cdc42ep4a (LOC108256079,LOC108432235,LOC103033379)


Basic Information

Item Value
gene id cdc42ep4a
gene name LOC108256079,LOC108432235,LOC103033379
gene type misc
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047607.1
NCBI id CM018553.1
chromosome length 26458119
location 11280080 ~ 11388020 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>TU247909
GTAATTCTTGGTGGAAGGTGCTATGGTCATTTGTCACCTGTTTTCTGTCTGTGCATTAGCGAAGACGGGCATATCTATTTTAGCTCCTCCAAGGTGAGGGAAGCTGCCAGGGAGCTGCTCGTCTCTAGTGTCAGCAATCTAATGTAGGTCAGAGGCAATTCACTCAAATACCCccctccacacagacacacacacacacacacacacacacacacaaacactcatgtAATGTTACAGTCTTTTCAATAAAACACAGCATGCTTATTCTACCTGCTTTATTCATTCActcttttatatattaattgtcCTTCAGTGCCAGTTTGGCTCTGTGTTCCTCATTGTTCTCAGTCTACAGTTTTATTTAAGTTTAAGATGTtttcataaacaccatcacattGCTCTTCTTCCACTTCCTACCTGTGAACTTTAATTAGGATTTGTTTGCACTGTTTTATATCCATGTATTCTGTAGTGCCTTGTTGTTGTTATACCTACCATGCTCTTGTTTGTCTCTCAATTTACTGTGGATATCTTGATCTTTGGTTACACGATCGTACTAAATAATTTGTCTTCTGGGGTGGAGAGAGATTTTGAGCTTTTGATTAGATCCATCCTTTGATTGGATTGGTGTGAGTCCAGACTAATTGCAGTAAGAGCCTAATGGTGCTGTTATCTGAGACGCAGTGAAACCTCAATGGCTACAAAGCTTTGTTTCAGCTGGTGAAGTTATGTCTCAGAGCTTCTCTAGTGGTGGTGTAAATCATTAACAGGGTACTGCAAGGTCATGGGTAAACttggagagagcgagagagcaacCAGGAACCACCTGGTCCCATTTAACCACGGTTGATTAGGCGGTACATTGTGCCCTTGCTAAAGCCACAgtctcagaaataaagataccaaactgtacttttccgtGTCGCTCAGGTGGTATGATCGGGGGCACgcattttgtacctttagtacgTATGTACTGCTTTAAAGGTGTATCAGTGGTTGTTAAGATACAAAAATGTGCcttaaattatttgtaaaggtGCATAATATTCACAGTTCCATATggaagatacatattaaaggcgACAAGGATAACCACAGTTTGgttcctttatttctgagagtttaGTGCgcaataatttttttactaTGTTGTCAAAGTGGAGTGGCCTAAATGGTTTCATCACCATGTATGTAGCAGATTGCTTAACAAGTATTACAGCCCCGTTGGTGTCACTGACATGGATGTCAGAGCACTGAACTGAACTGTAAGCAGGCCACCATGTGTTTCCCTTTACCAGTTTTCTAAGGAAGCCACCTATCTGTGTGTAAGTAATCACACAtctttaatttatgtttaacttAGATTTCACATTATAAAAGTGGCACTGTATATCTTGTATAACTGTATGCAGAGATCATAAAAGTAATTGTGGTTGGGTTGTTCTCCTTTAATCTCCATCGTTTAATGTTCATGCCCCCTGAGAAGTTACCAGTAATCAGCAGGTGAACTTTCCACAAATCAGCCTCGAAACCCCCTTTTTCAGCATGAGAGGTTACTGTAAGTCTGTTATTTCTTGCTGTGCTCAGCACTGGATGCTACACCAACAGCccttattaataaatatgtttacatgtacaaaataatCAGATCAGATAAGTAAAGTCaattttggcaataattcacCCAACACTAAAGATTCACTAGAGTAATCTGAAACTCTGGGATTATATGAGTCAGTCGAAAATTGGATTCCTTTCTAGACACATGACTTACGCACCTCTGCTGTTGCCTTACAACCTAAAAATAAACTGACGTCAGAAGAAGGCTGACATAAAATTcctgctgtttgtttatttcaacaTGGAGTCACTTTGCTTGGTGATCATTATTTAGGAGTTTtatgtttggaaattgcacagCTGTTAATTCTCTCTGTAGTCTTTAGTGCTAACGGTGCATCTATTCTCTATGCTCATATGCTCTGAATAACTTGGTCACTTTGCTAAAATCTAGGTGTGGCTTACTTGAAATGCATTAACAGCTTTAATCTGATCCATCATATGATGTTCACACGAATGCTTGAGTAAAATAGTAACTACTGAAATCAGATACAGCCTATATTCTTAGCGTGCACTCAACGCCTTCAGCTTCTTTAACACATTAGTCCAACTTCTTTATGGTTAATGAGGTTAATGAGGCAAACCTACTAGAATAAGGTGTCCTTCCACTGGTTTTGGGATTCTTCCACTACACAAACATTGTACCGGTCCTGGATGACTTTGGAGTAGTAGTTTAATGGCATGTTTATTAGGTGATTTATGGAGTTTGTGCCTGAGAACACTCTCTGTAAGCAAAAAGAGGATAGACTGTGCataacatgcaaatattttaCTTCAAATTGCAGCATAAACGGGAATAAAGTTTTCGTTGACTTCTTCGTCTTGTCAACAGCGGCACTTTCACTTGAATTATGCCTTAAGCACTGAATCACAAGGTTTATTGTATGTGATGTATTAGTTAGGCTGAAGTAGCATTCTTGCTGTGTATGTCCAGACTTTGCCAGTCCTTTGATCCACAGGCTCTTCAAACTTTATATAACCCTGCTACCCTGAGAGCAAGTTCAGCCATCCTCATCCAATTGGTGTATCACATTTCAGTCAGTGAATGACTCGTGTAATGTTTTCAGACAttctttgttcatgtttattgtGTCAACCTGAGGTATCACAGCAAATGTATTGtcgtcttttttttccacaggttctatgctgttgctgctgtgtaTGGATTATTAACAGTGTATGGctttatatgtaaacacagCTTctcatttaattataattatgaatattaatcaTTTAGAACGTTTCAGaagcttctgtttatttttaaatgagtgctACAACCTTGTGGGTTTGTGGTTCTGCAATAAGCTATCACTCCTCTCAGTTGTGTCGACACCATGAGGGTGTTCACACCGGGTGTGAAATTGAAGGTGTCCTCAGTCACTCAGGTCTGTGACCCCATTCAAACTTGtttcacacacatgctgtgTTTCACATGTTGCTTGGACTTGTCCTCAGAAATCAATGTACACACTTCTAGCAGCACATATAGAAGGTGGCAAAATCCAGTAAAAGTGTCCTCCAGTATTATTGCCCTTCCCCCGCAGCATgcagaagcagtgtgtgtttctcatctggagaaatagattaaaatagattaaaattaGGTCTACTGTCTTCTCATTTAACTGCCTATTACCATGGTGAAGCTCAGCAAGATCAGATTAACACTTTTCTGTTTATAATGCAATATAAATATGggttatttaaacaaaaatacagcttgcTTACATTTTACAGTACTAGGTTGATTCTCTCATAGTGCAGCCACTCTGCTAATGtgttttactatttaaaaaaagcaaggtAGAATTACTCAACATTGCTGCATATAAATTATTACACTAAaaacaatggatataaaaaatattaaatattctagCTAGATGCAGAATATGTGATGCTCTGGCACAAAGATGCTGAGTAAGCAAAAAAGAAGTAAGTTCAGTTTCTGTGGTTGGCCTAATGTAAGCAGatgtttaattctgattggtacTACAACTAATGTTACAAATATGTGCAGCAGTTTGGGAAAACACCTCAGACGTCACTGGCTGAATTCTGtaaaatgaccaaaaatgtaaaaaaaaaaaaaaaaaaagtttttttttatgtagattaGTTTTGTAGATAATTTTGCCTTGGCTGTGTACCTGCAAAGATTATGTCTGGTATGGAGctagtttaacaaacacagctgtaAGACCAGTtggcctaaagatgtctaaaaccttgctagcacAGTGTGATTCACTCACAATTTCATTTCATGCCAGAGTGTAATGGACATAAgactaatcagttcagtttgtaatcaggtACTGGCTATCACAATTGGTCCTGCGCCATCACATcgtcatcaaaacagagaagagtgctTAGACACTCTGTAAAATTACAGCaaacaaagttaaaatgtttaaatgacctaacATAAAGACATTAATAGCAAGAAATTTAGTCAACAGAACTGATTGAATTAAAGGCAAAATTAACTTTACCTCAGGTGGTGAGACTCATTTCCCATTggaagtgagaactcatttcctaTTGTAAACCTAGAATTCTTTAACATGtgacaataaaaaatacatattttccCCAGTACTTTTCAAACTATATATAGTGGAAAATATAAGCATGTAAAGAGTTTTCCCTGGCCACCACACATGTAGTCCCACACAACTCAAATTGGCCAGAAAGGCAGGGGGGAAaattagaaatttttttttgtggtcaaAGGTAAATTCAACAACTAAGCTATAGCTGACAGTAAGAAGACTATGTAATATTGCTTAgattatgtatttgtttgttaaatgaaaatgtttaatttgaaaaaaatttcagaCCCCACTTTTGACAACAATGACTGAAAGCATTGAGTAGATTGTGATTGCTGTTGGTCATATTTGTGAGACATCTCTATGATGTACAGAGTAGTTACCCTGGATCTGC
>XM_026916580.2
ATGGGTACCAATGCCATGAGCCACGCTGTGGATAGAGTCTCCATTGTCCTTCAGCGCATGCGCACTGGAGACGTGCTCAGAGAAAGGAACGGCTGAGCTGCGCGAGCTTGTAGATGAGTAGTGCGTTTAGTCGCTGAACGATAGGAAGGATGCGTTTCTCCGCTTTATGTCGAGTTCAGTTCTGTTGTCGAAACTGAGTGGTGGTGTGTATTTACGGGGGTTAATTCACAAATTCACCAAACAAAGTAGCAACTTGTGAGGCGAATGTGAATAGTGAAGGGAGGAAACAGTGAAGCTAGTCACCTGGGGATGAAAGTACAAACCGTCGGTTGCGCGCGAGACTGTTGATAAAGGTTCAACCTGTGATCTCTGGGGAATGGCGCAGCCAGACGTTTCTGTCTGACTCATGCAGGGGCAGTTACACTGCATTCTGGAGTCTGTAATGGTATTCAACCCGGTCTTGCAGATAAGATGTCTTGGAACTGCTCCACCACTGACTCTTCATTACACTCTGAGTGTAATGAAACAGCAGTAGTGGAATGCACTTAGCTTAATTATGgtTCCACAAACTCACTGATACTCACTGTGTCTCACTGGAAACTGCATGTGCCTTCAACTCTAACCTAATCATACAAGATATAAATCCAGAGGAGTTAATTTGTCTTTTAGTTGGGAGAATAAATTTGCAAAGATGCCCATCTTGAAGCAACTAGTGTCAAGCTCATCTCAGACCAAGCGACGTTCTCGCATGGACCTTACTACGGAAATGATTAGTGCTCCGTTGGGAGATTTTCGTCACACCATGCATGTGGGCAGGGGTGGTGACGCTTTTGGAGACACTTCCTTTCTCTGCAGCCGCTCTGGCGAGCCCCCACAAGATACTAGTTCTAATCCCCGCTCTCCCAAGCTGGGCCTACTGTCCAGACCCTTCAGAATGAGCAAGCGCTCCCATTCCGTCACTCGAGTGGACCAGCGGGACAACACACAATTACCCCCAAGTGGCTCACCAACGTATGTGAAAAATGCCCTGTCACTGCCTTTTCTGAATGATGAGGATGGGAATACTGAAGGCGCTAGGTTGCTCAAGAGCCTAGCCTCCAGCCCCATGAAGCAGCAGGCCTCCAATGGGGCAGCCGCTCATGGCCTAGATCTGGAGCTCCACGAGAGGTCCTTCGGGGAGCTGACCGACTTGCGACCATCTCCATCTTATAATGGGGGAGGCATGAAGCATGCCGAGTCAGTTATGTCCTTTCATGTGGACCTGGGGCCTTCTATGCTAGGAGATATTCTAGGAGTCATGGAGAAGGAAGAAGATGACCTGGGCTTTGAGGAGGGCAAAAACAGCGAGGGACGGGCTTCCCCTCTTCTCAGCAACCAAGAAGtagcagaggaggaggaggaggaggaggaggagggggaatGAGAGAAGATGAGGTGAAAGTAGAGGAGgcggaagaggaggaggaggagcagcagcaggagatGGATCTGGAGGTGGAACATAAGGCTACTCTTCATGCCCCCAGTTCAGTAGACCTGGAAATTAAAAGTGAGGTGATCAGCACTCCTGAGCCTCAACACAAACACCTTCAGCACTCTGACAGCTACTCTGTCTCCAGTTCTGGCTCCCAAGCCATGGAGGACAAACAACTCTGCCAGCCTTATCAAGGAGACATGGACAGCACCACCTACAGCTACCACCCTGGGGAGGAAGGAGCCTTCTCTTCCTTCTTGGAGGACGAGGATGATGAGATCCGTGTGTGAGACTCTAAGCCTTGTGGAATCTGTATGGGGATAGAGACATGTAAGCAACTGTGACACTGTGTTAATGAAACTGAAGGTCTATAACTGCTCCTCGACCCTGTGAGGGAAGTGAGCAAAACACATCTAATGGCCCAGCAGAGGACCTCATAGCACCTGCCTGGGTCTAGCAGCTGCCAGTTTTTCCACTGGACATGTGAGTGATGATGAGGAGACTtctgaagaaggaaaaagaatgTCTTTAATGTCATAACCTCATCACTTGCCTTTGCATTCTGACTCTAACATTGGGTATTTGTGTGTAAGGCTTTTGGTCATGTGTGCTACAGGTGCTGGCTAATGGCATCTACTGACAGGTATATTTTCACTACACAATAAGCACACTCTTTGCTGAGGGGATAAAGGAGCATGCAGCTAATGCTGGTATGCCCACGGGACATGTTATGTATCTGCCTGGCCTGTGGATGAGTGTAAAAATTTTGACAGTAATTACAGCATTGCAGTGCGTGTGAAGGATTTTGGTTACGCATCCTGTTAGACACTGTCATTAGGGCAGCTGACAGAGAAGGATGGGAAATCATTCTGTAATATAGATAACAAACCAGAAACTGAAAGGGGGTGCAGTGCCAGATGTTTTGTGTTCCGTTTTCCCTCCACTAACTGTCCATAATTCTGTACTAGCAGTGGTGACAGCTGGGAAGCTTCATGTCAGGCGGGATTCATGTTTGTAGAGGATTTTGTACACTCGTTGCCTGTGTGGTGTCTTTATCTCACCACTTCCTTCCTCATCATGTGACAGTAACTGTTTAGCTCTGCAGCTAGCTGGTTAAGATGGTGCAGAAATGTTGCTGTATCTCTGTATTAAGTTATGCTGCCAGGAACAGTCTGTGAGATTGGGTTGAAATTGGGTTTTCCTACCTAGCATTATTAAAGCAAATAAGAACACTGCACTAATTAAACTAAACTCGGGTTTGGTATACAAGGCAGTGTATTTCAGCACCATTGTATAGTGTTAAAATCACCTGGGTGAGGGATAACCTGTACACTAACGTCTACTtagtttcttttatttgttcacAGAAGTCATGTTGTAAAATGTGAATATGTGAGGCCTTTACTGCTGCCCAGTCTGTGCTCGTGTGCTTGCCTATAATAGCTTACTCATTTCTGTCTTCTGTAGGCTACAGGGACTAGCTGTTCTACAAAAGTGCTGAGTTGTAAGAAATGCTTGCAGAGCATTTAGCAGCAGGGTTGTCTTCAGCCTTAAGTAGAAATGACAAAAGTGCCAAATTTAATCTGCCATGTAATCCTAAGTAAAACTAGCAATTTGTATATCATCAAACAAGGGATTTTACAGTCTAGGTCCCTAAGTGACTTTATTCAAATAAGGGGCTAAAACCTCATACTTAATTCACTGAAATGCTTAGCTTGAATGTATTTGCTTAAACCACAGAATAGCAAAATCACAGAAGTTCCAagttatttgcctttttttttttttttttttttttggaaaatctgTTTTGAATATAAGAATGTAAATATGGGGAAATAGTTGCAGATTTGCTGTGCCAGCTGAATTTTAAATTCAGAGGTCTGTTAGAATCCAGTCTTCTGAAAGATAACACtgtttattattgcattttgcTAGTCTTTGTTACTTTGTCCTCTTATGCATACATTTCTTGCTTGGATGGCCTTGTTTTGAAAATGCAACATAACAACtatatttttcaataaaagGATGTTATCACCAAG
>XM_034309898.1
GCAAGAGGATATGTCTCCTACAAAGCCCCATGGCAAAGGCGCGAATTACTCTCATGGCAGCTTTTGGAAAATGAATACACAAAATGAGTTCAAAACTAAGGGTATTTGGTCCTCAGACAACATGATGGACATCAACTTGAACTGGCCTGGCAGGATATTGCATTTCAATTGAAAGCGGAGTTAAATGGGTCATCAAGGAAGAATGCAGCACAGCTCTTTTCTTTgtctcacacatttttttcaggttgGTCGCTGTGAGTAAGAACCTTGGATGAATAAAGGAGCATGCTATAAGAATgtTCCACAAACTCACTGATACTCACTGTGTCTCACTGGAAACTGCATGTGCCTTCAACTCTAACCTAATCATACAAGATATAAATCCAGAGGAGTTAATTTGTCTTTTAGTTGGGAGAATAAATTTGCAAAGATGCCCATCTTGAAGCAACTAGTGTCAAGCTCATCTCAGACCAAGCGACGTTCTCGCATGGACCTTACTACGGAAATGATTAGTGCTCCGTTGGGAGATTTTCGTCACACCATGCATGTGGGCAGGGGTGGTGACGCTTTTGGAGACACTTCCTTTCTCTGCAGCCGCTCTGGCGAGCCCCCACAAGATACTAGTTCTAATCCCCGCTCTCCCAAGCTGGGCCTACTGTCCAGACCCTTCAGAATGAGCAAGCGCTCCCATTCCGTCACTCGAGTGGACCAGCGGGACAACACACAATTACCCCCAAGTGGCTCACCAACGTATGTGAAAAATGCCCTGTCACTGCCTTTTCTGAATGATGAGGATGGGAATACTGAAGGCGCTAGGTTGCTCAAGAGCCTAGCCTCCAGCCCCATGAAGCAGCAGGCCTCCAATGGGGCAGCCGCTCATGGCCTAGATCTGGAGCTCCACGAGAGGTCCTTCGGGGAGCTGACCGACTTGCGACCATCTCCATCTTATAATGGGGGAGGCATGAAGCATGCCGAGTCAGTTATGTCCTTTCATGTGGACCTGGGGCCTTCTATGCTAGGAGATATTCTAGGAGTCATGGAGAAGGAAGAAGATGACCTGGGCTTTGAGGAGGGCAAAAACAGCGAGGGACGGGCTTCCCCTCTTCTCAGCAACCAAGAAGtagcagaggaggaggaggaggaggaggaggagggggaatGAGAGAAGATGAGGTGAAAGTAGAGGAGgcggaagaggaggaggaggagcagcagcaggagatGGATCTGGAGGTGGAACATAAGGCTACTCTTCATGCCCCCAGTTCAGTAGACCTGGAAATTAAAAGTGAGGTGATCAGCACTCCTGAGCCTCAACACAAACACCTTCAGCACTCTGACAGCTACTCTGTCTCCAGTTCTGGCTCCCAAGCCATGGAGGACAAACAACTCTGCCAGCCTTATCAAGGAGACATGGACAGCACCACCTACAGCTACCACCCTGGGGAGGAAGGAGCCTTCTCTTCCTTCTTGGAGGACGAGGATGATGAGATCCGTGTGTGAGACTCTAAGCCTTGTGGAATCTGTATGGGGATAGAGACATGTAAGCAACTGTGACACTGTGTTAATGAAACTGAAGGTCTATAACTGCTCCTCGACCCTGTGAGGGAAGTGAGCAAAACACATCTAATGGCCCAGCAGAGGACCTCATAGCACCTGCCTGGGTCTAGCAGCTGCCAGTTTTTCCACTGGACATGTGAGTGATGATGAGGAGACTtctgaagaaggaaaaagaatgTCTTTAATGTCATAACCTCATCACTTGCCTTTGCATTCTGACTCTAACATTGGGTATTTGTGTGTAAGGCTTTTGGTCATGTGTGCTACAGGTGCTGGCTAATGGCATCTACTGACAGGTATATTTTCACTACACAATAAGCACACTCTTTGCTGAGGGGATAAAGGAGCATGCAGCTAATGCTGGTATGCCCACGGGACATGTTATGTATCTGCCTGGCCTGTGGATGAGTGTAAAAATTTTGACAGTAATTACAGCATTGCAGTGCGTGTGAAGGATTTTGGTTACGCATCCTGTTAGACACTGTCATTAGGGCAGCTGACAGAGAAGGATGGGAAATCATTCTGTAATATAGATAACAAACCAGAAACTGAAAGGGGGTGCAGTGCCAGATGTTTTGTGTTCCGTTTTCCCTCCACTAACTGTCCATAATTCTGTACTAGCAGTGGTGACAGCTGGGAAGCTTCATGTCAGGCGGGATTCATGTTTGTAGAGGATTTTGTACACTCGTTGCCTGTGTGGTGTCTTTATCTCACCACTTCCTTCCTCATCATGTGACAGTAACTGTTTAGCTCTGCAGCTAGCTGGTTAAGATGGTGCAGAAATGTTGCTGTATCTCTGTATTAAGTTATGCTGCCAGGAACAGTCTGTGAGATTGGGTTGAAATTGGGTTTTCCTACCTAGCATTATTAAAGCAAATAAGAACACTGCACTAATTAAACTAAACTCGGGTTTGGTATACAAGGCAGTGTATTTCAGCACCATTGTATAGTGTTAAAATCACCTGGGTGAGGGATAACCTGTACACTAACGTCTACTtagtttcttttatttgttcacAGAAGTCATGTTGTAAAATGTGAATATGTGAGGCCTTTACTGCTGCCCAGTCTGTGCTCGTGTGCTTGCCTATAATAGCTTACTCATTTCTGTCTTCTGTAGGCTACAGGGACTAGCTGTTCTACAAAAGTGCTGAGTTGTAAGAAATGCTTGCAGAGCATTTAGCAGCAGGGTTGTCTTCAGCCTTAAGTAGAAATGACAAAAGTGCCAAATTTAATCTGCCATGTAATCCTAAGTAAAACTAGCAATTTGTATATCATCAAACAAGGGATTTTACAGTCTAGGTCCCTAAGTGACTTTATTCAAATAAGGGGCTAAAACCTCATACTTAATTCACTGAAATGCTTAGCTTGAATGTATTTGCTTAAACCACAGAATAGCAAAATCACAGAAGTTCCAagttatttgcctttttttttttttttttttttttggaaaatctgTTTTGAATATAAGAATGTAAATATGGGGAAATAGTTGCAGATTTGCTGTGCCAGCTGAATTTTAAATTCAGAGGTCTGTTAGAATCCAGTCTTCTGAAAGATAACACtgtttattattgcattttgcTAGTCTTTGTTACTTTGTCCTCTTATGCATACATTTCTTGCTTGGATGGCCTTGTTTTGAAAATGCAACATAACAACtatatttttcaataaaagGATGTTATCACCAAG
>XM_034309899.1
GCAAGAGGATATGTCTCCTACAAAGCCCCATGGCAAAGGCGCGAATTACTCTCATGGCAGCTTTTGGAAAATGAATACACAAAATGAGTTCAAAACTAAGGGTATTTGGTCCTCAGACAACATGATGGACATCAACTTGAACTGGCCTGGCAGGATATTGCATTTCAATTGAAAGCGGAGTTAAATGGGTCATCAAGGAAGAATGCAGCACAGCTCTTTTCTTTgtctcacacatttttttcaggtTCCACAAACTCACTGATACTCACTGTGTCTCACTGGAAACTGCATGTGCCTTCAACTCTAACCTAATCATACAAGATATAAATCCAGAGGAGTTAATTTGTCTTTTAGTTGGGAGAATAAATTTGCAAAGATGCCCATCTTGAAGCAACTAGTGTCAAGCTCATCTCAGACCAAGCGACGTTCTCGCATGGACCTTACTACGGAAATGATTAGTGCTCCGTTGGGAGATTTTCGTCACACCATGCATGTGGGCAGGGGTGGTGACGCTTTTGGAGACACTTCCTTTCTCTGCAGCCGCTCTGGCGAGCCCCCACAAGATACTAGTTCTAATCCCCGCTCTCCCAAGCTGGGCCTACTGTCCAGACCCTTCAGAATGAGCAAGCGCTCCCATTCCGTCACTCGAGTGGACCAGCGGGACAACACACAATTACCCCCAAGTGGCTCACCAACGTATGTGAAAAATGCCCTGTCACTGCCTTTTCTGAATGATGAGGATGGGAATACTGAAGGCGCTAGGTTGCTCAAGAGCCTAGCCTCCAGCCCCATGAAGCAGCAGGCCTCCAATGGGGCAGCCGCTCATGGCCTAGATCTGGAGCTCCACGAGAGGTCCTTCGGGGAGCTGACCGACTTGCGACCATCTCCATCTTATAATGGGGGAGGCATGAAGCATGCCGAGTCAGTTATGTCCTTTCATGTGGACCTGGGGCCTTCTATGCTAGGAGATATTCTAGGAGTCATGGAGAAGGAAGAAGATGACCTGGGCTTTGAGGAGGGCAAAAACAGCGAGGGACGGGCTTCCCCTCTTCTCAGCAACCAAGAAGtagcagaggaggaggaggaggaggaggaggagggggaatGAGAGAAGATGAGGTGAAAGTAGAGGAGgcggaagaggaggaggaggagcagcagcaggagatGGATCTGGAGGTGGAACATAAGGCTACTCTTCATGCCCCCAGTTCAGTAGACCTGGAAATTAAAAGTGAGGTGATCAGCACTCCTGAGCCTCAACACAAACACCTTCAGCACTCTGACAGCTACTCTGTCTCCAGTTCTGGCTCCCAAGCCATGGAGGACAAACAACTCTGCCAGCCTTATCAAGGAGACATGGACAGCACCACCTACAGCTACCACCCTGGGGAGGAAGGAGCCTTCTCTTCCTTCTTGGAGGACGAGGATGATGAGATCCGTGTGTGAGACTCTAAGCCTTGTGGAATCTGTATGGGGATAGAGACATGTAAGCAACTGTGACACTGTGTTAATGAAACTGAAGGTCTATAACTGCTCCTCGACCCTGTGAGGGAAGTGAGCAAAACACATCTAATGGCCCAGCAGAGGACCTCATAGCACCTGCCTGGGTCTAGCAGCTGCCAGTTTTTCCACTGGACATGTGAGTGATGATGAGGAGACTtctgaagaaggaaaaagaatgTCTTTAATGTCATAACCTCATCACTTGCCTTTGCATTCTGACTCTAACATTGGGTATTTGTGTGTAAGGCTTTTGGTCATGTGTGCTACAGGTGCTGGCTAATGGCATCTACTGACAGGTATATTTTCACTACACAATAAGCACACTCTTTGCTGAGGGGATAAAGGAGCATGCAGCTAATGCTGGTATGCCCACGGGACATGTTATGTATCTGCCTGGCCTGTGGATGAGTGTAAAAATTTTGACAGTAATTACAGCATTGCAGTGCGTGTGAAGGATTTTGGTTACGCATCCTGTTAGACACTGTCATTAGGGCAGCTGACAGAGAAGGATGGGAAATCATTCTGTAATATAGATAACAAACCAGAAACTGAAAGGGGGTGCAGTGCCAGATGTTTTGTGTTCCGTTTTCCCTCCACTAACTGTCCATAATTCTGTACTAGCAGTGGTGACAGCTGGGAAGCTTCATGTCAGGCGGGATTCATGTTTGTAGAGGATTTTGTACACTCGTTGCCTGTGTGGTGTCTTTATCTCACCACTTCCTTCCTCATCATGTGACAGTAACTGTTTAGCTCTGCAGCTAGCTGGTTAAGATGGTGCAGAAATGTTGCTGTATCTCTGTATTAAGTTATGCTGCCAGGAACAGTCTGTGAGATTGGGTTGAAATTGGGTTTTCCTACCTAGCATTATTAAAGCAAATAAGAACACTGCACTAATTAAACTAAACTCGGGTTTGGTATACAAGGCAGTGTATTTCAGCACCATTGTATAGTGTTAAAATCACCTGGGTGAGGGATAACCTGTACACTAACGTCTACTtagtttcttttatttgttcacAGAAGTCATGTTGTAAAATGTGAATATGTGAGGCCTTTACTGCTGCCCAGTCTGTGCTCGTGTGCTTGCCTATAATAGCTTACTCATTTCTGTCTTCTGTAGGCTACAGGGACTAGCTGTTCTACAAAAGTGCTGAGTTGTAAGAAATGCTTGCAGAGCATTTAGCAGCAGGGTTGTCTTCAGCCTTAAGTAGAAATGACAAAAGTGCCAAATTTAATCTGCCATGTAATCCTAAGTAAAACTAGCAATTTGTATATCATCAAACAAGGGATTTTACAGTCTAGGTCCCTAAGTGACTTTATTCAAATAAGGGGCTAAAACCTCATACTTAATTCACTGAAATGCTTAGCTTGAATGTATTTGCTTAAACCACAGAATAGCAAAATCACAGAAGTTCCAagttatttgcctttttttttttttttttttttttggaaaatctgTTTTGAATATAAGAATGTAAATATGGGGAAATAGTTGCAGATTTGCTGTGCCAGCTGAATTTTAAATTCAGAGGTCTGTTAGAATCCAGTCTTCTGAAAGATAACACtgtttattattgcattttgcTAGTCTTTGTTACTTTGTCCTCTTATGCATACATTTCTTGCTTGGATGGCCTTGTTTTGAAAATGCAACATAACAACtatatttttcaataaaagGATGTTATCACCAAG
>XM_034309900.1
