G98776


Basic Information

Item Value
gene id G98776
gene name NA
gene type non-coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047600.1
NCBI id CM018546.1
chromosome length 31307711
location 13129200 ~ 13135173 (-)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>TU117117
gccacatcacatacacattgAGATGGCTTATCCTGGGTGAGCTTTGGTAGGTAAATGGGTATACCGTTTTCCTCACTGGTGTGGTAGACGTTTACGGGTGAAGCCGCGGTTGGCACAGACTGCCCCTATGGCAAGCAGATGGGCACTGGGGTGGCCATGTGGCCCAGTATGAGGAGCCCTCCCCCCAATTAATAACTCGGGTTTTGTTCTAATTAATGGACACAATCTGCGGTGAGTTACAAAAAGGGTGTGTGATTGGTTCTTAAAAGACACAACATTTGTAGTCCAATTTTTGTTAGCTAGAACAGACTTTAATTTaattggtgtgtgtatgagagagagagagacagaaatagttgctgtttttttaatgccagtCCAACTCAATGTTCTAGTGACTAGTGACTGGTCATaagaaataatacattataacatcaatttttttttttttttttgagtgttacCTGGATTATGACTTGTGATCCAGATCAGTGGATCTGAACATGGGGTCCAGAGACCCCCAGGGGTGCATGAAGCATAgccaagatttttaaaaatttatttacagtggtgTTAATCACAaccaaagttattatatttatcattgagttttatagttattagcctttTTGGTTTAATTCAAACCTCACTAACTCAAAAACcagtagcctataaataatatcaggttggacctaatgtgttggACCCTATTTAAAAGAAAGCTCACGCGCgccaataaatagccagaatatttcAGTGCATGGATTATcttcataaattaaataaactctGTACTGAGGGGGgccatgaaatttattttaaagttaaaggGGTCCTGGCTCCAGAAAAGTTTGAAATCTAGATGACTGGATGAAAGATGGAATTGTCATTGTTTTTGCTACAGCAGATGTTAGTTATATGTGGAGCGTGCCTGTTATAACATAacctacacacactgacagtcaAAACCTGCTGTGCACTGGACCAAGAGCTCTTTGGCACTGTAAATGTGTTGGCCTGTTACAGTGAGTGCTTTCGAATAAAACCACACTTATGTCGACTCAGTGAAGCACATCAGTCATAGGCTAATTAAATATGTAGGCCTAACTGAGGCATGATGTGTCCCTATCTCCTCCAAACACCTTTCCTAATGTCTGGCAGCATCAGAGGTTAGAGGAGCACCAGAAGCTCTCCTCAAAAGATGGAGGTCAAACAGCAATGAAggttctgggttttttttttttttcggttgaATTCATGCTGACCTAAGAAAACAGTTCTTGGTTCATTTTAACAGCGATTATTTCTTTTGTGGCAAGTCATGATCTCAGTGCAAATAGCATTAAAAGCTATGATTATCAGTGCTAATGAGACAGATTTTGCTGCTGGGctcagagagatggagaaaagtAATAGAATGAGAGAGTACATGTTAGCGAAAGGGGAGAGAGCGAGCTGTGCTtatcaaaatattatttctccCAATTAATCCTGTTTTAATGTGTACGCGTGCAGCGCTTGGCCGGAGCATTGCTGTTTCATATCTGCGCTTTTCCCCTGAGTGTTTCATGCATTATGTAGCAATGATTATTACttaattacacattaataaatCCGCTTTATTTGCAGGACATTAAGGGAGAACGGGTGCACATGATGGTATAAAAGACACAGAGccctcctttcctttcctttccacAGTGTTGTTTACACTCGTTGAGATCAAATTATACCTTTAACCccataaagaaaaacagaagagtgGGGTTTGTGCTTGTCTTGACAAGGGATGGACAGGGATCATTTCCTCCTCATCTCCACATCTGTCTCCTCATATAGACCGACTCACTCAGTATTGAGtgctgaaatgtgaaaatgtaatcTCCAGCTTGTTATATCTCATTTACAAAGATCACTGCTTTAAGATGATGTGATTTGTGAGTAGATTTCCTATTTTGGGGAGTTCTCTCATGTTGTTGTAGATACCATGACAGGCATAGAGTTTGTGATACCGTATTTATCCCTGTTTCAAATTTTATTCTCTATATATGTTTTTGTTCATATGTCAAAATTGAATTCACAAGTATTTCGCTCTAATAGATACTATTTGTAGCTTGAAGCATAACaaacaaGACAAAAATTCTGCTATACTATAGTACAGTTCTTGAATTGACCCCAAGAAGAGGTTAAAAAAGACTCTTCAATTTGATGTCAGAAGTGTAGAAATGGTAAAAGTGATGCTGGTTTGTGTTTCTGGAAACATTTGGCTGTGATTAGTAAGAGATCTGTATCAACAAAAATCAAATTACAAAGGCTAATATAATGTCAAAGAGTTTACATCTGTTTTCTagttttgtagtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtgtgagctgaagtGTAGGGCCATCTGGTTTTAGCATTAAATGGCTTTTTTATTGTCACCTAGACTTTTGCAGCCGTGCAGGACTTTCATTGGTCAGTGGGCTGTTATAAAACGCTGAAGTGAGTTAGCATGGAGCTGCATGTCCATAGCTGCACAGAGCAAGGAGCAAAAAACCTCCTTCCTGTTTTTAACATCATTATGGagtcccattttttttttcagcacgtGTGTTTTCCATTTTGTGCACTTATTTTCTGTTTGCCTTTATGTTTGCAAGTTGATCATAATGTAAGTCATGCATAATTCTACAAAATATGTGATTACTTTTGACACCgatcattaattaatcaaaatgatTTTTGGTAATGTGTCAATTAAGagattataatgtttatttgttattttgttctTCTTAaggttatgtgtgtgtatatatatatatatacatacattattttatttttgtttttttgtgtaatgGCCAACATAGgttaaaatacagaaatgttgCGGAAGAACCTTAAACATGAATTAGAAACcatttttattaatcaatttattcttttattgttcatttattaGTACCTCTTTGACCAGGCGTTTTTGCTTTCTCACTGTTTCCCTGCAGTGTGCCAGACCTAATTAAAAGCAAACCTAATTAAGAAACAGCAattcatttttgcattatttacatCAGACATGGCTCATCTATTTATTTAGGATGATAGTAATTGCATACATGAGCAGTTTTACATAATGTGTAACCTCCATAAGTGTTAAATTATGAAACGTAAATAAAGTCACTTACTCAGGAACAGAAAAGCgccaaaaaataaactttttggTTATCCATAATAAGGTCTATATAGTGTCAGATCTGAATCACAGTGATGTCACTGCGGTAAATCACTGTAGAAAGATTGTTAGTATATTATATGAATGCGAAGTTATTACTTCATTAGTTTTGGTATTGGTATCTGCCTGCATGAGATCTATACATATCAATATCTATCATAGCAATCCGAATATCAATATCTGTAATGTAACATTTAAGCATGGAGTGATTAGTCACAGTTCAGCAGATTTTCTATTAGCATAATTACATTGTCCTCTgtgaacattttagattttgttaTATCAGCATGTTACTATACATTATGTACATTCAGGTAATGAATTAGTGGCCTTCAGAGATTTTCTACTGACACCGATACTGTAGCCTAGTTTCTGCTGTAATGGAAGATGAACAagaaagttgatttttttaattttcactgaGTTCACAGCATGAGCCGTTTGTTAAACAACTCTTAAAAGTATTTCATCAAGACCAGGAGAAAATGTAATTATGCACAGTTTGACAGcagtggtgtttttttctcGCCATTACTGTTGCAATCATGATGAGTGGCACTGTTAAAAGTACAACTCTCTCCTTTGCGTTCTCTCAtgcacaattacacacacacacacacacacacacacacaaaaccacactgCAGCCTTACCCTTTTCCCCTTGCTGAATATGTGCCCAGTGTCATTAGCATTGTGGGGTAATTATGTTTCTCTTCTTGTACTACTTTTTCTTCTTAGTCTGTGCCATGTATAAAATACATTAGCTGTGTAACGTAGCATATGCTCCAGCTCAGGCTGTGTTTCTCCGCTGCTACGTCACCGAAGGCTGCTCCATTTAGAAGCCAATAAATGCAACGACATTCTAATAGTTTTTGAGAGGGCAACTGGCATAGCCAATCTTTTTCAACCTTTAGCAGCTGAAATTCTCTGCAGCTGTCTGAAAATTGGCAGAAAATGTTGGAAAGCGAAGACACAGGTACATCAGAGATCGAATTAAAATGTAAGTcgaattaaaattcaaatcatGAATGTTGAAATTAGTAGCTTTTGGTCATAACATAGTGATTAGTAAGATAAATGAAGTGCTAGCTGGTGATTGTCTATTTCAGTTAAACAACATTAAGCTTAGCAGTGTGATTGAGGAGCTGGAGCTTTCACAATGGCTTTGTTGTTTCAGACAGTCTTATTTCTTGTGAATAAATATTGCAGAGTAGCCTATAATTTGTCTCCATCCTTTACGTACTTTTATGTAGCTGTTGTTTTACAGTGACCACTTCAGGTTGGGAGGTTAGAGCATCAGACACTAGCTTGTACTGGAGGTACGAAAGGAGGGGGTGTCATCTCCCTGGTCTGTGGTATGTCTGCCAGTCACAACTCCTTATCTGCAGCTTGCCGGCTAGTTTTTTGTGCAAGGATCTGTCTTAATATAGAAGCTCAGCACAATGTGCCATTGCGACAGCTTAACTGTGCTTTATCAGTGAGCCTGGACTCAGTGGCCTGGAACCGTGGACTCGCTCAGGATCTGCTCTGCGTTTCTAAAGAGGAGGTGCCACTCTGGCGAGACTCGCTATTAATTCTGTTTGTACCCCCTTCTTGCCTGCCAACCATTGCTTCCCTTGTCCGAGGCTCCCTGAGGAGGCTGGCCGCTCTAAGACTCCGCATGCTGAAACCCGGATTGGGCTGCTGCATGGGGCAGATTAAAATGTGCTGGAACACCACTCAGAGAAAGACTCTCACAAATCTGCTCAT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Function

NR:

description
neurocan core protein

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU117117 True 5903 lncRNA 0.40 3 13129200 13135173

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
si:ch211-212o1.2 tmem189,si:ch211-212o1.2,LOC108264382,LOC107672277,LOC107738740,LOC107740306,LOC107583780,LOC103466733,LOC100695703 coding downstream 144555 12948587 ~ 12984645 (-)
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Expression


Co-expression Network