unc5b (unc5b,LOC108263852)


Basic Information

Item Value
gene id unc5b
gene name unc5b,LOC108263852
gene type coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047597.1
NCBI id CM018543.1
chromosome length 33776708
location 15259363 ~ 15322047 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>XM_026940827.2
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Function

symbol description
unc5b Predicted to enable netrin receptor activity. Acts upstream of or within branching involved in blood vessel morphogenesis and negative regulation of angiogenesis. Predicted to be located in plasma membrane. Predicted to be integral component of membrane. Is expressed in several structures, including immature eye; nervous system; neural keel; pectoral fin bud; and trunk vasculature. Orthologous to human UNC5B (unc-5 netrin receptor B).

NR:

description
PREDICTED: netrin receptor UNC5B isoform X1

GO:

id name namespace
GO:0016525 negative regulation of angiogenesis biological_process
GO:0001569 branching involved in blood vessel morphogenesis biological_process
GO:0007165 signal transduction biological_process
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GO:0005515 protein binding molecular_function

KEGG:

id description
K07521 UNC5; netrin receptor unc-5

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_034302958.1 False 6458 mRNA 0.45 16 15282886 15322047

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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G47043 LOC108242967,LOC103387234,LOC106515310,LOC107375910,LOC107098787,LOC103476842 non-coding downstream 389090 15711137 ~ 15715524 (+)
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pcbd1 pcbd1,LOC107743500,LOC107601888,LOC107655445,LOC107559335 other upstream 1758313 13498048 ~ 13501050 (+)
si:ch211-223p8.8 si:ch211-223p8.8,LOC108262662,LOC108426807,LOC107552909,LOC107743613,LOC107552922 other upstream 2225013 13032050 ~ 13034350 (+)
eif4ebp2 eif4ebp2,LOC107564345,LOC107668794,LOC107716353 other downstream 471359 15793406 ~ 15797204 (+)
cxcl18a.1 LOC108263637 other downstream 748667 16070714 ~ 16075650 (+)
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lrrc18a lrrc18,LOC108263378 other downstream 912467 16234514 ~ 16237542 (+)
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Expression


Co-expression Network