LOC113526085 (nxpe3)


Basic Information

Item Value
gene id LOC113526085
gene name nxpe3
gene type coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047599.1
NCBI id CM018545.1
chromosome length 32114633
location 10693861 ~ 10717168 (-)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

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Function

symbol description
nxpe3 Predicted to be located in extracellular region. Orthologous to human NXPE3 (neurexophilin and PC-esterase domain family member 3).

NR:

description
PREDICTED: NXPE family member 3 isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_026912875.2 False 1993 mRNA 0.47 6 10693861 10717168
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XM_026912877.2 False 2289 mRNA 0.46 6 10693861 10709696
XM_026912878.2 False 1814 mRNA 0.47 5 10693861 10717147
XM_034304763.1 False 2323 mRNA 0.46 7 10693861 10709696
XM_034304764.1 True 2560 mRNA 0.46 7 10693861 10716026
XM_034304765.1 False 2315 mRNA 0.46 5 10693861 10716027

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC113546580 NA coding downstream 4072 10675383 ~ 10689789 (-)
LOC113523755 nxpe3 coding downstream 47666 10635365 ~ 10646195 (-)
pou2f1b LOC108266565,LOC108426038 coding downstream 154990 10517207 ~ 10538871 (-)
lamp1b LOC108266564 coding downstream 188077 10501955 ~ 10505784 (-)
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LOC113526121 LOC108266494 coding upstream 276881 10994049 ~ 10997825 (-)
gdap2 gdap2,LOC107668848,LOC107658195 coding upstream 391446 11108614 ~ 11128901 (-)
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G80526 NA non-coding upstream 192005 10909173 ~ 10931379 (-)
G80601 NA non-coding upstream 254143 10971311 ~ 10971971 (-)
LOC113526229 nxpe3 other downstream 79574 10595440 ~ 10614287 (-)
si:dkey-83m22.7 NA other downstream 1039406 9632685 ~ 9654455 (-)
G79826 NA other downstream 1124741 9568555 ~ 9569120 (-)
LOC113525856 mob4,hspe1,LOC108266284,LOC106582314,LOC106586370,LOC105016277,LOC101078365,LOC101472107,LOC104932517,LOC103156730,LOC106530744,LOC100701317,LOC102310674,LOC103391647,LOC108238849,LOC107690609,LOC107731766 other downstream 1162190 9520729 ~ 9531671 (-)
cnga4 cnga4 other downstream 1545214 9099536 ~ 9148647 (-)
G80600 NA other upstream 252249 10969417 ~ 10971157 (-)
G80656 man1a2,LOC107099294,LOC107395482,LOC101162964 other upstream 301111 11018279 ~ 11035561 (-)
LOC113546407 NA other upstream 580700 11297868 ~ 11302844 (-)
mphosph8 mphosph8,LOC107658258 other upstream 733044 11450212 ~ 11460325 (-)
irs2b irs2 other upstream 1765493 12482661 ~ 12507688 (-)

Expression


Co-expression Network