retreg3 (fam134c)


Basic Information

Item Value
gene id retreg3
gene name fam134c
gene type misc
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047607.1
NCBI id CM018553.1
chromosome length 26458119
location 4692477 ~ 4711316 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>TU243164
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>XM_026916470.2
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Function

NR:

description
PREDICTED: protein FAM134C

GO: NA

KEGG:

id description
K23880 RETREG; reticulophagy regulator

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU243164 False 5065 lncRNA 0.37 1 4706245 4711309
XM_026916470.2 True 7560 mRNA 0.41 11 4692477 4711316

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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moto meioc coding upstream 466432 4215915 ~ 4226045 (+)
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wnt9b wnt9b,LOC108259511,LOC107721476,LOC108427420,LOC107601233 coding downstream 270710 4982026 ~ 4991251 (+)
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plekhh3 plekhh3,LOC107601293,LOC107720008,LOC107688129 other upstream 21831 4620218 ~ 4670646 (+)
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tmem98 tmem98,LOC107674611,LOC107738157,LOC107654470,LOC107720031 other downstream 1178236 5889552 ~ 5898200 (+)
si:ch211-198p11.6 LOC108276725 other downstream 1419464 6130780 ~ 6134572 (+)

Expression


Co-expression Network