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Basic Information

Item Value
gene id si:dkey-12e7.1
gene name si:dkey-12e7.1,LOC108264421,LOC108427511,LOC103035474,LOC107596938,LOC107583743,LOC107738678,LOC105904526
gene type coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047600.1
NCBI id CM018546.1
chromosome length 31307711
location 14670313 ~ 14673362 (-)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

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>XM_034304965.1
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Function

symbol description
si:dkey-12e7.1 Predicted to be involved in SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process and protein polyubiquitination. Predicted to be part of SCF ubiquitin ligase complex.

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC104959053

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_034304965.1 False 2454 mRNA 0.41 2 14670313 14673239

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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dennd11 kiaa1147,LOC107738692,LOC107686315 other downstream 323305 14335936 ~ 14347008 (-)
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akt2 akt2,LOC108264340,LOC107711004,LOC107557843,LOC107692744,LOC107714435,LOC107572728 other upstream 5722504 20395866 ~ 20416574 (-)
G102566 NA other upstream 6280240 20953602 ~ 20966910 (-)

Expression


Co-expression Network