TATGTAGCAGATTGCTTAACAAGTATTACAGCCCCGTTGGTGTCACTGACATGGATGTCAGAGCACTGAACTGAACTGTAAGCAGGCCACCATGTGTTTCCCTTTACCAGTTTTCTAAGGAAGCCACCTATCTGTGTgtTCCACAAACTCACTGATACTCACTGTGTCTCACTGGAAACTGCATGTGCCTTCAACTCTAACCTAATCATACAAGATATAAATCCAGAGGAGTTAATTTGTCTTTTAGTTGGGAGAATAAATTTGCAAAGATGCCCATCTTGAAGCAACTAGTGTCAAGCTCATCTCAGACCAAGCGACGTTCTCGCATGGACCTTACTACGGAAATGATTAGTGCTCCGTTGGGAGATTTTCGTCACACCATGCATGTGGGCAGGGGTGGTGACGCTTTTGGAGACACTTCCTTTCTCTGCAGCCGCTCTGGCGAGCCCCCACAAGATACTAGTTCTAATCCCCGCTCTCCCAAGCTGGGCCTACTGTCCAGACCCTTCAGAATGAGCAAGCGCTCCCATTCCGTCACTCGAGTGGACCAGCGGGACAACACACAATTACCCCCAAGTGGCTCACCAACGTATGTGAAAAATGCCCTGTCACTGCCTTTTCTGAATGATGAGGATGGGAATACTGAAGGCGCTAGGTTGCTCAAGAGCCTAGCCTCCAGCCCCATGAAGCAGCAGGCCTCCAATGGGGCAGCCGCTCATGGCCTAGATCTGGAGCTCCACGAGAGGTCCTTCGGGGAGCTGACCGACTTGCGACCATCTCCATCTTATAATGGGGGAGGCATGAAGCATGCCGAGTCAGTTATGTCCTTTCATGTGGACCTGGGGCCTTCTATGCTAGGAGATATTCTAGGAGTCATGGAGAAGGAAGAAGATGACCTGGGCTTTGAGGAGGGCAAAAACAGCGAGGGACGGGCTTCCCCTCTTCTCAGCAACCAAGAAGtagcagaggaggaggaggaggaggaggaggagggggaatGAGAGAAGATGAGGTGAAAGTAGAGGAGgcggaagaggaggaggaggagcagcagcaggagatGGATCTGGAGGTGGAACATAAGGCTACTCTTCATGCCCCCAGTTCAGTAGACCTGGAAATTAAAAGTGAGGTGATCAGCACTCCTGAGCCTCAACACAAACACCTTCAGCACTCTGACAGCTACTCTGTCTCCAGTTCTGGCTCCCAAGCCATGGAGGACAAACAACTCTGCCAGCCTTATCAAGGAGACATGGACAGCACCACCTACAGCTACCACCCTGGGGAGGAAGGAGCCTTCTCTTCCTTCTTGGAGGACGAGGATGATGAGATCCGTGTGTGAGACTCTAAGCCTTGTGGAATCTGTATGGGGATAGAGACATGTAAGCAACTGTGACACTGTGTTAATGAAACTGAAGGTCTATAACTGCTCCTCGACCCTGTGAGGGAAGTGAGCAAAACACATCTAATGGCCCAGCAGAGGACCTCATAGCACCTGCCTGGGTCTAGCAGCTGCCAGTTTTTCCACTGGACATGTGAGTGATGATGAGGAGACTtctgaagaaggaaaaagaatgTCTTTAATGTCATAACCTCATCACTTGCCTTTGCATTCTGACTCTAACATTGGGTATTTGTGTGTAAGGCTTTTGGTCATGTGTGCTACAGGTGCTGGCTAATGGCATCTACTGACAGGTATATTTTCACTACACAATAAGCACACTCTTTGCTGAGGGGATAAAGGAGCATGCAGCTAATGCTGGTATGCCCACGGGACATGTTATGTATCTGCCTGGCCTGTGGATGAGTGTAAAAATTTTGACAGTAATTACAGCATTGCAGTGCGTGTGAAGGATTTTGGTTACGCATCCTGTTAGACACTGTCATTAGGGCAGCTGACAGAGAAGGATGGGAAATCATTCTGTAATATAGATAACAAACCAGAAACTGAAAGGGGGTGCAGTGCCAGATGTTTTGTGTTCCGTTTTCCCTCCACTAACTGTCCATAATTCTGTACTAGCAGTGGTGACAGCTGGGAAGCTTCATGTCAGGCGGGATTCATGTTTGTAGAGGATTTTGTACACTCGTTGCCTGTGTGGTGTCTTTATCTCACCACTTCCTTCCTCATCATGTGACAGTAACTGTTTAGCTCTGCAGCTAGCTGGTTAAGATGGTGCAGAAATGTTGCTGTATCTCTGTATTAAGTTATGCTGCCAGGAACAGTCTGTGAGATTGGGTTGAAATTGGGTTTTCCTACCTAGCATTATTAAAGCAAATAAGAACACTGCACTAATTAAACTAAACTCGGGTTTGGTATACAAGGCAGTGTATTTCAGCACCATTGTATAGTGTTAAAATCACCTGGGTGAGGGATAACCTGTACACTAACGTCTACTtagtttcttttatttgttcacAGAAGTCATGTTGTAAAATGTGAATATGTGAGGCCTTTACTGCTGCCCAGTCTGTGCTCGTGTGCTTGCCTATAATAGCTTACTCATTTCTGTCTTCTGTAGGCTACAGGGACTAGCTGTTCTACAAAAGTGCTGAGTTGTAAGAAATGCTTGCAGAGCATTTAGCAGCAGGGTTGTCTTCAGCCTTAAGTAGAAATGACAAAAGTGCCAAATTTAATCTGCCATGTAATCCTAAGTAAAACTAGCAATTTGTATATCATCAAACAAGGGATTTTACAGTCTAGGTCCCTAAGTGACTTTATTCAAATAAGGGGCTAAAACCTCATACTTAATTCACTGAAATGCTTAGCTTGAATGTATTTGCTTAAACCACAGAATAGCAAAATCACAGAAGTTCCAagttatttgcctttttttttttttttttttttttggaaaatctgTTTTGAATATAAGAATGTAAATATGGGGAAATAGTTGCAGATTTGCTGTGCCAGCTGAATTTTAAATTCAGAGGTCTGTTAGAATCCAGTCTTCTGAAAGATAACACtgtttattattgcattttgcTAGTCTTTGTTACTTTGTCCTCTTATGCATACATTTCTTGCTTGGATGGCCTTGTTTTGAAAATGCAACATAACAACtatatttttcaataaaagGATGTTATCACCAAG
>XM_034309901.1
