slc29a1a (LOC100304808,LOC108430281,LOC107655740)


Basic Information

Item Value
gene id slc29a1a
gene name LOC100304808,LOC108430281,LOC107655740
gene type coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047597.1
NCBI id CM018543.1
chromosome length 33776708
location 26016620 ~ 26063912 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>XM_026939416.2
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>XM_026939419.2
TTTTCAATGTGTAGCAGCTTTGCATGTGAATGAGTGAACCGCCGTGTTTTTGAGCACCGGTACGGACACCTAAAAGAGGAAAGGAGAACCGATGGCTTTTTTAGACAATCACTGCAGCTTAAGAAGCTTTTGAATCTGAACCGTAAACATTCCACCAGTGAGAAATAATGACCGCCATTAATTCACCACGAGACAGGTATAATGCTGTATGGATTATATTTTTCATCCTGGGCCTGGGAACTCTTCTGCCATGGAACTTCTTCATGACTGCCAGCATGTACTTCACCAGCCGTCTCAGAGATCCTCCTATAAATGCAGATGGTCAGAACCTGACCCTCAATGGCACACTGGTAGAAGGTGACACGCGCAGCGTCCTGGAATCGATATTCAACAACGTGATGACCTTGTGTGCCATGGTGCCACTGCTCATCTTCACCTGCCttaattccttcattcatcAGAGGATTCCTCAGAAATGGAGGATCTCCGGCAGCCTCTCTGTGATCCTGCTGGTGTTTCTGATCACCGCAGTGTTGGTCAAGGTGGACATGGCCCCTCTGCCCTTtttcaccttcaccatgatCAAAATCATCTGCATCAACTCTTTTGGTGCGATTCTGCAGGGGAGTCTCTTTGGGCTGGCAGGAATGCTTCCAGCTTCTTATACTGCTCCCATCATGAGCGGCCAGGGATTCGCTGGAACATTCGCAGCCTTTTCCATGATCTGTGCACTCGCCAGTGGCTCAGCGCTGCAGGACAGTGCTTTTGGCTACTTCATCACTGCCTGTGTTGTAATTGTTCTGGCCATCATTTCTTACTTTGCCCTGCCCAAAATGGAATTTTTCAAGTATTACGCAGACTCCAGTAGCCCCAAACCTTGCAGCGAAGAGGAAAACAATATGGACCTGTTGAACAAAGaaaacccAGGGGAGAAGCCCGCAGTAGTGAGTCTGGCTGATGAGGAGACCACACATACCATCTCTGTGTTTGCCATCTTTCAAAAGATCAGGGTGATGGCCCTTTCAGTGTGCTTTGTCTTCACCATCACTATTGGAATATTCCCTGCTGTGACTGTGGATGTGAAGTCCTTTGCGGCTGAAGATGGTGTTTGGAAAAACTACTTCATTCCCGTGTTCTGCTTCTTGCTCTTTAACTTGATGGACTGGGCTGGAAGAAGCTTAATTGCAAAGTGCACATGGCCTGGGAAAGACAGCAAATGGCTGCCTGTGCTGGTGATACTTCGTGTCATATTCATCCCCCTCTTCATCCTGTGTAACGTGCAACCCAGAAACAACCTGCCCGTTTTTTTCGCTCATGACGCCTGGTACATCGTTTTCATGATCATCTTCTCATTCAGCAACGGCTACCTAGCCAGCCTGTGCATGTGCTTCGGACCCAAGAAAGTGGCCCAGCATGAAGCAGAAACAGCTGGGGCCATCATGGCCTTCTTCCTGTCCTTGGGTCTGGCGCTGGGAGCTGCGCTGTCCTTTGGCATCAGGGCAATGATCTAGAACCTTTGACTCAGTACATACCGCCTTCTAGGGGGAAGGACAGAAACATTGCCAAACTGCTCAACACGTTGCCATTTGGAAACACACGGATTTAGTATTTAATCGGGCTTCCGAGTtcaacagaactgctgctctgCCGAAACAGAAAATAACACTTATTCAGAAGGAATGTGTTCCATGTGTTCCATGGAAACCTGTTCTTTAGAAACCTGGAGCAGACACTGTGGACGGGGTTGGTGTTGGAAAGAACAATTTACCACAAACTGTTCGATCAAAAGCCATTGtgtaagccaaaaaaaaaaaaaagcattttattagcttacgtttttttttccttctttctttctgggTGTTCAGAGTTAGTTATTTTCTTCAGTTTGAAGTAGTAACAGAATGATCATAGAATCATTTGTTTATTGAAtgtgttttgttgtattttaggctcatagctttttatttaacattatttttaagaaGTGCTAGTACTAATATAGAACctcgctaaaaaaaaaaaaaaaaagggcagtagttagttacactacactgtaacaGGGCTTGTGTTTGTGCTGATGAAGTAACAGGCACCATGTTTATTTCTCCTGTAACTGCATCTGgtcacaattatttttaatggaatatatttttaatattttttttttacgtgtaTTATCATGTTGGTTTAGTTAAGAAGAgcataaagctttaaaggtgtactgcaacttttttttaatcatcagcaATGTGTGGGGAAAATACTGAGGATGTACAGTATTTGCTCTGAACAAATACTCAGGTCAGGTTAAATCTCACTTATTATACAAGgcagtaaataaaattttaagagatgggactttttttttttggaaacatttttGGTTCTGCATTACCAACCTAGTCAGTGtaccacaataaaaaaaaagtgccagcAGTAAAAAGAAAGTGCAACCTGAATAACTTTTTTTGGTAAGACCTTCTGTCTGCCAGACCTTTGTTAGTATGCCAAGATTGTAATTTTAAATCCCAGTTATGTGAgatgtatttaaaaacatttattatcgAGGTTTATAGGTTCCATTTGGAGTTAGTTTTgtgtaaacaggttttctgttcttctctTGTACTCCTGTATGTGTGGTGTGCACTCCCGCTCTATAGATGTGATGGATAAAGATTAAGGTTAAACAGTCAGTGTGCTCATTAAATAGCTGCCAGTTCTCATGTTTCATTACAGCAGACCTTTATTTTCATCATACCAGTGATTCAGCACACTGCACTGCCTTGGTTGTGGTGTCCTCAATAAAACCTGAGCGGAATTCTCTGCTAAattaa
