fam168a (fam168a,LOC108264593,LOC107594362,LOC107600264)


Basic Information

Item Value
gene id fam168a
gene name fam168a,LOC108264593,LOC107594362,LOC107600264
gene type coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047600.1
NCBI id CM018546.1
chromosome length 31307711
location 22883271 ~ 22934025 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>XM_034305146.1
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Function

symbol description
fam168a Predicted to be involved in positive regulation of base-excision repair. Orthologous to human FAM168A (family with sequence similarity 168 member A).

NR:

description
PREDICTED: protein FAM168A isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_034305146.1 False 6668 mRNA 0.39 7 22883271 22934025
XM_034305148.1 True 6755 mRNA 0.39 8 22883294 22934025

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC113526346 wdr49,LOC108264614 coding upstream 1149700 21689428 ~ 21733571 (+)
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G103830 NA other downstream 681078 23615103 ~ 23629723 (+)

Expression


Co-expression Network