GGTACCAATGCCATGAGCCACGCTGTGGATAGAGTCTCCATTGTCCTTCAGCGCATGCGCACTGGAGACGTGCTCAGAGAAAGGAACGGCTGAGCTGCGCGAGCTTGTAGATGAGTAGTGCGTTTAGTCGCTGAACGATAGGAAGGATGCGTTTCTCCGCTTTATGTCGAGTTCAGTTCTGTTGTCGAAACTGAGTGGTGGTGTGTATTTACGGGGGTTAATTCACAAATTCACCAAACAAAGTAGCAACTTGTGAGGCGAATGTGAATAGTGAAGGGAGGAAACAGTGAAGCTAGTCACCTGGGGATGAAAGTACAAACCGTCGGTTGCGCGCGAGACTGTTGATAAAGgtTCCACAAACTCACTGATACTCACTGTGTCTCACTGGAAACTGCATGTGCCTTCAACTCTAACCTAATCATACAAGATATAAATCCAGAGGAGTTAATTTGTCTTTTAGTTGGGAGAATAAATTTGCAAAGATGCCCATCTTGAAGCAACTAGTGTCAAGCTCATCTCAGACCAAGCGACGTTCTCGCATGGACCTTACTACGGAAATGATTAGTGCTCCGTTGGGAGATTTTCGTCACACCATGCATGTGGGCAGGGGTGGTGACGCTTTTGGAGACACTTCCTTTCTCTGCAGCCGCTCTGGCGAGCCCCCACAAGATACTAGTTCTAATCCCCGCTCTCCCAAGCTGGGCCTACTGTCCAGACCCTTCAGAATGAGCAAGCGCTCCCATTCCGTCACTCGAGTGGACCAGCGGGACAACACACAATTACCCCCAAGTGGCTCACCAACGTATGTGAAAAATGCCCTGTCACTGCCTTTTCTGAATGATGAGGATGGGAATACTGAAGGCGCTAGGTTGCTCAAGAGCCTAGCCTCCAGCCCCATGAAGCAGCAGGCCTCCAATGGGGCAGCCGCTCATGGCCTAGATCTGGAGCTCCACGAGAGGTCCTTCGGGGAGCTGACCGACTTGCGACCATCTCCATCTTATAATGGGGGAGGCATGAAGCATGCCGAGTCAGTTATGTCCTTTCATGTGGACCTGGGGCCTTCTATGCTAGGAGATATTCTAGGAGTCATGGAGAAGGAAGAAGATGACCTGGGCTTTGAGGAGGGCAAAAACAGCGAGGGACGGGCTTCCCCTCTTCTCAgaggagggggaatGAGAGAAGATGAGGTGAAAGTAGAGGAGgcggaagaggaggaggaggagcagcagcaggagatGGATCTGGAGGTGGAACATAAGGCTACTCTTCATGCCCCCAGTTCAGTAGACCTGGAAATTAAAAGTGAGGTGATCAGCACTCCTGAGCCTCAACACAAACACCTTCAGCACTCTGACAGCTACTCTGTCTCCAGTTCTGGCTCCCAAGCCATGGAGGACAAACAACTCTGCCAGCCTTATCAAGGAGACATGGACAGCACCACCTACAGCTACCACCCTGGGGAGGAAGGAGCCTTCTCTTCCTTCTTGGAGGACGAGGATGATGAGATCCGTGTGTGAGACTCTAAGCCTTGTGGAATCTGTATGGGGATAGAGACATGTAAGCAACTGTGACACTGTGTTAATGAAACTGAAGGTCTATAACTGCTCCTCGACCCTGTGAGGGAAGTGAGCAAAACACATCTAATGGCCCAGCAGAGGACCTCATAGCACCTGCCTGGGTCTAGCAGCTGCCAGTTTTTCCACTGGACATGTGAGTGATGATGAGGAGACTtctgaagaaggaaaaagaatgTCTTTAATGTCATAACCTCATCACTTGCCTTTGCATTCTGACTCTAACATTGGGTATTTGTGTGTAAGGCTTTTGGTCATGTGTGCTACAGGTGCTGGCTAATGGCATCTACTGACAGGTATATTTTCACTACACAATAAGCACACTCTTTGCTGAGGGGATAAAGGAGCATGCAGCTAATGCTGGTATGCCCACGGGACATGTTATGTATCTGCCTGGCCTGTGGATGAGTGTAAAAATTTTGACAGTAATTACAGCATTGCAGTGCGTGTGAAGGATTTTGGTTACGCATCCTGTTAGACACTGTCATTAGGGCAGCTGACAGAGAAGGATGGGAAATCATTCTGTAATATAGATAACAAACCAGAAACTGAAAGGGGGTGCAGTGCCAGATGTTTTGTGTTCCGTTTTCCCTCCACTAACTGTCCATAATTCTGTACTAGCAGTGGTGACAGCTGGGAAGCTTCATGTCAGGCGGGATTCATGTTTGTAGAGGATTTTGTACACTCGTTGCCTGTGTGGTGTCTTTATCTCACCACTTCCTTCCTCATCATGTGACAGTAACTGTTTAGCTCTGCAGCTAGCTGGTTAAGATGGTGCAGAAATGTTGCTGTATCTCTGTATTAAGTTATGCTGCCAGGAACAGTCTGTGAGATTGGGTTGAAATTGGGTTTTCCTACCTAGCATTATTAAAGCAAATAAGAACACTGCACTAATTAAACTAAACTCGGGTTTGGTATACAAGGCAGTGTATTTCAGCACCATTGTATAGTGTTAAAATCACCTGGGTGAGGGATAACCTGTACACTAACGTCTACTtagtttcttttatttgttcacAGAAGTCATGTTGTAAAATGTGAATATGTGAGGCCTTTACTGCTGCCCAGTCTGTGCTCGTGTGCTTGCCTATAATAGCTTACTCATTTCTGTCTTCTGTAGGCTACAGGGACTAGCTGTTCTACAAAAGTGCTGAGTTGTAAGAAATGCTTGCAGAGCATTTAGCAGCAGGGTTGTCTTCAGCCTTAAGTAGAAATGACAAAAGTGCCAAATTTAATCTGCCATGTAATCCTAAGTAAAACTAGCAATTTGTATATCATCAAACAAGGGATTTTACAGTCTAGGTCCCTAAGTGACTTTATTCAAATAAGGGGCTAAAACCTCATACTTAATTCACTGAAATGCTTAGCTTGAATGTATTTGCTTAAACCACAGAATAGCAAAATCACAGAAGTTCCAagttatttgcctttttttttttttttttttttttggaaaatctgTTTTGAATATAAGAATGTAAATATGGGGAAATAGTTGCAGATTTGCTGTGCCAGCTGAATTTTAAATTCAGAGGTCTGTTAGAATCCAGTCTTCTGAAAGATAACACtgtttattattgcattttgcTAGTCTTTGTTACTTTGTCCTCTTATGCATACATTTCTTGCTTGGATGGCCTTGTTTTGAAAATGCAACATAACAACtatatttttcaataaaagGATGTTATCACCAAG

Function

NR:

description
PREDICTED: cdc42 effector protein 4

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU247909 True 4587 lncRNA 0.38 2 11280080 11378800
