G101178


Basic Information

Item Value
gene id G101178
gene name NA
gene type unknown
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047600.1
NCBI id CM018546.1
chromosome length 31307711
location 18187447 ~ 18196806 (-)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>TU119855
ACTTAAAAAGATTACAAGATTGTTGACACAATTATTCACAATAATTAATTTTCCAAATGTTTTCTTGCCAAAGCAACTTAGAGTAGAGCTGAATGTCTCAGCTTATCAGCCTTGCTGAACAGTTGAATTGTGGCAATAAGAtattaaagaagaataaagttGTCTGGTTACTAAGGTGTCAACCTACTAATgagaaaaatctgaaaactATACATTACAAATTTGACAAAGTGAAATGCAATAGTTATATTGCAGACTGTGTCTGCATCAGTTAATTTTAATTACCACTGCCATATTAGAGTGACCACAGAATAATGCATTGACTTTTCCTTCATTATTCCTGAGAATAATATCTTGAGTGCAGATCaagtcataataataaattatcatGCAAAGTAGTTGCTATTTCCTGTTTTCATGATTAGGCATACtggaaagaaatgaagaacTGATATTTTTGCAGCATACCCAAAAAAATGTAACCTAAAAAGGACAGGAGAGAGTCCACATGAATGTACTTGGGCAGAAAACTGGCCCTCTATCAATAATGGGTGGACTTCCATAGTATGTGTCTAGGGAGATATTCTGACCCTACTGCTGGTAGCTCCTTTGATGACCTCCTTTGGTAGTTATGAGGATGTGTCGTAAGCTTGTTCTTTACAActgtatgtacactcaccaaacactttattaggaacacctgtacacctactcattcatgcggttatctaatcaaccaatgatgtggcagcaatgcaatgcataacatcatgcagCTTCAGACAATGTCACATCAACCAAGAAttggaaaaaagtgatctcagtgattttgaccatggcatgattgttggtgccagatgggctagtttgagtatttctataagtgctgggattttcatgcacaacagtcactttacacagaatggtgcaataaagaaaagacatccagtaagcagcagttctgcagacggaGACGCCTTGTTGGTGAGAGAGATCAACAgacaatggccagactggtcagctgacagaaaggctacagtaactcagataaccaccctgtacaattgtggtgagcagaagagcatctcagaatgcatttcaagatgggctacaacagcagaagaccacgtagggttccacttctgtcagccaagaacagaaagctgaggcttcagtgggcacaggctcggACGGTTGAAGACTTGAAAACCATAGGCTGATCTGATGAAGCtagatttctgctgaggcacactgATGGTAGGGTctgaatttggcaccaacagcaagACTCCATGGACCCAACCATGCTGATCATATTCATCCCTTCATGGCTACAATTTACTCATTGTCTAAAGGCTACTTCCcacatgataatgcaccatgtcacaaagcagagttcgtttcaaactggtttcatgaacgaGTTCAATGTTCtccagtggccttcccagtcaccagatctgaatccaatagaacacctttgggatgtggtagaaagggagattcacagcatgaaagtgcacctgaaaaatctgcaggaattgtgtgatgcaaggGTCTgaattcctttgagatcaaagggaggccctaccctgTATTAGTATAGTGCTCCTAACGTGtgcagtgagtgtaaatacaTATGACTAAGTCTATTTCTCATTTGAAGCTGTGTGAAATTCTGTGATTATGTTGGCTCCAGTGTAACATCACGTCCCACACAGAGAGAAGGTATCATAACaggaattttgaaaaatatattaatacaccACTAAATGTTGTTAAAAGGAAAGGCAGTAACATagtaatgtataaatatatatcctTTTGCATGTGTCCTAGCCAAGTTTGTTTGCATCTTTTCACATTTGAAGTTATTGCCTGCCTTCACTTGAAAAATACTATGCAGAAGTCTTaggaacatgtgaaaaatgctgtaaagcaaagatgccttcaaaattaattaaacattttcaacatAAAAAATACACTCCCCGTGTATTTCAGCAGAGTATGAACTTCAATAGCTATCAAAAaatgttgacttttttaaacaatatggccaccacgtGTCAATCAATTCTTAACAAGGCAGAGCCTAATTTACttaaacagctgtaactcaagTGGATTTTCAAGTAGAAACTTGAAAGTCATATATAAGATGATATTCTGAGGTCATGTGCACACTTTGGTGCACTGTCATTAAAGGGGCAGAGCTAACATCAGCAACCATGAGTCcaatcaagctgaaatttggtacgGTGTACCATACAAATTTGGTACTAATCTGTATAGGCATTCTTTTATGacttgaattttttattttccaaaaagttACACAACTCCTTTGTAACaatcaatacaaaaatatatcttACACCCCTCATCCCATTCCCCAGGCTCCTATCCAAACCATCTGAGGAAATCCTTACAACttaaaacacttctgtaataTGGAAAGCATGGCTCTTGATTGCCTTTCCAATGTACCACTAATAACATATGTACAGCATATGTCCAAGGACATATTCCCTTGTAACTTATTATCTATATTGCCATGTGTGAAATATGTGTCCCACTTTGACAGGTATTTTTCTTCCTTATAATCCCTGTATGGCATATGTTCATAAGCCGCAACATTTCTGAACTCAATAATCCATTTCTCCAATGCAGGACTTCCCAGATTCCTCCAACTCCTGAGAAGAATCTGTTGTCCAATCATTACCGCAGTTGCCGTCCACTCTCTGTGGGCCATAAACAGTCCAGATAACACCCCTATGTCCCCCAGGGTTTCTTTGACAGAAATATCCCATTACATTCTCAACACCTGCTGGGGGTCCAATGAAACCGCTGTAGTATTTTAAATGGTATCAGCTTTACTCTTACATCTCTGGAATGCTTGCATCcagaatcacatttttttccccaggctTGGTCATCAAATTGAATCCCCAAATCTCTTTCCGATACTCCTTTAAGTGCTGTCATAGTTTTGTTTTCTACCCCACTCATCTTCAGATTATAATACTTAGATGCCTCCCGTCCTCCCCCAGCTATTTCCAGGATTCTGCTGACCTGGGAGCCCTTATGTATGGCCTAAATAATTGCTTCAGTGCTTGTCATAATTGACAGTATCTACATTTGTGAGATTTATTGAAGCCATATTGTTGTGATAGGTTATCAAAGGATTTCATTATACCTCCTCTATATAAATCTCCTAGAGTGATGAAGCCCTGATGCCCTTTTTGcaatatttccatataaatgaGATCTTATCTATATGCACTTTGGGATTCTGCCTATTTATCCTGTAAGGGCATTTCTGAAGTTGACCTAATTACTTAAGAAACATGGCTGCCATCGGTCCATCagttttcagcaggcatttgaaaGAGTTAACAATGTCACATAACTTGAGTGGTAGGTTTGGGTAGGGACCCAATTCTATCTGCTGCAATGTCACTCAAATTGGCCAGGGGGGCCGGGGGGTGTGGGGGGGTGGTATTTATGTTTTGACTTACAAAACATATTTCTTGGAAAATAAGATGCACGGTGAAATTTACACACAGAGGGACGTTACGCTGAGTTACGCTCAGATATCTGTTTCTCAGGAAATGTAAGTCGcatcaagctgaaatttggtaagCTGAATCTGCAAatggatttttgatgatgacctaattacttttaaaaaaaaatggccaccaTCGGCCAAACCCAAAACTTGATAACTATGTTCGTCTGCTGTCTTGTTATTGTTCTGCATGAAATGGAATGACTTGGGCACATTGGTGAGCTAATTGTGAAGTTTGCTTGTACCCTGCAAAtcactgcttgcagctataaTTGGGGAGCCAGGCAAATAGTGCTTGtaaccctattgtttttgttaggatttttcttcttcttcttcttcttcttcctccactAAAACTGATCATGCTGACCAAACCGTAGGCCCTACAGCCAGGCAAGAGAGATGAGCCCAATCAGCCTAATTGTGGCACTATAGCAAAGCATTTCATGCTTTGTCTCATATCTCAAATATCATAAGTCCTACAGTGAAAGTTAATTTCACTACTTATGCTGCAAGATTCTGTGCAAAGTTTGGACATGTTTGTTCTCAGCAGAGATAAGTGCATGTGAGTTATTCTTCAGGCTATTTTTGAACATTATATGTTTTCAGTATTtgatataaaacatatatttattcaaaaataacaactgATTTCGATTAAAAAGTAATCAAATGTCAAGTTCACATGGTTATTATTCTTCTATTTGAcagattattaggctgcatgtaaatgtaaccaatcagaatagagtaAACCAGGTAAAGCCAATctgaattacattttaatctgttgCAAAGGTgggttgcatttttttaaaataatctattAAACAAACATGTATGTAAGAGCCATATCTTCTGAATGCAGTCCTATTTCTTTGAACTAGTAAGACACTCTGGTTACCCCTCAAATTTCATAAGAATGGGCCCATAGGGGGTGCTATAACTAAAAATGCATATATCTCTTCAGCTGACATAGAAAGATGAAGATGGCACACTTTTGGACCCTGGGGAataaaatgctgtgtgtgtgggtgagtgagttagtgagtgaaAGTCCTAGGATTAATTAGCATAATTCTATTCAAACAGTTTAACAGAGTAACTCATTATTGCTTGCATGGATTCACTCAAAACTTATACCGGACATTATTCTGAGGTCATTATTCTAATTACTTAAAAACATGACTGCCTTCAGTCAATCagttttcagcaggcatttgaaaAGGTTAACATTCAGCTAAAATTAGTTGTCATGAAACTTGTAATTGATGTTCATGTATCAGCACGTATCAGCATGTATCAGCACAATCAGCACGATCTAATGCAGTTTTACTCAAATTGGCCAACGCAATCTTACTTAAATGCAACCTTaataaaattatgcaaattaacaTAAATTTGACTTACACAAATTATCAAA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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU119855 True 9278 TUCP 0.39 2 18187447 18196806

