pcdh19 (pcdh19,LOC107680972,LOC107740148,LOC107688683,LOC107593230)



Basic Information


Item Value
gene id pcdh19
gene name pcdh19,LOC107680972,LOC107740148,LOC107688683,LOC107593230
gene type misc
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_047601.1
NCBI id CM018547.1
chromosome length 30450434
location 13841619 ~ 13915588 (-)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence


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Function


symbol description
pcdh19 Enables calcium ion binding activity and identical protein binding activity. Acts upstream of or within brain morphogenesis; neural tube formation; and visual perception. Is integral component of membrane. Is expressed in several structures, including brain; eye; immature eye; posterior neural keel; and spinal cord. Human ortholog(s) of this gene implicated in developmental and epileptic encephalopathy 9. Orthologous to human PCDH19 (protocadherin 19).

NR:

description
protocadherin-19-like isoform X5

GO:

id name namespace
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KEGG:

id description
K16499 PCDHD2; protocadherin delta 2

RNA


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Neighbor


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Expression



Co-expression Network