LOC113540685 (LOC108267717)


Basic Information

Item Value
gene id LOC113540685
gene name LOC108267717
gene type coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047598.1
NCBI id CM018544.1
chromosome length 33267568
location 26983741 ~ 27013645 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>XM_026937325.2
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G71550 NA non-coding upstream 197181 26784572 ~ 26786560 (+)
G71519 NA non-coding upstream 315613 26667762 ~ 26668128 (+)
G71485 NA non-coding upstream 432715 26472575 ~ 26551026 (+)
G71482 NA non-coding upstream 519427 26464011 ~ 26464314 (+)
G71819 NA non-coding downstream 29058 27042703 ~ 27042912 (+)
G71827 NA non-coding downstream 60196 27073841 ~ 27074076 (+)
G71864 NA non-coding downstream 182356 27196001 ~ 27196373 (+)
G71868 NA non-coding downstream 203707 27217352 ~ 27217839 (+)
G71869 NA non-coding downstream 204582 27218227 ~ 27218455 (+)
gng7 NA other upstream 102271 26872676 ~ 26881470 (+)
LOC117597079 LOC108267150,LOC107738160 other upstream 607915 26353189 ~ 26375826 (+)
zgc:66427 zgc:66427,LOC108267510,LOC107738154,LOC101067737,LOC107100876,LOC103396713,LOC104950485,LOC107659393,LOC107668973,LOC107706368,LOC107557724,LOC107591360 other upstream 690957 26288290 ~ 26292784 (+)
G71385 NA other upstream 754550 26228764 ~ 26229191 (+)
LOC117597118 LOC108261462,LOC108261092,LOC108261095 other upstream 759703 26216064 ~ 26224038 (+)
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insig1 insig1 other downstream 1289206 28302851 ~ 28383422 (+)
htr5ab htr5a,htr5ab,LOC108412811,LOC103024346,LOC107684958,LOC107659435,LOC107591053,LOC107742155,LOC107598724 other downstream 1302759 28316404 ~ 28338173 (+)
gng5 NA other downstream 1744900 28758545 ~ 28761451 (+)
selenot1a selenot,selt1a,LOC107681817,LOC107708642 other downstream 1779202 28792847 ~ 28797159 (+)

Expression


Co-expression Network