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Basic Information


Item Value
gene id zgc:55943
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gene type coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_047598.1
NCBI id CM018544.1
chromosome length 33267568
location 27468048 ~ 27477673 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence


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Function


symbol description
zgc:55943 Orthologous to human C1orf21 (chromosome 1 open reading frame 21).

NR:

description
uncharacterized protein C1orf21 homolog isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA


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Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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LOC113540696 NA non-coding downstream 80092 27557765 ~ 27557902 (+)
sgip1b LOC108267185,LOC108430747,LOC107593781,LOC107719259,LOC107681818,LOC107709351 other upstream 61650 27384807 ~ 27406398 (+)
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zgc:66427 zgc:66427,LOC108267510,LOC107738154,LOC101067737,LOC107100876,LOC103396713,LOC104950485,LOC107659393,LOC107668973,LOC107706368,LOC107557724,LOC107591360 other upstream 1175264 26288290 ~ 26292784 (+)
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htr5ab htr5a,htr5ab,LOC108412811,LOC103024346,LOC107684958,LOC107659435,LOC107591053,LOC107742155,LOC107598724 other downstream 838731 28316404 ~ 28338173 (+)
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Expression



Co-expression Network