgcttttttaaagaaaacctgCCAAAGCAATGTTGCTACAGTCTACAAACTTGATTCAGCAAGTCCAAGATCAATTCAAAATGGACCCACCAACAGTGAACATGTATGCATGAAAAGAAATATTGCCAATATTTTGAATGAAATAAGGGAACCTCTTCAGAATgagcagacacagacacaagaCAGTGTGAAGCTCCAAACCGACGAGCCCACAGGATCCACAGAGTCACCGCAAGAAATCCCACACTTTACTGTATGTTCAGAGCAGGATGGTCCCAATCCAGATGGATACCATTCCCTCCTGTCCTTCCTAGGCAGCCGTGATCACCGGCCTGAGTTTCAGCCTCTCTATGCTGCCTACCCAGAATTCCTCCTGTTGCATTTCCAGGGCCACAGCGATGAGGAGGAGCTGGTAGCGTATTTAGGTGTTGCTCGGGAAGCTGCAAGAAAAAAGCGGATGTCATGGGCACAGAGCAGAATCTGTTTCCTCTTGGGACAGCTGTGTGCGGGAAGGTCAAAGTTCTCCCAGGCACGCGTCTATTATGAAGAAGCCTTAAGCGTACCCAGAGACTATTTCACAGACATGTACCTTCTCTCAGCTATCTACTCTAACCTGGCCCTCATCTATctcacacaaaaaaatgcagagaaGTATCTTGCTCTATCTGAACGTTTTGCTGCTTTATTGATGGCAGTCTGTGACTATTTATCTGGCACAGAAGACCCAGAGGTGTTGAAGTTTGCATTGAAAAAGGCAGTTCTGTCCCAGAACAAACCTGCAGAAGCCAGGGTCTGCTTCCTGCTAGCCAAGTTTTATCTGAAGCTTGGAGAAGGGACGAATGCAGTGCCTTTCATTGAACGGCTACAGATTTTGGCTGATGAGATGCCTGGAGCTTGTGACAAGTTGCGGAGTCATGGTTTTTTACTGTTAGCAAGGCTTTATAGTGACTATGGTCTTCTTCATCTAGCTGAAAGCTCAGCATGGCAAGCATGTCTGCAGGTGTCTTCCTCAGTCACTGATTGTTTCTGCAGCGTCTCTTTGCTGTTAGAGAATGGCCGAGAACTGTATGGTGTGGACATCCCAGCACAAGTGGCTCCATGTTTGACTCGAGCTGCTGCTATGGAATCTGCTGACATGGAGCCCAGCCTTTCACATGCCTATGCCCTGTGTCTGTCTTGGCTTTTCCACAAGCATGGCATGCCTAAAAGGGCAATTCAGTACATGTGTAGCTTCCTCAACCATTCCTCTGCTACCACACTGAGCCGTTCTGATGCCAGTGCTGCTCTTATCTGGCTAGCGTGGTTATATATCTGTGACTTGCAGCACCACAGTGCTCTGGATGTGCTGGACTCAGTCCTGTCCTCCCTCCCCGAGCACCGCACAACCCAGCTGGAGGGTGTCATCTATAATATGCGTGGCATCACTTTGAGACATGCTGGTGATGTAAAACAAGCTGCAGAGAACTTCCATGCTGCGGTTGATGTCTGTGAGGAGTTTGAAGATAAGCACAACTGGGCCACAGCACTGGCCAACTTTGGCTTCTTGAGTCTGCAGGTCAATGCGAAGAGGGTAGCGGAGGAGCAGCTCACCCAGGCAGTAGAGCTGTTCTCTGAGCTAGAGGATAAAGATCTAGAGATAAAGCTGAACTTTGTTGTTGTGCTTCTGGAGCTTGGGAAGCTTTATGTCTCACAGGGTTTTTATGAGAAAGGAAAGGTCTGCTATGAGTGGGCCCTGCTGATTTCCATCGTCTATGATAACTCAGAGCGCCAACTGCAAGCCACCCGTCACCTGTGCCAGCTGTATAGTGAAGCATGTCCTGATGAAGTTCAGTGTATCATCTATAATGAACACCAGCTGAACCTGCTGCACCAGACAGGAGACAGAACCCTGGAGGCAGAGATATTGGAGAAGATCAGCCAGCTGTACCTCAGCCTGGGCACCAAAAAAGCAAATAGATATGCTCTGGACTACACCAAAAGAAGTATAGGGATCTACATCGACATggggaggaagaggaaagaGGCTCACGGCTGGCTCCAGGCAGGAAAAATCTACCACATCCTCAAACAGACTGAGCTGGTGGATCTCTATGTGCAGGTAGCGCAAGACATTGCTTTAAGCACAGGAGACACACTATTCATTCTGGAGCTGCTGGAGGCCGCAGGGGACGCATTCTTTAACAGCACACTGGACAGAGAGAAAGCTGTCTGCTTCTACAGGGACCGAGCCCTCCCGATTGCAGTGAAATCAAGCAGTGTGCGTTGTCAGCTCAGATTGTGCAATAAGCTAGCAGAGTTGCTGCTACAGCTGGGACAGTATGGAGAAGCTCTGGAGTATGCGCAGACTGCATTAGAGATCAGCGTCAGTCTGGCTGACCGTTTGAACGAGCGTGTGGCGTTCCATCGTCTGGCTACGCTCTACCACTGCCTGAGTCAGTTTGAGCTTGCTGAGCACCACTTCCTAAAGGCCCTCTCGCTCTGTCCCTCGCCCTTGCAGTTTGATGAGGAAGCCCTGTACTATGTCAAGGTCTATCAGACACTAGGTGACATTACCTTCTATGATCTAAAGgATCCATTTGATGCAGCAGGTTATTACCACCTCGCCCTGGCAGCTGCCATGGACCTGGGCAATAAGAAGTCTCAGCTTGAGCTGTGCACTCGCCTGGCCACAGTCTACCACAACTTCCTCATGGATCGTGAGCTCTCCCTGCACTTCTACCAACGTGCCCGAGCCTTCGCTGCTGATCTTAATATCCGCCGCATCAACCTATCACCAAATCAGAGTTTCCGCACCACATCCCAATACAGAATCACAGCCTTGCAGGAGACAACCTAGACAGTCAAAGTgtactgagaaaacagaaaccTAAACTGCACTGAAGCACACCACTGTAATTTTTACAGACCAGATGCTTTGTGTAGTGGTTCATTTGCTTTCATTTGTGTTGACTGGCTTGCTGATATTTGAGGTCAGAAAACCTGACTGATTCAACATTTGCCCTCATCTGATTACTCGTGTTGCTCCAGCAGTCAGATTTAGCAAGAGTGTCAACTAAAGGACAAAATatCTCTTTGCCTGTAATggatccagggtgtattcctgcttcatttccagtattcctgggatggGCGCCAGACTCACTTCAACCTTGAACAGGATAAAGCGATTACTGAAAAATACCACATCCACAAatagatggaaagaaagaataaaccAATGAATATTAATAGAAACTAGATAATTAAAGGCAAGCCTTTAAATTTAAGTGTAACCTACATATGACTGGAGTAATATGCTCTGGTTAACATACATCTGGTTCTGACCTTTAAATGATAACACAGTTTTACAGATGGTACTTATGTAACACCCAAATGAAAGACCAGCATCAAGAGCAACTCCTAGGACCTTAGGAGTAGTTTGGAACATTttgtttgcacaaaaaaaaaaaacccatatgAAAACAAACACCATCTTTGTTTCTAGCAGACTTAGTATCAAATGTAAATCCTTACATTttaacagtatttaaaaaactcattataaacctttaaataaaaaaggttcGAAATGGACATTCAACTCTTCATATAATGTCAGAAAATCATGCACAGCTGctaaatattgttaaataattaatgtaGACTCCCTATCCTAAGTTGTCCTGCAGAATTACATGATTTTAAGCAATGGTTTAACTCCTGGAATCAAGTGAAAACAAAGAGATGCTCTGTTTTCACTAAGTGCTGAAAATGACTAGTGTTACggtttcaaataaatattttcatggcTGGTGTGATCCCA

