fam102ab (fam102a,fam102ab,LOC107681850,LOC107748511,LOC107664417)


Basic Information

Item Value
gene id fam102ab
gene name fam102a,fam102ab,LOC107681850,LOC107748511,LOC107664417
gene type coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
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NCBI id CM018567.1
chromosome length 18889892
location 7487816 ~ 7536970 (+)
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Sequence

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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
pkn3 pkn3,LOC108429731,LOC107587363,LOC107597294,LOC107737478,LOC107681845 coding upstream 53796 7412105 ~ 7434020 (+)
cita cit,LOC108429728 coding upstream 104432 7295229 ~ 7383384 (+)
LOC113531518 rab35,LOC108259874,LOC108429727,LOC103036303,LOC105902527 coding upstream 196679 7279646 ~ 7291137 (+)
rplp0 rplp0,LOC107654305 coding upstream 208408 7275554 ~ 7279408 (+)
pip5kl1 pip5kl1 coding downstream 9490 7546460 ~ 7563680 (+)
sh3glb2b sh3glb2,sh3glb2b,LOC108429737,LOC107748508 coding downstream 28817 7565787 ~ 7603329 (+)
LOC113531275 NA coding downstream 81009 7617979 ~ 7620332 (+)
p2rx1 p2rx1 coding downstream 233928 7770898 ~ 7797351 (+)
LOC113531515 LOC108259923 coding downstream 562877 8099847 ~ 8104105 (+)
G382667 LOC108260439 non-coding upstream 37371 7448911 ~ 7450445 (+)
G382646 NA non-coding upstream 99580 7386510 ~ 7388236 (+)
LOC117596228 NA non-coding upstream 330587 7154594 ~ 7157229 (+)
G382606 NA non-coding upstream 378107 7108726 ~ 7109709 (+)
G382380 NA non-coding upstream 420055 7066813 ~ 7067761 (+)
G382929 NA non-coding downstream 109166 7646136 ~ 7646471 (+)
G382931 NA non-coding downstream 112339 7649309 ~ 7649523 (+)
G382932 NA non-coding downstream 112651 7649621 ~ 7650073 (+)
G382942 NA non-coding downstream 125897 7662867 ~ 7665688 (+)
G383067 NA non-coding downstream 368364 7905334 ~ 7909226 (+)
LOC113531088 NA other upstream 226726 7260253 ~ 7261090 (+)
LOC113531592 rnf43 other upstream 429617 6962210 ~ 7058199 (+)
ubb ubb,LOC107567755,LOC107588961,LOC107387081 other upstream 1104131 6380662 ~ 6383685 (+)
G381893 NA other upstream 1245119 6223168 ~ 6242697 (+)
G381835 NA other upstream 1306903 6177804 ~ 6180913 (+)
dpm2 dpm2,LOC107664400 other downstream 1388 7538358 ~ 7544114 (+)
spns3 LOC108260438,LOC108260072 other downstream 605613 8142583 ~ 8161257 (+)
G383217 NA other downstream 645421 8182391 ~ 8213107 (+)
atf5a LOC108260316,LOC108429764,LOC107587340 other downstream 1021856 8558826 ~ 8565257 (+)
gig2o LOC108260416 other downstream 1053340 8590310 ~ 8592381 (+)

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