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC117597582 NA coding downstream 462127 17720545 ~ 17725320 (-)
alpk3a LOC108264806,LOC104964022 coding downstream 709162 17422361 ~ 17478285 (-)
LOC113539712 frmd5,LOC108435336,LOC104917831,LOC107562133,LOC570903,LOC102299895 coding downstream 879545 17088641 ~ 17307902 (-)
LOC117597525 NA coding downstream 1243017 16938891 ~ 16944430 (-)
chd2 chd2,LOC107690375,LOC107715217 coding downstream 1446376 16680922 ~ 16741071 (-)
rasgrf1 rasgrf1,si:ch211-234p18.3,LOC107715192,LOC107690363,LOC107709805,LOC107691143,LOC108230026,LOC102298753 coding upstream 85813 18282619 ~ 18524226 (-)
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pik3c2a pik3c2a,LOC108264692 coding upstream 1210244 19407050 ~ 19496993 (-)
LOC113526513 cxcr5 coding upstream 1854526 20051332 ~ 20054436 (-)
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LOC113537962 NA non-coding downstream 335387 17847025 ~ 17852060 (-)
G100771 NA non-coding downstream 469419 17717351 ~ 17718028 (-)
G100765 NA non-coding downstream 583789 17603229 ~ 17603658 (-)
G101383 NA non-coding upstream 328679 18525485 ~ 18528714 (-)
G101405 NA non-coding upstream 354635 18551441 ~ 18551725 (-)
G101406 NA non-coding upstream 355111 18551917 ~ 18552203 (-)
G101408 NA non-coding upstream 358070 18554876 ~ 18555193 (-)
G101409 NA non-coding upstream 362513 18559319 ~ 18559614 (-)
tmem170a tmem170a,LOC106573739,LOC107596918 other downstream 2829884 15347166 ~ 15357563 (-)
dennd11 kiaa1147,LOC107738692,LOC107686315 other downstream 3840439 14335936 ~ 14347008 (-)
c6h15orf39 c4h15orf39 other downstream 4624873 13550680 ~ 13562574 (-)
G98770 NA other downstream 5135136 13045823 ~ 13052311 (-)
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LOC113527007 NA other upstream 1783263 19980069 ~ 19980259 (-)
akt2 akt2,LOC108264340,LOC107711004,LOC107557843,LOC107692744,LOC107714435,LOC107572728 other upstream 2199060 20395866 ~ 20416574 (-)
G102566 NA other upstream 2756796 20953602 ~ 20966910 (-)
sertad3 sertad3 other upstream 2798535 20995341 ~ 21013100 (-)
si LOC108264758,LOC108431149 other upstream 4034642 22231448 ~ 22306769 (-)

Expression


Co-expression Network