Function

symbol description
sh3tc1 Orthologous to human SH3TC1 (SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1).

NR:

description
PREDICTED: SH3 domain and tetratricopeptide repeat-containing protein 1

GO: NA

KEGG:

id description
K24313 SH3TC; SH3 domain and tetratricopeptide repeat-containing protein

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_026936288.2 True 5637 mRNA 0.45 18 16023195 16039984
XM_026936290.2 False 3780 mRNA 0.47 15 16023194 16036384
XM_034303656.1 False 5549 mRNA 0.45 19 16023195 16039984
XR_003403994.2 False 5405 misc_RNA 0.46 19 16023195 16039984

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
plaa plaa,LOC107549730,LOC107661955,LOC107660709 coding upstream 22249 15992175 ~ 16000945 (+)
cckar cckar coding upstream 106273 15904355 ~ 15916921 (+)
zmp:0000000660 arap2 coding upstream 1054593 14889300 ~ 14968601 (+)
paqr9 paqr9 coding upstream 1193283 14824102 ~ 14829911 (+)
adam19a adam19a,LOC108267694,LOC108428568,LOC107708434 coding upstream 1261629 14686254 ~ 14761565 (+)
htra3b htra3,LOC107757896,LOC107707797,LOC107660743,LOC107661977,LOC107549726 coding downstream 221 16040205 ~ 16050628 (+)
ttc5 ttc5,LOC107738047,LOC107683587 coding downstream 45693 16085677 ~ 16092460 (+)
si:ch211-212k18.5 sall2 coding downstream 58899 16098883 ~ 16107737 (+)
slc7a7 slc7a7,LOC107558406,LOC107738042,LOC107683525,LOC107731885,LOC107574338 coding downstream 68992 16108976 ~ 16120319 (+)
casp23 NA coding downstream 85032 16125016 ~ 16129309 (+)
G65170 NA non-coding upstream 21733 16001155 ~ 16001461 (+)
G65115 NA non-coding upstream 152423 15869198 ~ 15870771 (+)
LOC117597190 NA non-coding upstream 466270 15506292 ~ 15556924 (+)
G64963 NA non-coding upstream 821666 15201309 ~ 15201528 (+)
LOC117597182 NA non-coding upstream 1011701 14977326 ~ 15011493 (+)
G65199 NA non-coding downstream 22104 16062088 ~ 16063461 (+)
G65335 znf638 non-coding downstream 183434 16223418 ~ 16231115 (+)
G65382 NA non-coding downstream 352145 16392129 ~ 16392363 (+)
G65395 NA non-coding downstream 390477 16430461 ~ 16430686 (+)
G65495 NA non-coding downstream 391961 16431945 ~ 16442900 (+)
zgc:194930 LOC108268002 other upstream 1364258 14632030 ~ 14658936 (+)
brms1 brms1,LOC108268191,LOC108428539,LOC107661966,LOC107721670,LOC107661087,LOC105894187,LOC107583285 other upstream 1753854 14255744 ~ 14269340 (+)
gc2 LOC108267421,LOC108412585 other upstream 2303740 13705417 ~ 13719454 (+)
cited1 cited1 other upstream 2460928 13558623 ~ 13562266 (+)
LOC113539889 LOC108267838 other upstream 2548157 13468552 ~ 13475037 (+)
LOC113539780 LOC108268335,LOC108434603,LOC107731925,LOC107595313,LOC793560,LOC107675495,LOC107683530,LOC107738035 other downstream 270229 16310213 ~ 16319166 (+)
LOC113540582 cyb5d1,LOC108267266,LOC108434590,LOC107738084,LOC107683579,LOC106577649,LOC105907155,LOC107595290,LOC107707052,LOC107702060 other downstream 327972 16367956 ~ 16370957 (+)
arrb2b arrb2,arrb2b,LOC108434652,LOC108267683,LOC105904870,LOC101076921,LOC107750580,LOC107593814,LOC107561939 other downstream 1295513 17335497 ~ 17401388 (+)
LOC113539940 NA other downstream 1569508 17609492 ~ 17620079 (+)
ctdnep1b ctdnep1,ctdnep1b,ctdnep1a,LOC108413724,LOC107659132,LOC107679908,LOC107747382 other downstream 1960174 18000158 ~ 18010962 (+)

Expression


Co-expression Network