G208507


Basic Information

Item Value
gene id G208507
gene name NA
gene type non-coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047607.1
NCBI id CM018553.1
chromosome length 26458119
location 9846084 ~ 9858882 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>TU247001
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Function

NR:

description
PREDICTED: scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130-like, partial

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU247001 True 12720 lncRNA 0.36 2 9846084 9858882

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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atp5mc1 atp5g1,LOC108256653,LOC108413019,LOC107740625,LOC107662391,LOC107585044,LOC107582887 coding upstream 34503 9806798 ~ 9811581 (+)
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LOC113528384 slc25a17,LOC108412891,LOC106601749,LOC107666095,LOC107743042,LOC107548713 coding downstream 356163 10215045 ~ 10222874 (+)
G208472 NA non-coding upstream 98074 9746285 ~ 9748010 (+)
G208415 hoxb9,hoxb9a,LOC107662432,LOC107585091 non-coding upstream 107218 9737009 ~ 9738866 (+)
G208430 NA non-coding upstream 112037 9732608 ~ 9734047 (+)
G208403 NA non-coding upstream 290270 9555612 ~ 9555814 (+)
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G208504 NA non-coding downstream 6095 9864977 ~ 9883127 (+)
G208488 col1a1a,LOC108279263,LOC107585052,LOC107740634 non-coding downstream 180527 10039409 ~ 10061965 (+)
G208700 NA non-coding downstream 362401 10221283 ~ 10221539 (+)
G208701 dxo,LOC107752708,LOC107666098,LOC107691245,LOC107743041 non-coding downstream 366701 10225583 ~ 10226503 (+)
G208783 NA non-coding downstream 483026 10341908 ~ 10342224 (+)
nupr1b nupr1,LOC108413333,LOC107660958,LOC107739393,LOC107567154,LOC100692788,LOC103393451 other upstream 782671 9061563 ~ 9063413 (+)
asphd1 asphd1,LOC107568490,LOC107755186,LOC107552472,LOC107739384 other upstream 887984 8950466 ~ 8958100 (+)
trnas-cga_1 NA other upstream 1837673 8008186 ~ 8008411 (+)
G207480 LOC107834952 other upstream 1992575 7853191 ~ 7853509 (+)
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rapgefl1 rapgefl1,LOC107717207,LOC107662398,LOC107740631,LOC107667751,LOC107585050,LOC106600822 other downstream 85424 9944306 ~ 9987773 (+)
G208781 cacng4b,LOC108259704,LOC106606650,LOC107565862,LOC107691234,LOC106601773,LOC107724746,LOC107713946 other downstream 490520 10349402 ~ 10781459 (+)
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luc7l3 luc7l3,LOC107674472,LOC107726809,LOC107654661 other downstream 1708237 11567119 ~ 11577823 (+)
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Expression


Co-expression Network