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Basic Information

Item Value
gene id zgc:152951
gene name LOC108266837,LOC108424411,LOC103461279,LOC105936156,LOC103141471,LOC106938088,LOC106905368,LOC105893400
gene type coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047599.1
NCBI id CM018545.1
chromosome length 32114633
location 15999677 ~ 16009824 (-)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

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>XM_026911637.2
TGTACTAGAGATCATTACAGGATCTCCACAACCACTGCGTTACCTGAACTCGTCTACAACATCTTTTAACATCAGCCTAACCGTATCGTGGGTGTAGTTCGATTTTTGTAGTCAGTCTAAATACTCCCCTCCCCTGGTTGATCAAAACAATAACGCTTCATTGAGACAAATACTCATCAACATGTACAAAATATTGTTTGGTGGTAGAATTCCGCTGCTCCACCTGCACCATAGATATCCCCAAGTAGAAGTGCAAAGGGAGAGTGAACAAGGGAGCATCAGAAAGCACCTGATTTGTAATGAGCCCACTGTTGTCGTCACTGTAGTAATAAAGGGACCTCAAACAGCACAGGATATTAAAGAAGTGTAATAGTGCTGCAAATCATCCCATAGCAATAGCgcagtattacagtattatattTCAGATGTGAAACGCGATTAGTAACACTGTTATTGTAGTACAGTGTCAGGACTGCAGCAGCACAGATACTGTTACCTGCTGGCTTAAGCTTTGTGTTTCAGCTTGGAGTCGTCTGTCACTCACTTCCGGTGTAATGGGGAAATTACCTTCAAAGCAACTGCTGGTCTGACAGGTGTATTGATGGCTGTGTTTGAGAACCATATAGCAGGAAGAGTTACTGTGTACTCGGTGCCAGGATGCCCGCAGTGTTTACAGGCCAAGGCTGCATTACAGGCACTGAATCTACCAGTGTGTGAAGTGGATGTGAGTCATGATGCAGCTGTCAGGGCTTGGCTGGATAAGATGACTGGTAGCAGCACTGTGCCGCAGATATTCTTTAACAACGTCCACATAGGAGGAAATGAAATTCTTCAAAATTTGACCCCTGATGAACTTGAACCTCTGGTACGTATGGTGAAGGAGAAGCCTGTGCCTCCAGACACCCTACCATTACCTGCAGGAAACAGCCTTGAGTCTGAGGAGAGGGATAGAGGAGCTTCTGAATTATCTGAGGCCCTGAGGAATCTGATCATGAAACTGTACTCTGATCACCTCTCTGCTGATGGCAAGtcAGTGGACTATAAGGCCATGTCTAAAAGCACATGTTATGAACGTTATTGTGAGCTGGCTGTGTACCTGCAGCGTGTGGAGCTACTCTCTTTGAGTCATGAGGAGAGGCTGGCCTTCTTCATCAATGTCTACAATGCCCTGGTTATCCACGGCTACCTGCGCCTCGGCTTCCCCAAAAACATGTGGCAGAGGTACCGGTTCTTCAACTATGTGAGTTATCTGATTGGAGGAGAGGTGTTCACACTGCAGGACATTGAGAATGGAGTGCTGCGGGGAAACAGGAAAGGAATAGCACAACTTCTGAAGCCCTTCTCAAAGAATGACCCTAGACTACAGGTTGCACTTCCTGAAGCAGAGCCTCTAATTCATTTTGCACTGAACTGTGGTGCGAAAGGCTGCCCGCCCATTAGGGCCTACACCCCAAAGGACATTGGCAGTCAGCTGCGGACTGCTGCTGAGGCATTTCTGGAGGCTGATGATGGCTGCATAGTGGATTCTATGAAAAGAGAGGTGAAGCTTAGCCAGATCTTCAAATGGTACAAGGCAGATTTTGGAGACACTGATGAAAAGTTGCTGAACTGGGTTTTAAACCACATGAGGGCATCTCAGAAGAAGACAAGTCTGAAAACTCTTCTATCTACAGGGAATGTTAAAGTGAGATACATGCCTTATGACTGGTCCACCAACAGTTCACACTGATTAAAACTCTCTTACTAAGAGTTTAGGGCTTCAGGATGACTGACTCCGATGTCGTTGATATTTTCTTTAGCAAATGCATGAGAGCACAGATATTTTTACTATGGCTGTAGCCAACTTCTCTGTCAACACTAGGATAAAAATTAAACCACAGAAAAGCTGGCCTTGCTTTTAAGAGGATAACTATGCATTTTAACAATAATTCCTCTACGCTCCAAAGGGCAAGTTTTCCTACCAGCCACTATCCTAATAATTATACTGGATTTTACACTTCCTTAATAATTCTTTACTTTGTGTTAACCaactttatttctcttaaaaagatttaaacacTATAATAATTACGatatttaattgattttttttttaccattttgttAATTTAGCTAGTATGGTCCACTTTAGctatgaaaacaaatgaatatttGTTGTGGCTATAAGCACTAAGACATTATGCCCCACTGGGGCTGTTCAGCATGGACTATATCAGCAACTGGAcctaaaagcataaaaatgcaTGCAACTGCaccattattatttacacatggCTCACAGTGAGCATAAACTTTAGCTAAGTCCATTCCATTTAGAATGTCAATATCAAAGCTTACATAATATCATATTAATTGATTTGTCTGTGCAACTATTTGCCATGTTCAAAATACTCATGAGAGTtgagagtgtgttgtgaaaTTGACTGCATGTTGTATGGAAAGGCTGGAATTTTAAAATCCTATACATAGTAATGTATGAACTCTATTCCATCCGGTACCTTTTCACCTCGGTATAAGACACCTATATTCCAAGTGTTCCTCATACTTAGTTCAAGAATTTCtgttctatattttattaactCAAAgatctatactgtatatgcaatatgtaaaggaaaaataaacagcaggTAAACAATTTTATAAACCGGGAATGATTTCATTATTATACTTATCAAGAATTAAATCAAtgcaaagctagctagctaatattgaATTCATTCTGTTGCATGAACCTGGGTTATATAATTCTTGAGCAATATTATGCACTGATGAATAAATTATGATATTGCAAGCTTTAAAAATGAAGCATATGAATCTTCTGGTTTGGGTCCCTCTTGTTATCTGAAGCCTGTGAATTGAACGATATGGATTATTTTGTAGAGTTTATTAATTGGTTGTACTTCCTTTCATATGCAGCTGGAGTCACTGTTGGTTATGTGAATACTGTTGTATTATGTGTCATTACATGGTGCCACTGAATTGGTACATGTTTACTTTTAACCATATGCATTATGTTTAGCaagaaaaatatatgttttgtgGAATGAACGATGAAAAAGTTTCTGTTGTGCATATTTCACTGAGCAGTTTGAGAGAAatctatgtatgtttttttctcctcataTTCCGCACCGAGATAATGCGCATGAAATTGAAAATACACTGAGTGTTTGCCTGATAAATGAACTGTGTCATTACTTATCAGCAATAATTGCTTACACAGGTTTCCATTCATATTcaagaaatatttataaaaattaaaaataattaattattacatgACTAATAAAATTCTGTATTGCTTGAATGGTAGCATGTTGATTATTATTGAGCTCTG

Function

NR:

description
uncharacterized protein LOC110520387

GO: NA

KEGG: NA

RNA

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XM_026911637.2 False 3340 mRNA 0.39 9 15999677 16009824

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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neb neb,LOC107725229,LOC107658288 coding upstream 284068 16293892 ~ 16349242 (-)
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G83270 NA non-coding downstream 112302 15830129 ~ 15887375 (-)
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pou1f1 pou1f1,LOC107688653,LOC107661330,LOC107561319 other downstream 25763 15943740 ~ 15973914 (-)
LOC117597380 NA other downstream 884982 15106949 ~ 15114695 (-)
dcaf6 dcaf6 other downstream 922461 15049883 ~ 15077216 (-)
ndp ndp,LOC107748154,LOC107756747,LOC107695497,LOC107595887 other downstream 1162268 14827675 ~ 14837409 (-)
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G83554 NA other upstream 210140 16219964 ~ 16220866 (-)
si:dkey-91i10.2 LOC108266132,LOC106530433,LOC107658202 other upstream 360403 16370227 ~ 16406478 (-)
mettl8 mettl8 other upstream 1018413 17028237 ~ 17039843 (-)
sp3a sp3 other upstream 1362155 17371979 ~ 17381172 (-)

Expression


Co-expression Network