LOC113526229 (nxpe3)



Basic Information


Item Value
gene id LOC113526229
gene name nxpe3
gene type misc
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_047599.1
NCBI id CM018545.1
chromosome length 32114633
location 10595440 ~ 10614287 (-)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence


>TU95376
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Function


symbol description
nxpe3 Predicted to be located in extracellular region. Orthologous to human NXPE3 (neurexophilin and PC-esterase domain family member 3).

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU95376 False 506 TUCP 0.50 2 10608313 10609042
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XM_034304864.1 False 4184 mRNA 0.44 8 10595440 10614287

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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LOC113526085 nxpe3 coding upstream 79574 10693861 ~ 10717168 (-)
LOC113526121 LOC108266494 coding upstream 379762 10994049 ~ 10997825 (-)
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G79933 NA non-coding downstream 822163 9772634 ~ 9773277 (-)
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LOC113526087 NA non-coding upstream 104847 10719134 ~ 10721674 (-)
G80463 LOC108266368 non-coding upstream 158101 10772388 ~ 10775221 (-)
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G80526 NA non-coding upstream 294886 10909173 ~ 10931379 (-)
si:dkey-83m22.7 NA other downstream 940985 9632685 ~ 9654455 (-)
G79826 NA other downstream 1026320 9568555 ~ 9569120 (-)
LOC113525856 mob4,hspe1,LOC108266284,LOC106582314,LOC106586370,LOC105016277,LOC101078365,LOC101472107,LOC104932517,LOC103156730,LOC106530744,LOC100701317,LOC102310674,LOC103391647,LOC108238849,LOC107690609,LOC107731766 other downstream 1063769 9520729 ~ 9531671 (-)
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G79388 slc5a3,LOC108432604,LOC107748166,LOC107569828,LOC568338,LOC107673698,LOC107756792 other downstream 1575992 8996783 ~ 9019448 (-)
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G80656 man1a2,LOC107099294,LOC107395482,LOC101162964 other upstream 403992 11018279 ~ 11035561 (-)
LOC113546407 NA other upstream 683581 11297868 ~ 11302844 (-)
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irs2b irs2 other upstream 1868374 12482661 ~ 12507688 (-)

Expression



Co-expression Network