znf385c (znf385c)


Basic Information

Item Value
gene id znf385c
gene name znf385c
gene type coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047607.1
NCBI id CM018553.1
chromosome length 26458119
location 6350664 ~ 6443282 (-)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

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CTTTTTATGATttaatatattgaaaaaaatatcagtgtggGAGGAaatcaaggtgtgtgtgtgtttatgtgtgtgtgtgtgtatgaatgtgtgtgtgagagagattatgcaaagaaaaaaaaaaaacagcatgactAAATGATATGTCTTATTGCATTTGGGACATTTCAGCTTCAAAGCCTACAGTGACAGGCGAGTCTCAGGGCTCCTGTTTGAGCTCCATCAGAGGAGAAGTTAAACAGAGTAAAACATCAGCCATACTGTAATCCAACCTGGAGCATAGCAAGCATAGGGTGTGGATCAGGATGTGGGTCAAAGACGATAAAGGGTTTACAACGTCATACCGTTTATCAGCAGTGctgaagattaaaataaaacgtactctaaataaatgaaatttggacatttggtttaaaaaaaaaaataaaagcacaattGAAGTAGAAGCTATAACAGCCAAATATTGACattaacaaaattttaaataaaatggtgtATAAATTGTCTAGTCTATTATTTGTACACTACATGAGAAGTATAGCTAAAGCCTtatatgtctttttttcattatctaTTTTCCCGTATCGTATTTTAATGTGCTGAATTTctgctaaatatatttttgacttttttttttttagtaaagtaATCCAGTTACACAGGAAGAATCCCAATGTGTAgtacaaagaaatgaaattcagtttgtttgtgtgttgaaaaCCCTTTTTGTCTTTGATCCATGTACAAACCACGACTTTTCCTGAAATTtcagaaatctctctctctgtctctctgtatgtgtgtgtatatgcacatgtgtatgtgtgtgcttgtatgtGGATGATATCAGTTATCATCAAACACACATGAAGGGCCCTGGATATCTGTTCTGCTTGTTCTCTCCTTCAGTATGTAAAATCTGTTGAGCAATAACACTGTTTGGAGCTGCAATAGCCATAATCAGAGTGTGAAACACATTTCCTTTTATATAAAATGGAAATTTAGCCATGATTTTTTACCTTTCTCTGTGACACTGGCCATCTcgctgtctgtctttgtgtcctCCTTCCTCTTGGTTACTGTTGAATTAATGCCAGTGAAaatgccagtttttttttttcccctgcactCTGGACGAGATTGAATCTGTGTAATGGTACGTCTTGTAGGACAGAAGGCAGCCATGGAAACATCAGTTGCCAGCGGTGACAAGACAGACGAAGGCATTTTGCGGCACATTTGCTGCAGTGCTTTTAAAAGTGACTTCAACAGTCCTGTTTTGCTTTGGTGGACGTGCAATAAGAGGGGTCTCATTTCGATTGCATACTTTCTTATACggtaaaggaatactccagtgtttttcaaacTCTTCTCTATCTACTCTATTTGTAATGTACATGTGATTAAAGCACACAAGACATTCAATATTTCGAAAACCTGTTTATTCAGACTGAGGTGCAATGAACGTTTAAGGGCAGtcagttaatgtttaaaatattactatatAATGTACAGTTACAATGGCAATAAAGGTCTTAGGATAAGACAAACGTGAAAGAAAGTCTTACCAAAGCTGGTAGTTTTGTCAAGCAATACAGTAATACAGTGGTGTCTACTAGGGGTGCAACACatcactatctgtatctgtttatctgtgactgtattcggatttaaacccgAGGTaggcattatttatttacttacttatttaattatgaAACCTATGACTATGCCCCCAGAAACActacaaaacaatgaaaaaaaaagaacctgaCTGTAGAAATGGTAGCACTTTGAAATCTGGctgtgacagttcctcaacctcagctacatcactcaagttcataactggcctcaactagagatgtgcacaaaaatgtttttcttcaacctgcttatttttgtttat

Function

symbol description
znf385c Predicted to enable nucleic acid binding activity and zinc ion binding activity. Located in nucleus. Is expressed in Purkinje cell. Orthologous to human ZNF385C (zinc finger protein 385C).

NR:

description
zinc finger protein 385C-like isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_026917250.2 False 6910 mRNA 0.41 10 6350664 6443282
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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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G207231 spsb3 other upstream 875321 7318603 ~ 7321962 (-)
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Expression


Co-expression Network