XM_026916580.2 False 3519 mRNA 0.45 3 11373852 11388020
XM_034309898.1 False 3258 mRNA 0.45 2 11373316 11388020
XM_034309899.1 False 3204 mRNA 0.45 2 11373316 11388020
XM_034309900.1 False 3097 mRNA 0.45 2 11375405 11388020
XM_034309901.1 False 3272 mRNA 0.45 3 11373855 11388020

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
aatka LOC108277323 coding upstream 207255 11031033 ~ 11072825 (+)
gas7a gas7,gas7a,LOC108260882,LOC108412615,LOC107583758 coding upstream 274059 10984857 ~ 11006021 (+)
LOC113527977 LOC108258077,LOC106964020,LOC103155899,LOC107091756,LOC101062683,LOC105938884 coding upstream 313818 10962975 ~ 10966262 (+)
noxo1a LOC108261250 coding upstream 339081 10937303 ~ 10940999 (+)
gid4 gid4,LOC107724729,LOC107555661,LOC106601817,LOC107559524 coding upstream 360102 10911457 ~ 10919978 (+)
pmp22a LOC108256081 coding downstream 15295 11403315 ~ 11405546 (+)
si:ch211-114m9.1 arhgap44,si:ch211-114m9.1,LOC108432230,LOC107672479,LOC107599321,LOC107670518 coding downstream 62539 11450559 ~ 11493882 (+)
ndel1b ndel1,ndel1b,LOC108432229,LOC105910967,LOC107670517,LOC107744966 coding downstream 112875 11500895 ~ 11508789 (+)
atp5pd atp5h,LOC103042933,LOC103361245 coding downstream 143501 11531521 ~ 11535692 (+)
LOC113528662 NA coding downstream 149027 11537047 ~ 11537165 (+)
LOC117598771 NA non-coding upstream 297787 10971721 ~ 10982293 (+)
G209069 tbl3,LOC107724722,LOC106601810 non-coding upstream 332539 10943255 ~ 10947541 (+)
G209067 NA non-coding upstream 347652 10932059 ~ 10932428 (+)
G208916 NA non-coding upstream 423065 10855155 ~ 10857015 (+)
G208911 NA non-coding upstream 451167 10827025 ~ 10828913 (+)
G209390 NA non-coding downstream 230015 11618035 ~ 11618234 (+)
G209392 NA non-coding downstream 245892 11633912 ~ 11634481 (+)
G209410 NA non-coding downstream 320708 11708728 ~ 11708936 (+)
LOC113528367 NA non-coding downstream 420241 11808261 ~ 11822910 (+)
G209775 NA non-coding downstream 631843 12019863 ~ 12021132 (+)
G208781 cacng4b,LOC108259704,LOC106606650,LOC107565862,LOC107691234,LOC106601773,LOC107724746,LOC107713946 other upstream 498621 10349402 ~ 10781459 (+)
rapgefl1 rapgefl1,LOC107717207,LOC107662398,LOC107740631,LOC107667751,LOC107585050,LOC106600822 other upstream 1292307 9944306 ~ 9987773 (+)
nupr1b nupr1,LOC108413333,LOC107660958,LOC107739393,LOC107567154,LOC100692788,LOC103393451 other upstream 2216667 9061563 ~ 9063413 (+)
asphd1 asphd1,LOC107568490,LOC107755186,LOC107552472,LOC107739384 other upstream 2321980 8950466 ~ 8958100 (+)
trnas-cga_1 NA other upstream 3271669 8008186 ~ 8008411 (+)
luc7l3 luc7l3,LOC107674472,LOC107726809,LOC107654661 other downstream 179099 11567119 ~ 11577823 (+)
tbc1d16 tbc1d16,LOC107559246,LOC107689993,LOC107670685,LOC107562324 other downstream 661387 12049407 ~ 12086058 (+)
LOC113528416 LOC108275780 other downstream 747249 12135269 ~ 12140371 (+)
arhgap17b LOC108279379,LOC108432202 other downstream 770683 12158703 ~ 12190070 (+)
ndufb10 ndufb10 other downstream 979546 12367566 ~ 12374372 (+)

Expression


Co-expression Network