G41857



Basic Information


Item Value
gene id G41857
gene name NA
gene type non-coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_047597.1
NCBI id CM018543.1
chromosome length 33776708
location 6951392 ~ 6968839 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence


>TU49521
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Function


GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU49521 True 17301 lncRNA 0.38 2 6951392 6968839

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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G41752 pkd2 non-coding upstream 248586 6662282 ~ 6702806 (+)
G41654 NA non-coding upstream 349229 6601912 ~ 6602163 (+)
G41653 herc3,LOC108263070,LOC108441136,LOC108441137,LOC108262885 non-coding upstream 352425 6598703 ~ 6598967 (+)
G41651 NA non-coding upstream 365944 6584855 ~ 6585448 (+)
G41600 NA non-coding upstream 399277 6519059 ~ 6552115 (+)
G41951 NA non-coding downstream 47865 7016704 ~ 7016925 (+)
G42093 NA non-coding downstream 379320 7348159 ~ 7393784 (+)
G42098 LOC108262753 non-coding downstream 392361 7361200 ~ 7364931 (+)
G42208 NA non-coding downstream 453252 7422091 ~ 7422296 (+)
LOC117596850 NA non-coding downstream 504531 7473370 ~ 7475040 (+)
inpp4b inpp4b,LOC107703845,LOC107657998 other upstream 722707 5895431 ~ 6228685 (+)
znf827 znf827 other upstream 1593532 5263582 ~ 5357860 (+)
G41047 NA other upstream 1609642 5318534 ~ 5341750 (+)
nr3c2 nr3c2,LOC107598757 other upstream 2179788 4664316 ~ 4771604 (+)
LOC113545357 NA other upstream 3116766 3831867 ~ 3834626 (+)
G42075 NA other downstream 235111 7203950 ~ 7221023 (+)
scoca scoca,scoc,LOC108263532,LOC107737083,LOC107674238,LOC103034491,LOC107556533,LOC107671340 other downstream 651706 7620545 ~ 7630140 (+)
naa15b naa15b,LOC108263533,LOC108434806,LOC107712022,LOC107671368,LOC107737080 other downstream 680359 7649198 ~ 7671410 (+)
G42685 NA other downstream 1496908 8465747 ~ 8466312 (+)
trnak-cuu NA other downstream 1500785 8469624 ~ 8469881 (+)

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