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>XM_034303055.1
GCTCAGCTTGAGCTTAATGCTTTTGAATCTGAACCGTAAACATTCCACCAGTGAGAAATAATGACCGCCATTAATTCACCACGAGACAGGTATAATGCTGTATGGATTATATTTTTCATCCTGGGCCTGGGAACTCTTCTGCCATGGAACTTCTTCATGACTGCCAGCATGTACTTCACCAGCCGTCTCAGAGATCCTCCTATAAATGCAGATGGTCAGAACCTGACCCTCAATGGCACACTGGTAGAAGGTGACACGCGCAGCGTCCTGGAATCGATATTCAACAACGTGATGACCTTGTGTGCCATGGTGCCACTGCTCATCTTCACCTGCCttaattccttcattcatcAGAGGATTCCTCAGAAATGGAGGATCTCCGGCAGCCTCTCTGTGATCCTGCTGGTGTTTCTGATCACCGCAGTGTTGGTCAAGGTGGACATGGCCCCTCTGCCCTTtttcaccttcaccatgatCAAAATCATCTGCATCAACTCTTTTGGTGCGATTCTGCAGGGGAGTCTCTTTGGGCTGGCAGGAATGCTTCCAGCTTCTTATACTGCTCCCATCATGAGCGGCCAGGGATTCGCTGGAACATTCGCAGCCTTTTCCATGATCTGTGCACTCGCCAGTGGCTCAGCGCTGCAGGACAGTGCTTTTGGCTACTTCATCACTGCCTGTGTTGTAATTGTTCTGGCCATCATTTCTTACTTTGCCCTGCCCAAAATGGAATTTTTCAAGTATTACGCAGACTCCAGTAGCCCCAAACCTTGCAGCGAAGAGGAAAACAATATGGACCTGTTGAACAAAGaaaacccAGGGGAGAAGCCCGCAGTAGTGAGTCTGGCTGATGAGGAGACCACACATACCATCTCTGTGTTTGCCATCTTTCAAAAGATCAGGGTGATGGCCCTTTCAGTGTGCTTTGTCTTCACCATCACTATTGGAATATTCCCTGCTGTGACTGTGGATGTGAAGTCCTTTGCGGCTGAAGATGGTGTTTGGAAAAACTACTTCATTCCCGTGTTCTGCTTCTTGCTCTTTAACTTGATGGACTGGGCTGGAAGAAGCTTAATTGCAAAGTGCACATGGCCTGGGAAAGACAGCAAATGGCTGCCTGTGCTGGTGATACTTCGTGTCATATTCATCCCCCTCTTCATCCTGTGTAACGTGCAACCCAGAAACAACCTGCCCGTTTTTTTCGCTCATGACGCCTGGTACATCGTTTTCATGATCATCTTCTCATTCAGCAACGGCTACCTAGCCAGCCTGTGCATGTGCTTCGGACCCAAGAAAGTGGCCCAGCATGAAGCAGAAACAGCTGGGGCCATCATGGCCTTCTTCCTGTCCTTGGGTCTGGCGCTGGGAGCTGCGCTGTCCTTTGGCATCAGGGCAATGATCTAGAACCTTTGACTCAGTACATACCGCCTTCTAGGGGGAAGGACAGAAACATTGCCAAACTGCTCAACACGTTGCCATTTGGAAACACACGGATTTAGTATTTAATCGGGCTTCCGAGTtcaacagaactgctgctctgCCGAAACAGAAAATAACACTTATTCAGAAGGAATGTGTTCCATGTGTTCCATGGAAACCTGTTCTTTAGAAACCTGGAGCAGACACTGTGGACGGGGTTGGTGTTGGAAAGAACAATTTACCACAAACTGTTCGATCAAAAGCCATTGtgtaagccaaaaaaaaaaaaaagcattttattagcttacgtttttttttccttctttctttctgggTGTTCAGAGTTAGTTATTTTCTTCAGTTTGAAGTAGTAACAGAATGATCATAGAATCATTTGTTTATTGAAtgtgttttgttgtattttaggctcatagctttttatttaacattatttttaagaaGTGCTAGTACTAATATAGAACctcgctaaaaaaaaaaaaaaaaagggcagtagttagttacactacactgtaacaGGGCTTGTGTTTGTGCTGATGAAGTAACAGGCACCATGTTTATTTCTCCTGTAACTGCATCTGgtcacaattatttttaatggaatatatttttaatattttttttttacgtgtaTTATCATGTTGGTTTAGTTAAGAAGAgcataaagctttaaaggtgtactgcaacttttttttaatcatcagcaATGTGTGGGGAAAATACTGAGGATGTACAGTATTTGCTCTGAACAAATACTCAGGTCAGGTTAAATCTCACTTATTATACAAGgcagtaaataaaattttaagagatgggactttttttttttggaaacatttttGGTTCTGCATTACCAACCTAGTCAGTGtaccacaataaaaaaaaagtgccagcAGTAAAAAGAAAGTGCAACCTGAATAACTTTTTTTGGTAAGACCTTCTGTCTGCCAGACCTTTGTTAGTATGCCAAGATTGTAATTTTAAATCCCAGTTATGTGAgatgtatttaaaaacatttattatcgAGGTTTATAGGTTCCATTTGGAGTTAGTTTTgtgtaaacaggttttctgttcttctctTGTACTCCTGTATGTGTGGTGTGCACTCCCGCTCTATAGATGTGATGGATAAAGATTAAGGTTAAACAGTCAGTGTGCTCATTAAATAGCTGCCAGTTCTCATGTTTCATTACAGCAGACCTTTATTTTCATCATACCAGTGATTCAGCACACTGCACTGCCTTGGTTGTGGTGTCCTCAATAAAACCTGAGCGGAATTCTCTGCTAAattaa

