G210858


Basic Information

Item Value
gene id G210858
gene name NA
gene type non-coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047607.1
NCBI id CM018553.1
chromosome length 26458119
location 13591439 ~ 13660814 (-)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>TU249797
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>TU249798
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>TU249799
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TGAACATTCCTCAAGACTCCATGTAATATCATTCAAATGTGCAAAAGTGCTGTAATCAAGCTATCAGAACCCTGCACTAATGGAGATTACACTTACCAGAACTAATGGAATACACCAGACCTTtgaagagaagtgtgtgtgtgtgcgtgtgtgtgttagaaatggagaaaaaataacTGTTATTCTATCAATGTGCAAAGTGTGAATCAGACTTTTACATCTGACTGCATAAATctaaattcatgtttttatatataattttttaaaaaaatcaacagtaccaaacatttcaaatgaaaaataataaaatttaaaatgacacTGGAATGAACATTATTTGCCCTATGCATTTATGCTGTataaattagaaattattataaattagcTGAAaaaagcactgtttttttttttttagaaaagtaAAAATCACTAGAAGGTGATTCCACAATTTTAGCAAAAACTGTAATGTTATTCTCGCCACTGatatttagtttgtttttaattttcttacaCAACACGACATCTATGTAAAAATTAGGCATTTT

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU249797 False 4987 lncRNA 0.38 3 13655034 13660814
TU249798 True 9037 lncRNA 0.39 5 13628793 13660814
TU249799 False 5545 lncRNA 0.37 2 13591439 13637837

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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nfil3-2 nfil3 coding downstream 371417 13210369 ~ 13220022 (-)
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LOC113528601 NA non-coding downstream 218501 13369454 ~ 13372938 (-)
G210871 NA non-coding upstream 2602 13663416 ~ 13663797 (-)
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LOC113527951 NA non-coding upstream 79255 13740069 ~ 13747999 (-)
G210877 NA non-coding upstream 97712 13758526 ~ 13824293 (-)
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elof1 elof1,LOC103393660,LOC100703874,LOC106589640,LOC103384163 other downstream 195982 13390616 ~ 13395457 (-)
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LOC113528401 ppp1r27a,LOC108279187,LOC107748880,LOC107558871,LOC107654574,LOC107665625,LOC107548727,LOC107743019 other upstream 343355 14004169 ~ 14006512 (-)
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G211151 usp36 other upstream 859463 14520277 ~ 14520975 (-)

Expression


Co-expression Network