rcor1 (rcor1,LOC107733187,LOC107590914,LOC107582277,LOC107719500)


Basic Information

Item Value
gene id rcor1
gene name rcor1,LOC107733187,LOC107590914,LOC107582277,LOC107719500
gene type coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047604.1
NCBI id CM018550.1
chromosome length 29376037
location 21193918 ~ 21205161 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

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Function

symbol description
rcor1 Predicted to enable transcription corepressor activity. Acts upstream of or within hemopoiesis and regulation of retinoic acid biosynthetic process. Predicted to be located in nucleus. Predicted to be part of histone deacetylase complex and transcription regulator complex. Is expressed in eye; head; intestine; and optic tectum. Orthologous to human RCOR1 (REST corepressor 1).

NR:

description
PREDICTED: REST corepressor 1-like

GO:

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KEGG:

id description
K11829 RCOR1, COREST; REST corepressor 1

RNA

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LOC113538658 NA other upstream 1271432 19913343 ~ 19922486 (+)
G169577 heatr5a,LOC108412624 other downstream 464746 21669907 ~ 21674461 (+)
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G169692 LOC107990201 other downstream 614120 21819281 ~ 21820059 (+)
LOC113533992 gphna,gphn,LOC108270253,LOC108443923,LOC107752769,LOC107657705,LOC107733155 other downstream 1656646 22861807 ~ 23022395 (+)
kdm1a kdm1a other downstream 3258305 24463466 ~ 24482854 (+)

Expression


Co-expression Network