Function

NR:

description
equilibrative nucleoside transporter 1-like

GO: NA

KEGG:

id description
K15014 SLC29A1_2_3, ENT1_2_3; solute carrier family 29 (equilibrative nucleoside transporter), member 1/2/3

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_034303055.1 False 2733 mRNA 0.42 13 26036521 26063912

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
vip vip,LOC108262931,LOC107735294 coding upstream 29476 25982599 ~ 25987144 (+)
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LOC113541966 fbln7,LOC107679196,LOC107754577,LOC107733340,LOC107585467 coding upstream 291350 25697860 ~ 25725270 (+)
LOC117596833 NA coding upstream 330839 25676862 ~ 25685781 (+)
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LOC113542124 LOC108263832 coding downstream 567653 26631565 ~ 26635213 (+)
fbxo9 fbxo9,LOC107712342,LOC107751337 coding downstream 606980 26670892 ~ 26684508 (+)
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G52873 NA non-coding downstream 157401 26221313 ~ 26221544 (+)
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G52884 NA non-coding downstream 299527 26363439 ~ 26363733 (+)
G52885 wdr11 non-coding downstream 302280 26366192 ~ 26369260 (+)
G53080 NA non-coding downstream 464495 26528407 ~ 26533502 (+)
bcl2l11 bcl2l11 other upstream 152274 25850600 ~ 25864346 (+)
acoxl acoxl other upstream 169717 25801972 ~ 25846903 (+)
golga4 golga4 other upstream 421684 25562402 ~ 25594936 (+)
b3galnt2 b3galnt2 other upstream 1614166 24350184 ~ 24402454 (+)
LOC113540163 NA other upstream 1958722 24055154 ~ 24057898 (+)
G53328 NA other downstream 922066 26985978 ~ 26992711 (+)
znf451 znf451 other downstream 1133997 27197909 ~ 27207245 (+)
pde10a pde10a other downstream 2137123 28201035 ~ 28301823 (+)
G53692 NA other downstream 2383465 28447377 ~ 28448311 (+)
LOC113542011 glyat,LOC108263175,LOC108263176 other downstream 2402176 28466088 ~ 28496606 (+)

Expression


Co-expression Network