crfb1



Basic Information


Item Value
gene id crfb1
gene name NA
gene type coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_047599.1
NCBI id CM018545.1
chromosome length 32114633
location 2775840 ~ 2799002 (-)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence


>XM_026938205.2
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>XM_026938224.2
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Function


GO:

id name namespace
GO:0019221 cytokine-mediated signaling pathway biological_process
GO:0051607 defense response to virus biological_process
GO:0004904 interferon receptor activity molecular_function

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_026938233.2 False 3766 mRNA 0.40 9 2775840 2790715

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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c5h2orf69 c6h2orf69 coding upstream 120304 2919306 ~ 2920007 (-)
nabp1a nabp1,nabp2,LOC107718374,LOC106575791,LOC108255000 coding upstream 129819 2928821 ~ 2953801 (-)
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LOC113547075 slc5a7,LOC108440498,LOC106586545,LOC106582186,LOC107733037 other downstream 711542 2047779 ~ 2064298 (-)
G75893 col6a3,LOC108262369,LOC106600155 other downstream 972195 1797982 ~ 1803645 (-)
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LOC113541352 c6h21orf62 other upstream 2004 2801006 ~ 2805863 (-)
faima faima,LOC108266416,LOC108425966,LOC102793570,LOC107723686,LOC107567769,LOC101481285 other upstream 987954 3786956 ~ 3816059 (-)
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Expression



Co-expression Network