G103889



Basic Information


Item Value
gene id G103889
gene name NA
gene type non-coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_047600.1
NCBI id CM018546.1
chromosome length 31307711
location 23729878 ~ 23738753 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence


>TU122929
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>TU122932
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>TU122933
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GGCTGAGTGCCAAGAGAGCGAAATTGCCcatattctctctcccctgtcaatcagagtgacactagccagcACTTGTGTAAATGAGTTAAATCCCTCTAAAGATCCCTTCTTGATTCTCATGTCAGAACTAAGCAGATtaacatacagaatcaaatcatgaCGCTTGAGCCATTTTGTAGGCAATTTAGAGCAGCTCAGGGGTTTGGGTTACTCAGTGAACTTGGTTTTGGAGGGAATGAGAAGTGCAGATAAGCCACTAAGCCCTGCTGTGATCTAAAAAGCACTCAGTGacctttatttaacaatttCATAAAACGCCATGTGTAATATCAGCTAGTGAGGAACATGTGGAATCCTGTGCAGGGCTACTTACCACGCGTATTCTGTGGCCGATGGCTTTGGGTGGCAGGTTGCTTGTGAACTTGGCACGCACCATGCCACTGTTACCATGAGCACGAGTGACTTTACCCCAGATAACGCGGGTCTTGTTGGGCTTTCCACCTGGGGTCACTGTTGTTCTTTTTTGCCTTGTAGACATAGGCACAGCGTTTCCCCAGGTAGAAATCCACTTCATTACGGGTGTAGACACCCTCTACCTTTAGCAGTGCTGTATGCTCACGTTGGTTCCTCAAGCCACGCTTGTATCCAGCAAAGATTGCCTTGCACCACACCTTCCAGGCATTGTGAAGTCTTTTAATCCGGCGCCAAGGAATTTCTGAAGAAAGACAAGAGTTACAGGGTTTTAGAGTTTGCTAGAGAACCGGTTGTCATCATCAGgctcaataaacacacacactacacaacactgctAAACCCTGCCGCATTAGCTAGCCAGCTTTCTAACTTATCCACCACTAATAAAGACTAACTTTCCCTCTTTAAAAGCAGTATTGTACTTTATCTGCTCCAACCCCAATACGAATCGTTCAGAAATCTGGTGCAGGGAGCTCAGAGAGTCAGCTCTCACTCCAACAATCAACACTAAATCTTCGCCATCTTGTCTTTATACCAAACAAAAACCACCAACATATGAAAAGAAGACGTTTAACTAAAGTTTGATAGAAATATCGCGCTTAGTATCACTTCATAGCATGTTCAAAAGTGCAATTTTAAAGCCAGTGCTAAAATTTACCTGCTGGATACGGCAATAAAGATGGCGGAAAAGGACGGCCGAACGGAATTCTGGGTAACAAAT

Function


GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU122932 False 6193 lncRNA 0.37 3 23729878 23738753
TU122933 False 6195 lncRNA 0.37 3 23729878 23738753

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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si:ch211-71n6.4 LOC108264393 coding downstream 600882 24339635 ~ 24349296 (+)
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G104325 NA non-coding downstream 836739 24575492 ~ 24634405 (+)
G104429 NA non-coding downstream 1023889 24762642 ~ 24764112 (+)
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serp1 NA other upstream 154165 23572551 ~ 23575713 (+)
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LOC113526422 p2ry6 other upstream 746279 22942709 ~ 22983599 (+)
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G104781 NA other downstream 1556146 25294899 ~ 25315213 (+)
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G105898 LOC108264731 other downstream 3472636 27211389 ~ 27214570 (+)

Expression



Co-expression Network