sh3tc2 (sh3tc2)



Basic Information


Item Value
gene id sh3tc2
gene name sh3tc2
gene type coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_047601.1
NCBI id CM018547.1
chromosome length 30450434
location 14917996 ~ 14932160 (-)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence


>XM_034306000.1
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Function


symbol description
sh3tc2 Human ortholog(s) of this gene implicated in Charcot-Marie-Tooth disease type 4C. Orthologous to human SH3TC2 (SH3 domain and tetratricopeptide repeats 2).

NR:

description
PREDICTED: SH3 domain and tetratricopeptide repeat-containing protein 2-like isoform X2

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KEGG:

id description
K24313 SH3TC; SH3 domain and tetratricopeptide repeat-containing protein

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Neighbor


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fbxo38 fbxo38 other downstream 1890041 12934557 ~ 13027955 (-)
tmsb2 NA other upstream 148624 15080784 ~ 15082504 (-)
apln apln other upstream 584894 15517054 ~ 15540726 (-)
ndufa1 NA other upstream 795490 15727650 ~ 15729388 (-)
G115842 dlg3,LOC107751999 other upstream 918861 15851021 ~ 15852220 (-)
G116014 slc25a5,LOC104931197,LOC101464643,LOC102200398,LOC106515500,LOC103395576,LOC108430428 other upstream 1136575 16068735 ~ 16071362 (-)

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