LOC113540569 (LOC108280981,LOC108280985,LOC108277545,LOC108277574,LOC108280967)


Basic Information

Item Value
gene id LOC113540569
gene name LOC108280981,LOC108280985,LOC108277545,LOC108277574,LOC108280967
gene type misc
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047607.1
NCBI id CM018553.1
chromosome length 26458119
location 21514573 ~ 21565376 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>TU254247
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>XM_034309843.1
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU254247 True 3795 lncRNA 0.35 5 21557990 21565376
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XM_034309844.1 False 2901 mRNA 0.36 7 21514573 21563801

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC117598820 LOC108280985,LOC108277545 coding upstream 34131 21454118 ~ 21480442 (+)
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LOC113527892 NA coding upstream 127486 21381780 ~ 21387087 (+)
sec24b sec24b,LOC108434542,LOC107596339,LOC107731363 coding upstream 185819 21301643 ~ 21328754 (+)
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LOC117599000 NA coding downstream 95049 21660425 ~ 21661039 (+)
LOC117598827 LOC108280967,LOC108277545,LOC108277574 non-coding upstream 8787 21502137 ~ 21505786 (+)
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G215059 NA non-coding downstream 159235 21724611 ~ 22137078 (+)
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Expression


Co-expression Network