LOC113541837



Basic Information


Item Value
gene id LOC113541837
gene name NA
gene type non-coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_047597.1
NCBI id CM018543.1
chromosome length 33776708
location 14617608 ~ 14626490 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence


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>TU54850
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>TU54851
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>XR_003404224.2
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>XR_004577856.1
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Function


GO:

id name namespace
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KEGG: NA

RNA


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Neighbor


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G46175 NA non-coding upstream 434415 14182991 ~ 14183193 (+)
G45875 NA non-coding upstream 721073 13894142 ~ 13896535 (+)
G46638 NA non-coding downstream 339416 14965906 ~ 15011989 (+)
G46713 NA non-coding downstream 387633 15014123 ~ 15015181 (+)
G46765 hps6 non-coding downstream 453323 15079813 ~ 15084310 (+)
G46833 NA non-coding downstream 792539 15419029 ~ 15419642 (+)
G46849 NA non-coding downstream 846711 15473201 ~ 15473870 (+)
cgas NA other upstream 249508 14361367 ~ 14368100 (+)
slc24a3 slc24a3,LOC107693448,LOC107718828,LOC107716313,LOC107673935 other upstream 331066 14213369 ~ 14286542 (+)
pcbd1 pcbd1,LOC107743500,LOC107601888,LOC107655445,LOC107559335 other upstream 1116558 13498048 ~ 13501050 (+)
si:ch211-223p8.8 si:ch211-223p8.8,LOC108262662,LOC108426807,LOC107552909,LOC107743613,LOC107552922 other upstream 1583258 13032050 ~ 13034350 (+)
col17a1b LOC108263226,LOC108426809 other upstream 1612285 12982406 ~ 13005323 (+)
borcs7 borcs7 other downstream 346078 14972568 ~ 14974068 (+)
eif4ebp2 eif4ebp2,LOC107564345,LOC107668794,LOC107716353 other downstream 1166916 15793406 ~ 15797204 (+)
cxcl18a.1 LOC108263637 other downstream 1444224 16070714 ~ 16075650 (+)
cxcl12a cxcl12 other downstream 1498137 16124627 ~ 16134002 (+)
lrrc18a lrrc18,LOC108263378 other downstream 1608024 16234514 ~ 16237542 (+)

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